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植物におけるmRNA前駆体スプライシング制御機構とその生理的意義の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18870028
研究種目

若手研究(スタートアップ)

配分区分補助金
研究分野 植物生理・分子
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

大谷 美沙都  独立行政法人理化学研究所, 形態制御研究チーム, 基礎科学特別研究員 (60435633)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
2,450千円 (直接経費: 2,450千円)
2007年度: 1,280千円 (直接経費: 1,280千円)
2006年度: 1,170千円 (直接経費: 1,170千円)
キーワードSRD2 / RID1 / mRNA前駆体スプライシング活性 / 分化全能性 / 脱分化 / 分裂組織形成 / snRNA
研究概要

本研究では、植物におけるmRNA前駆体スプライシングの動的制御機構とその生理的意義の解明を目標に解析を行っている。主な材料は脱分化、分裂組織形成に温度感受性を示すシロイヌナズナ突然変異体、srd2およびridlである。これまでにSRD2はsnRNA(small nuclear RNA)の転写活性化因子であり、RIDl遺伝子はRNAヘリカーゼをコードしていることを明らかにしてきた。
まず、両変異体でみられる奇形側根形成に関して詳細な解析を行った。野生型におけるsnRNA量変動を調べたところ、初期の段階では原基の全細胞の核に多量のsnRNAが検出されたが、側根原基の形成終了前後に蓄積量が一旦大きく低下し、その後再び上昇するという興味深いパターンが見出された。srd2変異体では側根形成関連遺伝子の発現様式の撹乱とともに、snRNA量の顕著な低下が観察され、結果として正常な分裂組織を欠いた瘤状側根形成が観察された。以上は、分裂組織の構築・確立にはSRD2に依存したsnRNAの蓄積が重要であることを示しており、rid1変異体も同様の表現型を示すことから、snRNAとRID1の共通分子機能であるスプライシングの活性制御が分裂組織形成には不可欠であると考えられる。
また、胚軸脱分化過程を対象としたタイリングアレイを行い、両変異が及ぼす遺伝子発現、特にスプライシングパターンへの影響の網羅的検出を試みた。これまでにいくつかの遺伝子についてスプライシング異常を確認している。スプライシング活性可視化のためには、様々なイントロン配列を導入した蛍光タンパク質遺伝子を複数作製し、形質転換植物体の作出を行った。さらにこれらと変異体の交配を進め、スプライシング活性異常をin vivo検出するシステム構築を行った。以上は今後の研究の基盤となる成果であり、これらを利用したさらなる解析を予定している。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Differential requirement for the function of SRD2,an snRNA transcription activator,in various stages of plant develoment2008

    • 著者名/発表者名
      Misato Ohtani, et. al.
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology 66

      ページ: 303-314

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Differential requirement for the function of SRD2,an snRNA transcription activator,in various stages of plant development2007

    • 著者名/発表者名
      Misato Ohtani, et. al.
    • 学会等名
      18th International Conference on Arabidopsis Research
    • 発表場所
      Beijing
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナの発生・成長におけるsnRNA転写活性化の重要性2007

    • 著者名/発表者名
      大谷 美沙都, 他
    • 学会等名
      日本植物学会第71回大会
    • 発表場所
      野田
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 脱分化と分裂組織新形成に関わるシロイヌナズナRID1遺伝子の解析2007

    • 著者名/発表者名
      大谷 美沙都, 他
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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