| 研究課題/領域番号 |
18F18100
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| 研究種目 |
特別研究員奨励費
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 外国 |
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| 研究分野 |
ウイルス学
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| 研究機関 | 国立研究開発法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
間 陽子 国立研究開発法人理化学研究所, 科技ハブ産連本部, 研究員 (50182994)
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| 研究分担者 |
MAIREPATI PALATI 国立研究開発法人理化学研究所, 科技ハブ産連本部, 外国人特別研究員
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-25 – 2020-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2019年度)
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| 配分額 *注記 |
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2019年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2018年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
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| キーワード | BLV / Sensitive PCR / NGS / DNA-Capture-Seq analysis / LM PCR Seq analysis / ヒト由来細胞株 / ヒト血液 / ヒト乳癌組織 / Bovine leukemia virus / human Blood / human cancer tissue / DNA extraction / PCR amplification / Next-generation sequencing / BLV-human hybrid genome / BLV integration site |
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| 研究実績の概要 |
We extracted DNA from 199 human cell lines and from 100 human blood and 27 breast cancer tissues sample. Samples were subjected to detect BLV presence in human by sensitive PCR. PCR result showed that all human cell lines were BLV negative. We observed BLV gene specific bands in 6 blood and 5 cancer tissue sample. To confirm the PCR result, we performed two different high throughput sequencing method, namely viral DNA-Capture-Seq and LM PCR library enhancement NGS. Both of the high throughput sequencing failed to detect any single read mapped to BLV sequencing. BLV detection results indicate that there is no evidence for BLV-specific sequences. The positive result in blood and cancer tissue samples might be caused by the cross contamination during the process of performing the experiment.
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| 現在までの達成度 (段落) |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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