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アミロプラストの分化・糖代謝の機序解明を目指したデンプン生合成制御因子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 18780067
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用生物化学
研究機関北海道大学

研究代表者

濱田 茂樹  北海道大学, 大学院・農学研究院, 助教 (90418608)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2007年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2006年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワードイネ培養細胞 / デンプン生合成 / スクロース誘導 / プロテオーム / リン酸化タンパク質
研究概要

本研究では,タンパク質のリン酸化による種子貯蔵物質蓄積の制御に着目し、イネ登熟種子におけるリン酸化タンパク質の網羅的解析および、そのタンパク質の機能解析を目的とした。
イネ登熟種子より得られた粗抽出液を陰イオン交換および疎水クロマトグラフィーにより部分精製を行なった。得られた溶出画分を一次元および二次元電気泳動に供し、泳動後のゲルをPro-Q Diamond Gelstainを用いて染色することで、リン酸化タンパク質を検出した。得られたタンパク質バンド(スポット)は、トリプシンによるゲル内消化後、MALDI/TOF-MS解析により同定された。その結果、nucleoside diphosphate kinase 1やRNA binding protein 120、Heat shock protein 82(Hsp82)など7種類のリン酸化タンパク質が同定され、これらのタンパク質がリン酸化により機能制御を受けていることが示唆された。
同定されたリン酸化タンパク質の中から、登熟種子におけるタンパク質の存在量やリン酸化度の高さから、特にHsp82に注目した。Hsp82はレトロトランスポゾンによる遺伝子破壊株が存在し、その種子は低稔性を示すことが知られており、種子形成に重要なタンパク質であると予想された。Hsp82をコードするcDNAは、登熟種子から抽出したmRNAの逆転写産物を鋳型としたPCRにより単離した。Hsp82のアミノ酸配列に基づいたドメイン検索からN末側にはATP加水分解に必要なH^+ATPase領域、C末側にはシグナル伝達タンパク質の機能と安定性を調節する分子シャペロンHsp90領域が確認された。また、同定したHsp82とGFPの融合タンパク質を35Sプロモーターで発現するバイナリーベクターを作成し、パーティクルボンバードメント法によりタマネギ表皮細胞内に導入し、細胞内局在を観察した。
その結果、細胞質で強い蛍光が観察されたことから、本Hsp82は細胞質において機能していることが示唆された。RT-PCRを用いた発現特性の解析から、本遺伝子が種子のみならず、葉やカルスにおいても発現することが確認された。現在、アンチセンス体の作製やリン酸化部位の同定を試みている。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] The N-terminal region of the starch-branching enzyme from Phaseolus vulgaris L. is essential for optimal catalysis and structural stability.2007

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Hamada, et. al.
    • 雑誌名

      Phytochemistry 68

      ページ: 1367-1375

    • NAID

      120000967623

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Differential chain-length specificities of two isoamylase-type starch-debranching enzyme from developing seeds of kidney bean.2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshinori Takashima, et. al.
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 71(9)

      ページ: 2308-2312

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic characterization of starch synthase III from kidney bean (Phaseolus vulgaris L.)2007

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Senoura, et. al.
    • 雑誌名

      FEBS Journal 274

      ページ: 4550-4560

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Catalytic implications of the higher plant ADP-glucose pyrophosphorylase large subunit.2007

    • 著者名/発表者名
      Seon-Kap Hwang et al.
    • 雑誌名

      Phytochemistry 68

      ページ: 464-477

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The N-terminal region of the starch-branching enzyme from Phaseolus vulgaris L. is essential for optimal catalysis and structural stability.2007

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Hamada et al.
    • 雑誌名

      Phytochemistry (In Press)

    • NAID

      120000967623

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] ATP binding site in the plant ADP-glucose pyrophosphorylase large subunit.2006

    • 著者名/発表者名
      Seon-Kap Hwang et al.
    • 雑誌名

      FEBS Letters 580

      ページ: 6741-6748

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] イネADP-glucose pyrophosphorylaseアイソザイムの発現特性と酵素特性2007

    • 著者名/発表者名
      西村祐美
    • 学会等名
      日本農芸化学会北海道支部2007年度秋季学術講演会
    • 発表場所
      網走 (東京農業大学)
    • 年月日
      2007-11-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ジャガイモ塊茎ADP-glucose pyrophosphorylase 調節サブユニットへのATP結合が酵素活性に与える影響2007

    • 著者名/発表者名
      和久田真司
    • 学会等名
      日本農芸化学会北海道支部2007年度秋季学術講演会
    • 発表場所
      網走 (東京農業大学)
    • 年月日
      2007-11-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] インゲンマメ登熟種子由来イソアミラーゼアイソザイムの酵素特性2007

    • 著者名/発表者名
      瀬野浦武志
    • 学会等名
      日本農芸化学会北海道支部2007年度秋季学術講演会
    • 発表場所
      網走 (東京農業大学)
    • 年月日
      2007-11-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] インゲンマメ登熟種子由来プロテインキナーゼのクローニングおよび発現特性2007

    • 著者名/発表者名
      清木慈子
    • 学会等名
      日本農芸化学会北海道支部2007年度秋季学術講演会
    • 発表場所
      網走 (東京農業大学)
    • 年月日
      2007-11-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 植物ADP-glucose pyrophosphorylase調節サブユニットヘのATPの結合2007

    • 著者名/発表者名
      和久田真司
    • 学会等名
      日本応用糖質学会 平成19年度大会
    • 発表場所
      藤沢(日本大学)
    • 年月日
      2007-08-29
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] イネ培養細胞におけるスクロース誘導タンパク質の同定および発現解析2007

    • 著者名/発表者名
      濱田茂樹
    • 学会等名
      日本応用糖質学会 平成19年度大会
    • 発表場所
      藤沢 (日本大学)
    • 年月日
      2007-08-29
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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