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転移因子LINEの転移・増幅に関わる宿主因子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 18770004
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 遺伝・ゲノム動態
研究機関東京工業大学

研究代表者

梶川 正樹  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 講師 (90361766)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2007年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2006年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワード転移因子 / レトロトランスポゾン / レトロポゾン / 宿主因子 / DNA損傷修復 / NHEJ / 逆転写酵素
研究概要

転移因子Long Interspersed Element (LINE)は、様々な真核生物のゲノム中に広く存在し、我々真核生物のゲノム進化に大きな影響を及ぼしていることが知られている。たとえば、ヒトゲノムDNA中にはおよそ85万コピーの転移因子LINE配列が存在し、ヒトゲノムの約20%を構成している。 LINEがいかにしてこのように莫大なコピー数を獲得することができたのか、その転移・増幅機構についてはいまだ多くのなぞが残されている。 LINEの転移・増幅には、自身のコードするタンパク質(LINEタンパク質)と宿主のコードするタンパク質(宿主タンパク質)がかかわると考えられている。 LINE転移におけるLINEタンパク質の機能解析は進められているが、LINE転移における宿主タンパク質の役割はほとんど解析されておらず、LINE転移にどのような宿主タンパク質が係わるのか明らかにされていない。私は、LINE転移にかかわる宿主タンパク質を同定するため、ニワトリDT40細胞内でLINE転移を検出する実験系を構築した。DT40細胞の様々な遺伝子欠損株を用いてLINEの転移頻度を測定することにより、宿主細胞のDNA修復系、特に非相同末端結合経路(NHEJ)に係わる宿主タンパク質がLINE転移に係わることを発見した。また、NHEJ欠損細胞株内でのLINE転移の解析により、NHEJ修復系が、LINE配列5'末端と宿主ゲノムの連結に関わることを見い出した。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] A new system for analyzing LINE retrotransposition in the chicken DT 40 cell line widely used for reverse genetics.2007

    • 著者名/発表者名
      Honda, Ichiyanagi, Suzuki, Ono, Koyama, Kajikawa, Okada
    • 雑誌名

      Gene 395

      ページ: 116-124

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel sex pheromone desaturases in the genomes of corn borers generated through gene duplication and retroposon fusion.2007

    • 著者名/発表者名
      Xue, Rooney, Kajikawa, Okada, Roelofs
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      ページ: 4467-4472

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Functional splice sites in a zebrafish LINE and their influence on zebrafish gene expression.2007

    • 著者名/発表者名
      Tamura, Kiajikawa, Okada
    • 雑誌名

      Gene 390

      ページ: 221-231

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Novel retrotransposon analysis reveals multiple mobility pathways dictated by hosts.2007

    • 著者名/発表者名
      Ichiyanagi, Nakajima, Kajikawa, Okada
    • 雑誌名

      Genome Res. 17

      ページ: 33-41

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Solution structure and functional importance of a conserved RNA hairpin of eel LINE UnaL2.2006

    • 著者名/発表者名
      Nomura, Kajikawa, Baba, Nakazato, Imai, Sakamoto, Okada, Kawai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34

      ページ: 5184-5193

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Reconstruction of TPRT in vitro using the zebrafish LINE ZfL2-l2007

    • 著者名/発表者名
      Kajikawa>, Matsui Norihiro Okada
    • 学会等名
      2007 FASEB Summer Research Conferences (Mobile Elements in Mammalian Genomes)
    • 発表場所
      Tucson, Arizona
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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