分子動力学的手法を用いた生体高分子に関する研究

• 研究課題/領域番号: 18790035
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 物理系薬学
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 平野 秀典 慶應義塾大学, 医学部, 助教 (50360631)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 3,350千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 150千円); 2008年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2007年度: 600千円 (直接経費: 600千円); 2006年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
• キーワード: 分子動力学計算 / 膜 / 膜タンパク質 / アクアポリン / 分子動力学的手法 / 生体高分子 / 分子動力学

研究概要

分子動力学的手法により、膜および膜タンパクの構造ダイナミクスに関する研究を行った。主に水チャネルであるアクアポリンを対象に水銀による水分子透過阻害機構解明を行うことにより、水分子透過制御機構に関する研究を行った。本研究の成果は、膜および膜タンパク質に興味のある生化学研究者および理論的研究者が抱いている、膜および膜タンパク質に関する謎の部分の解明役立つことを期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Mercury chloride decreases the water permeability of aquaporin-4-reconstituted proteoliposomes (2008)
  • 著者名/発表者名: Yukutake, Y., Tsuji, S., Hirano, Y., Adachi, T., Takahashi, T., Fujihara, T., Agre, P., Yasui, M., and Suematsu, M
  • 雑誌名: Biol. Cell 100 ページ: 355-363
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mercury chloride decreases the water permeability ofaquaporin-4-reconstituted proteoliposomes (2008)
  • 著者名/発表者名: Yukutake, Hirano, et. al.
  • 雑誌名: Biol. Cell (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential Membrane Packing of Stereoisomers of Bis(monoacylglycero)phosphate (2006)
  • 著者名/発表者名: Hayakawa, T., Hirano, Y., Makino, A., Michaud, S., Lagarde, M., Pegeaux, J.-F., Doutheau, A., Ito, K., Fujisawa, T., Takahashi, H., and Kobayashi, T
  • 雑誌名: Biochemistry 45 ページ: 9198-9209
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential Membrane Packing of Stereoisomers of Bis(monoacylglycero)phosphate (2006)
  • 著者名/発表者名: Hayakawa, Hirano et al.
  • 雑誌名: Biochemistry 45 ページ: 9198-9209
• [学会発表] 分子動力学的手法を用いたアクアポリンに関する研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 日本薬学会第129年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] AQP1の選択的分子透過機構に関する研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 第82回日本薬理学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-03-16
• [学会発表] 分子動力学的手法を用いたアクアポリンの水透過性に関する研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 日本生物物理学会第46回年会
  • 発表場所: 博多
  • 年月日: 2008-12-05
• [学会発表] 水銀によるアクアポリンの水透過阻害メ機構の解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 第22回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2008-11-18
• [学会発表] 水銀によるアクアポリンの水透過阻害機構の解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 平野, 他3名
  • 学会等名: 第22回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2008-11-18
• [学会発表] Water exclusion mechanism of aquaporin-1 by Molecular Dynamics simulations (2008)
  • 著者名/発表者名: Hirano, Y., Yasuoka, K., Suematsu, M., and Yasui, M
  • 学会等名: INTERNATIONAL WORKSHOP MSSMBS'08 "Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences"
  • 発表場所: Dubna (Russia)
  • 年月日: 2008-09-11
• [学会発表] 分子動力学的手法を用いたアクアポリンに関する研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 日本薬学会第128年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-03-26
• [学会発表] 水銀によるアクアポリンの水透過阻害メカニズムに関する研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 第81回日本薬理学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-03-19
• [学会発表] 分子動力学的手法を用いたアクアポリンに関する研究 (2007)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 日本生物物理学会第45回年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-12-21
• [学会発表] 分子動力学的手法を用いたアクアポリンに関する研究 (2007)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 第21回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 金沢
  • 年月日: 2007-11-27
• [学会発表] 分子動力学的手法を用いたアクアポリンに関する研究 (2007)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 第117回日本薬理学会関東部会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-10-06
• [学会発表] Water exclusion mechanism of aquaporin-1 by Molecular Dynamics Simulation (2007)
  • 著者名/発表者名: Hirano, Y., Yasuoka, K., Suematsu, M., and Yasui, M
  • 学会等名: The 27th Anniversary International CBI Conference
  • 発表場所: Hiroshima
  • 年月日: 2007-10-04
• [学会発表] Water exclusion mechanism of aquaporin-1 by MolecularDynamics Simulation (2007)
  • 著者名/発表者名: 平野 他3名
  • 学会等名: The 27th Anniversary International CBIConference
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 2007-10-04
• [学会発表] Water Exclusion Mechanism of Aquaporin-1 by MD simulations (2007)
  • 著者名/発表者名: Hirano, Y., Yasuoka, K., Suematsu, M., and Yasui, M
  • 学会等名: The 5th International Conference of Aquaporin
  • 発表場所: Nara
  • 年月日: 2007-06-13
• [学会発表] Water Exclusion Mechanism of Aquaporin-1 by MDsimulations (2007)
  • 著者名/発表者名: 平野 他3名
  • 学会等名: The 5th International Conference of Aquaporin
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 2007-06-13
• [学会発表] 計算科学的手法を用いたアクアポリンに関する研究 (2007)
  • 著者名/発表者名: 平野秀典, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
  • 学会等名: 日本薬学会127年会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2007-03-29
• [学会発表] Investigation of The Structure-Function Relationship of Importin-β by Molecular Dynamics simulations (2006)
  • 著者名/発表者名: Hirano, Y., Okimoto, N., Suenaga, A., Taiji, M., Imamoto, N., Yasui, M., and Ebisuzaki, T.
  • 学会等名: 5th East Asian Biophysics Symposium & 44th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2006
  • 発表場所: Okinawa
  • 年月日: 2006-11-13
• [学会発表] Molecular Dynamics Simulations of Water Channel: Aquaporin (2006)
  • 著者名/発表者名: Hirano, Y., Yasuoka, K., Makita, N., Yasui, M., and Suematsu, M
  • 学会等名: Keio Aquaporin Mini Symposium
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2006-10-31
• [学会発表] Molecular Dynamics Simulation of Aquaporin (2006)
  • 著者名/発表者名: Hirano, Y., Yasuoka, K., Suematsu, M., and Yasui, M
  • 学会等名: The 21 Century COE Young Scientist Workshop 2006 in Shonan
  • 発表場所: Hayama
  • 年月日: 2006-09-18
• [備考] 受賞 Hirano, Y. "Award for the Excellent Poster", The 27th Anniversary International CBI Conference, October, 2007.