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AFLP解析を用いた東北地方高山帯フロラにおけるボトルネック効果の検証

研究課題

研究課題/領域番号 18770067
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物多様性・分類
研究機関熊本大学 (2007-2008)
首都大学東京 (2006)

研究代表者

藤井 紀行  熊本大学, 大学院・自然科学研究科, 准教授 (40305412)

研究期間 (年度) 2006 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,910千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 210千円)
2008年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2007年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2006年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードマイクロサテライト解析 / 日本産高山植物 / 集団遺伝学的解析 / 遺伝的多様性評価 / 高山植物 / フロラ / 東北地方 / ボトルネック効果 / 遺伝的多様性 / 分布変遷過程 / 系統地理学 / マイクロサテライト / 葉緑体DNA
研究概要

日本列島の東北地方高山帯におけるボトルネック効果や創始者効果といった過去の集団サイズの縮小・拡大を推定するために、エゾシオガマ(Pedicularis yezoensis,ゴマノハグサ科)のマイクロサテライトマーカーの開発を行い、集団間の遺伝的多様性の比較を行った。また予備的な結果ではあるが、東北集団が北海道集団、本州中部集団に比べて低い傾向が見られた。この結果は、東北地方の集団において過去に創始者効果、もしくはボトルネック効果が働いたことを支持するものである。

報告書

(4件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (40件)

すべて 2009 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (19件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (16件) 図書 (3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Molecular evolution of phytochromes in Cardamine nipponica (Brassicaceae) suggests the involvement of PHYE in local adaptation2009

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H.
    • 雑誌名

      Genetics (accepted)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Survival and genetic divergence of an arctic-alpine plant, Diapensia lapponica subsp. obovata(Fr. Schm.) Hulten(Diapensiaceae), in the high mountains of central Japan during climatic oscillations2008

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, H. Setoguchi
    • 雑誌名

      Plant Systematics and Evolution 272

      ページ: 197-210

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Consistent geographic structure among multiple nuclear sequences and cpDNA polymorphisms of Cardamine nipponica Franch2008

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, H. Setoguchi
    • 雑誌名

      et Savat.(Brassicaceae). Molecular Ecology 17

      ページ: 3178-3188

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Post-glacial range fragmentation is responsible for the current distribution of Potentilla matsumurae Th. Wolf (Rosaceae) in the Japanese archipelago2008

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, and H. Setoguchi
    • 雑誌名

      Journal of Biogeography 35

      ページ: 791-800

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本産高山植物における本州中部地域の系統地理学的重要性2008

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 雑誌名

      第一回日本植物分類学会奨励賞受賞記念論文 8

      ページ: 5-14

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Survival and genetic divergence of an arctic-alpine plant, Diapensia lapponica subsp. obovata (Fr. Schm.) Multen (Diapensiaceae), in the high mountains of central Japan during climatic oscillations2008

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H.
    • 雑誌名

      Plant Systematics and Evolution 272

      ページ: 197-210

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Consistent geographic structure among multiple nuclear sequences and cpDNA polymorphisms of Cardamine nipponica Franch. et Savat. (Brassicaceae)2008

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H.
    • 雑誌名

      Molecular Ecology 17

      ページ: 3178-3188

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Post-glacial range fragmentation is responsible for the current distribution of Potentilla matsumurae Th. Wolf (Rosaceae) in the Japanese archipelago2008

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H.
    • 雑誌名

      Journal of Biogeography 35

      ページ: 791-800

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本産高山植物における本州中部地域の系統地理学的重要性2008

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 雑誌名

      Bunrui 8

      ページ: 5-14

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Chloroplast DNA phylogeography of Pedicularis ser. Gloriosae (Orobanchaceae) in Japan2007

    • 著者名/発表者名
      Fujii, N
    • 雑誌名

      J. Plant Res 120

      ページ: 491-500

    • NAID

      10019560102

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chloroplast DNA phylogeography of Pedicularis ser. Gloriosae (Orobanchaceae) in Japan2007

    • 著者名/発表者名
      Fujii, N.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research 120

      ページ: 491-500

    • NAID

      10019560102

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Refugia of Potentilla matsumurae (Rosaceae) located at high mountains in the Japanese archipelago2006

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, and H. Setoguchi
    • 雑誌名

      Molecular Ecology 15

      ページ: 3731-3740

    • NAID

      10019309556

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distribution of chloroplast DNA haplotypes in the contact zone of Fagus crenata in the southwest of Kanto District, Japan2006

    • 著者名/発表者名
      Kobashi, S., N. Fujii, A. Nojima, N. Hori
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research 119

      ページ: 265-269

    • NAID

      10019164936

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Phylogeography of Japanese alpine plants : biogeographic importance of alpine region of central Honshu in Japan2006

    • 著者名/発表者名
      Fujii, N. and K. Senni
    • 雑誌名

      Taxon 55

      ページ: 43-52

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] サハリン植物紀行2006

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 雑誌名

      分類 6

      ページ: 151-155

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] ブナの地理的変異研究と今後の展望(Areview of studies on geographical variation in Fagus crenata and future prospects)2006

    • 著者名/発表者名
      小橋寿美子・藤井紀行・岡秀一
    • 雑誌名

      長野県植物研究会誌 40

      ページ: 207-213

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Phylogeography of Japanese alpine plants : biogeographic importance of alpine region of central Honshu in Japan2006

    • 著者名/発表者名
      Fujii, N., K.Senni
    • 雑誌名

      Taxon 55

      ページ: 43-52

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Refugia of Potentilla matsumurae (Rosaceae) located at high mountains in the Japanese archipelago2006

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., K.Senni, N.Fujii, H.Setoguchi
    • 雑誌名

      Molecular Ecology 15

      ページ: 3731-3740

    • NAID

      10019309556

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Distribution of chloroplast DNA haplotypes in the contact zone of Fagus crenata in the southwest of Kanto District, Japan2006

    • 著者名/発表者名
      Kobashi, S., N.Fujii, A.Nojima, N.Hori
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research 119

      ページ: 265-269

    • NAID

      10019164936

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] 阿蘇山系における絶滅危惧植物の現状と保全活動2009

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行・瀬井純雄
    • 学会等名
      第56回日本生態学会大会
    • 発表場所
      岩手県立大学
    • 年月日
      2009-03-19
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 分子データからみた東北地方の高山フロラの成立過程2009

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 学会等名
      日本植物分類学会第8回大会公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京エレクトロンホール宮城
    • 年月日
      2009-03-15
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 分子データからみた東北地方の高山帯フロラの成立過程2009

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 学会等名
      日本植物分類学会第8回大会公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京エレクトロンホール宮城
    • 年月日
      2009-03-15
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Chloroplast DNA phylogeography of Pedicularis resupinata (Scrophulariaceae) around the Japanese Islands2008

    • 著者名/発表者名
      Fujii, N.
    • 学会等名
      International symposium on East Asian plant diversity and conservation
    • 発表場所
      Hokkaido University, Sapporo, Japan
    • 年月日
      2008-08-02
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] ミヤマタネツケバナ(Cardamine nipponica)のPHYE光センサードメインにおける南北間での適応分化2008

    • 著者名/発表者名
      池田啓・藤井紀行・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第72回大会
    • 発表場所
      高知大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体SNPによるブナの系統地理学的な研究-分布域全体をほぼ網羅したハプロタイプ地図の作成2008

    • 著者名/発表者名
      高橋誠・原正利・藤井紀行、以下24名省略
    • 学会等名
      日本生態学会第55回大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体DNAを用いたハンカイシオガマ列植物(ゴマノハグサ科)の分子系統地理学的解析2008

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 学会等名
      日本植物分類学会第7回大会
    • 発表場所
      首都大学東京
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] イワタバコ類の種分類学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      宮なろう・藤井紀行・桜澤裕樹・村上哲明
    • 学会等名
      日本植物分類学会第7回大会
    • 発表場所
      首都大学東京
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 複数遺伝子座からみたミヤマタネツケバナ(Cardamine nipponica)の分断分布と進化史2008

    • 著者名/発表者名
      池田啓・仙仁径・藤井紀行・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物分類学会第7回大会
    • 発表場所
      首都大学東京
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナの地理的変異と広葉樹種苗2008

    • 著者名/発表者名
      高橋誠・平岡宏一・後藤晋・原正利・藤井紀行、以下4名省略
    • 学会等名
      第120回日本森林学会大会
    • 発表場所
      京都大学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] アブラナ科ミヤマタネツケバナの遺伝構造と地理的構造2007

    • 著者名/発表者名
      池田啓・仙仁径・藤井紀行・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第71回大会
    • 発表場所
      東京理科大学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産高山植物の比較系統地理2007

    • 著者名/発表者名
      池田啓・仙仁径・藤井紀行・清水健太郎・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本生態学会大54回大会
    • 発表場所
      愛媛大学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 本州中部産ヨツバシオガマの分類学的再検討2007

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行・植田邦彦・綿野泰行
    • 学会等名
      日本植物分類学会第6回大会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産高山植物における本州中部地域の系統地理学的重要性(奨励賞受賞講演)2007

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 学会等名
      日本植物分類学会第6回大会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 高山植物ミヤマキンバイ(バラ科)の系統地理2006

    • 著者名/発表者名
      池田啓・仙仁径・藤井紀行・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第70回大会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産高山植物エゾシオガマの葉緑体DNAの地理的変異2006

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行・仙仁径・菅原敬・若林三千男
    • 学会等名
      日本植物学会第70回大会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] 進化し続ける植物たち(葛西奈津子著・日本植物生理学会監修)のトピックとして2008

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 出版者
      日本の高山植物を見つめて
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] 日本の高山植物を見つめて.進化し続ける植物たち(葛西奈津子著・日本植物生理学会監修)のトピックとして2008

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] 「進化し続ける植物たち」の中のトピック欄として「日本の高山植物を見つめて」2008

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考] ホームページ等

    • URL

      http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/bio/staff/fujii/Fujii_HP/index.html

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/bio/staff/fujii/Fujii_HP/index.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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