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ペプチドセレクションによる酵素ミミック創薬のための戦略

研究課題

研究課題/領域番号 18F18727
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 生体関連化学
研究機関東京大学

研究代表者

菅 裕明  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (00361668)

研究分担者 TSIAMANTAS CHRISTOS  東京大学, 大学院理学系研究科, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2018-07-25 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2018年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードFIT system / Foldamers / Macrocyclic peptides
研究実績の概要

This work has harvested the potential of flexizymes (artificial aminoacylation ribozymes) coupled to an in vitro translation system (the “flexible” in vitro translation system, FIT), led to the ribosomal incorporation of the largest and bulkiest residues to date. Briefly, foldamers -molecules with a strong tendency to adopt a folded conformation- composed of aromatic oligoamides have been recently proven capable of initiating translation, yielding the first-of-their-kind foldamer-peptide-hybrids. In our current work, we expanded the repertoire of foldamer functionalities and have demonstrated that side-chain modification of the helical structures grants access to previously inaccessible chemical and structural space. The incorporation of both the bulkiest and largest single residues that have been introduced by the ribosome has been demonstrated. Additionally, intrigued by the ribosomal tolerance towards aromatic oligoamides during translation initiation, we advanced our investigations and explored the possibility of incorporating these abiotic molecules as appendages during translation elongation. Our results indicated that the incorporation of an amino acid residue with a foldamer on the side-chain, as long as a heptapeptide, is feasible. It demonstrates for the first time the tolerance of the ribosome towards residues of that size and expands the current understanding on the limitations of the translational machinery. The above studies have paved the way towards the introduction of foldamers into mRNA display for the discovery of functional foldamer-peptide hybrids.

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(1件)
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2018 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Ludwig Maximilian University of Munich(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] In vitro expression of genetically encoded non-standard peptides consisting of exotic amino acid building blocks.2018

    • 著者名/発表者名
      Hirose H, Tsiamantas C, Katoh T, Suga H.
    • 雑誌名

      Curr Opin Biotechnol. 2018 Nov 16;58:

      巻: 58 ページ: 28-36

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2018.10.012

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] In Vitro Selection of aromatic oligoamide foldamers2018

    • 著者名/発表者名
      Tsiamantas Christos
    • 学会等名
      Bordeaux Symposium on Foldamers
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Ribosomally synthesized foldamer-containing peptides2018

    • 著者名/発表者名
      Tsiamantas Christos
    • 学会等名
      4th International Conference on Circular Proteins and Peptides
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] In Vitro Translated Peptide-Foldamer Hybrid Macrocycles2018

    • 著者名/発表者名
      Tsiamantas Christos
    • 学会等名
      10th International Peptide Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 東京大学大学院理学系研究科化学専攻菅研究室ホームページ

    • URL

      https://www.chem.s.u-tokyo.ac.jp/users/bioorg/index.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-07-26   更新日: 2024-03-26  

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