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動的コンビナトリアル化学によるDNA高次構造認識分子の検索

研究課題

研究課題/領域番号 18659004
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 化学系薬学
研究機関九州大学

研究代表者

佐々木 茂貴  九州大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (10170672)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
2007年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2006年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
キーワード動的コンビナトリアル化学 / DNA / RNA / マイナーグルーブ / チオールージスルフィド平衡 / 平衡シフト / ヘキスト / グルタチオン / チオール-ジスルフィド平衡
研究概要

本研究の目的 遺伝情報分子(DNAおよびRNA)に配列特異的に結合する分子は、ゲノム機能解析に重要なツールとなるばかりでなく、治療薬としての発展性を秘めているため、最近とくに注目されている。高次構造のDNAあるいはRNAに対して特異的に結合する分子は、論理的な分子設計が困難なため、本研究では、動的コンビナトリアル化学の手法を適応した新しい検索法を検討することにした。この手法では平衡に達している系に標的分子を入れ錯体形成によって平衡を移動させ、自動的に選択的結合分子を得ようとするものである。一般のコンビナトリアル化学に比べて、候補化合物をあらかじめ合成する必要がない利点があるものの、反応系が極めて複雑になる欠点がある。本研究課題ではDNA高次構造を認識する低分子の開発を目的に、チオールージスルフィド平衡反応を活用した効率的検索を検討する。またそのほか水溶性触媒によるメタセシス反応を利用した動的コンビナトリアル化学についても検討する。
平成19年度の研究成果 合成:前年度までに、DNA結合ユニットとしてA3T3領域に選択的な結合能を有するHoechst33258骨格のマイナーグルーブ接触面と反対側にカルボキシル基を導入した分子の合成法を確立した。平成19年度はこれに枝分かれスペーサー構造を結合させ、スペーサーの末端に銅イオンとの錯体形成ユニットとしてビピリジンを結合させた。ダイナミックコンビナトリアル化学:前年度までに行っていたジスルフィド交換反応によるダイナミックコンビナトリアル化学に代わり、金属イオン結合を解した集積反応を検討した。その結果、ヘキスト骨格にスペーサーを介して導入したビピリジン部分は分子内で銅イオンと錯体形成することなく、分子間の集積に作用できることを確認し、動的認識の可能性を確立した。本年度は、更なるDNAを鋳型とする協奏的認識分子の開発に展開できる重要な成果を得た。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] A New Copper(II)Complex as an Efficient Catalyst of Luminol Chemiluminescence2007

    • 著者名/発表者名
      Uzu T., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Organic Letters 9, No.21

      ページ: 4383-4386

    • NAID

      130006996108

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Specific Fluorescent Probe for 8-Oxoguanosine2007

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa O., Ono S., Li Z., Tsujimoto A., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition 46, No.24

      ページ: 4500-4503

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Equilibrium shift by target DNA substrates for determination of DNA binding ligands2007

    • 著者名/発表者名
      Tsujita S., Tanada M., Kataoka T., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Bioorganic&Medicinal Chemistry Letters 17

      ページ: 68-72

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Specific Fluorescent Probe for 8-Oxoguanosine2007

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa O., Ono S., Li Z., Tsujimoto A., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed 46(In press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Equilibrium shift by target DNA substrates for determination of DNA binding ligands2007

    • 著者名/発表者名
      Tsujita S., Tanada M., Kataoka T., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett. 17

      ページ: 68-72

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Novel drug releasing system triggered by hybridization with target sequence2006

    • 著者名/発表者名
      Nakayama S., Nagatsugi F., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser 50

      ページ: 143-144

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Recognition of DNA with assembly of minor groove binders mediated by metal complexation2006

    • 著者名/発表者名
      Kataoka T., Tanada M., Onishi I., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 50

      ページ: 161-162

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Effects of the modified aromatic ring of WNA on stability of triplex DNA2006

    • 著者名/発表者名
      Aoki E., Taniguchi Y., Togo M., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 50

      ページ: 185-186

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Cu^<2+>-Mediated Assembly of the Minor Groove Binders on the DNA Template with Sequence Selectivity2006

    • 著者名/発表者名
      Tanada M., Tsujita S., Kataoka T., Sasaki S.
    • 雑誌名

      Organic Lett. 8

      ページ: 2475-2478

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] DNAの高次構造の認識をめざした新規リガンドの開発2007

    • 著者名/発表者名
      佐々木 英哲、John Brazier、大西 一平、渡辺 詩乃、佐々木 茂貴
    • 学会等名
      第24回九州支部大会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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