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Determining sulfur isotope fractionation values of individual enzymes and how they evolve through time.

研究課題

研究課題/領域番号 18H01325
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分17050:地球生命科学関連
研究機関東京工業大学

研究代表者

McGlynn Shawn・E.  東京工業大学, 地球生命研究所, 准教授 (10751084)

研究分担者 上野 雄一郎  東京工業大学, 理学院, 教授 (90422542)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円)
2020年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2019年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2018年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワードenzyme mechanism / enzyme evolution / kinetic isotope effect / sulfate reduction / geobiology / microbial evolution / Earth-Life Science / geochemistry / sulfur isotopes / metabolic flux / energy metabolism / Earth history / history of life / enzyme kinetics / sequence evolution / Enzyme mechanism / Sulfate reduction
研究成果の概要

地球上で最も古い生命の記録は化学的なものである。生物は原子を固有の比率で使用するからである。生物学的な同位体比を示す元素の一つが硫黄である。本研究では、太古の地球上にどのような生物が存在し、硫黄同位体比に痕跡を残したのかに注目した。その結果、古代の硫黄同位体比の大部分をAPSレダクターゼと呼ばれる1つの酵素(化学反応を非生物的な反応よりも迅速に起こす生物学的な触媒)が担っていることが明らかになった。さらに、酵素反応の前進速度と後退速度が利用可能なエネルギー量に依存することから、古代生物の栄養状態を理解できることもわかった。本研究は、生化学や生命と古代地球を統合するものである。

研究成果の学術的意義や社会的意義

We found that the evolutionary history of sulfate respiration is complex, but probably not among the most ancient metabolisms on Earth. We determined that a single enzyme in the respiratory pathway appears to control the whole cell rate under certain conditions.

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 5件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 4件、 招待講演 8件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Ten years of collaborative progress in the Quest for Orthologs2021

    • 著者名/発表者名
      Linard Benjamin、Ebersberger Ingo、McGlynn Shawn E、Glover Natasha、Mochizuki Tomohiro、Patricio Mateus、Lecompte Odile、Nevers Yannis、Thomas Paul D、Gabaldon Toni、Sonnhammer Erik、Dessimoz Christophe、Uchiyama Ikuo、QFO Consortium
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: - 号: 8 ページ: 3033-3045

    • DOI

      10.1093/molbev/msab098

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A New Analysis of Archaea Bacteria Domain Separation: Variable Phylogenetic Distance and the Tempo of Early Evolution2020

    • 著者名/発表者名
      Berkemer Sarah J、McGlynn Shawn E
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 37 号: 8 ページ: 2332-2340

    • DOI

      10.1093/molbev/msaa089

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Hydrogenation reactions of carbon on Earth: Linking methane, margarine, and life2020

    • 著者名/発表者名
      McGlynn Shawn E.、Glass Jennifer B.、Johnson-Finn Kristin、Klein Frieder、Sanden Sebastian A.、Schrenk Matthew O.、Ueno Yuichiro、Vitale-Brovarone Alberto
    • 雑誌名

      American Mineralogist

      巻: 105 号: 5 ページ: 599-608

    • DOI

      10.2138/am-2020-6928ccbyncnd

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A Bifunctional Polyphosphate Kinase Driving the Regeneration of Nucleoside Triphosphate and Reconstituted Cell-Free Protein Synthesis2019

    • 著者名/発表者名
      Wang Po-Hsiang、Fujishima Kosuke、Berhanu Samuel、Kuruma Yutetsu、Jia Tony Z.、Khusnutdinova Anna N.、Yakunin Alexander F.、McGlynn Shawn E.
    • 雑誌名

      ACS Synthetic Biology

      巻: 9 号: 1 ページ: 36-42

    • DOI

      10.1021/acssynbio.9b00456

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Role of APS reductase in biogeochemical sulfur isotope fractionation2019

    • 著者名/発表者名
      Sim Min Sub、Ogata Hideaki、Lubitz Wolfgang、Adkins Jess F.、Sessions Alex L.、Orphan Victoria J.、McGlynn Shawn E.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1038/s41467-018-07878-4

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Revised kinetic parameters of the Aps reductase enzyme: effect on microbial sulfur isotope fractionation.2020

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      JPGU
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 火星および他の外惑星に関連した新しい生物学的メタン代謝2020

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      8th Life in the Universe workshop by Astrobiology Center, NINS
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] What role does metal availability play in evolution of life on the planet?2020

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      Gordon Research Conference Geobiology
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Linking Enzyme Evolution to the Rock Record with Stable Isotope Enabled Enzymology2019

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      Deep Carbon Observatory
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] New insights into microbial iron cycling at a marine ferrous carbonate hot spring2019

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      Marine Biotechnology Conference
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Relating energy, isotopes, and cell physiology2019

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      JSME The conference of the Japanese Society of Microbiology
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Energy Controlled Distribution of Isotopes in Biocatalytic Systems: Case Study on Adenylyl-Sulfate Reductase2018

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      Helmholtz-Zentrum Umweltforschung
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Energy Controlled Distribution of Isotopes in Biocatalytic Systems: Case Study on APS Reductase.2018

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      Montana State University, Chemistry Department Seminar
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Energy Controlled Distribution of Isotopes in Biocatalytic Systems: Case Study on APS Reductase2018

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlynn
    • 学会等名
      American Society of Microbiologists
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] Metal Ions in Life Sciences, Volume 212021

    • 著者名/発表者名
      Shawn McGlyn
    • 出版者
      De Gruyter
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] https://sites.google.com/elsi.jp/mcglynn/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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