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膜環境変化に伴う膜タンパク質の機能-ダイナミクス相関の解析

研究課題

研究課題/領域番号 18H02393
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関横浜市立大学

研究代表者

高橋 栄夫  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (60265717)

研究分担者 竹内 恒  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ長 (20581284)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2021年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2020年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2018年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
キーワードNMR / 膜タンパク質 / 界面活性剤 / 脂質 / 酵素
研究成果の概要

本研究において我々は、膜内プロテアーゼを対象とした研究から、ロンボイドプロテアーゼが可溶化に用いる界面活性剤のアルキル鎖長、親水性頭部の性質により活性調節されることを示すとともに、熱安定性と酵素活性に逆相関関係が見られることを明らかにした。膜様環境の相違が分子内部運動に影響を与え、活性に影響を与えている可能性が考えられた。さらに好熱真正細菌由来微生物型ロドプシンを対象として、脂質二重膜系を含む、系統的な物性解析を行い、安定性が高い膜様環境の指標を示した。また、異なる膜様環境におけるNMR解析結果から、膜周辺環境の相違は局所構造の相違を誘起し、分子の動的構造・安定性が変調される可能性が示された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

膜タンパク質は高い疎水性を有し、水溶液中に単離することが困難であるため、その研究を進めるうえでは界面活性剤などの膜様物質とともに可溶化することが行われる。しかしながら、選択した膜様環境において、構造・機能・安定性がどのように維持されるかという点は、学術的にも、創薬研究や分子工学研究などの応用研究を展開する上でも重要な問題となる。本研究で得られた知見は、他の膜タンパク質研究を進めるうえでの指標となるばかりでなく、周辺環境が膜タンパク質に及ぼす影響を原子レベルで理解するための端緒となる研究成果であるといえる。

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (14件) (うち国際共著 3件、 査読あり 14件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (27件) (うち国際学会 3件、 招待講演 4件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Nonthermal excitation effects mediated by subterahertz radiation on hydrogen exchange in ubiquitin2021

    • 著者名/発表者名
      Tokunaga Yuji、Tanaka Masahito、Iida Hitoshi、Kinoshita Moto、Tojima Yuya、Takeuchi Koh、Imashimizu Masahiko
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 120 号: 12 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2021.04.013

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Function-Related Dynamics in Multi-Spanning Helical Membrane Proteins Revealed by Solution NMR2021

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi Koh、Kofuku Yutaka、Imai Shunsuke、Ueda Takumi、Tokunaga Yuji、Toyama Yuki、Shiraishi Yutaro、Shimada Ichio
    • 雑誌名

      Membranes

      巻: 11 号: 8 ページ: 604-604

    • DOI

      10.3390/membranes11080604

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Flexibility and cell permeability of cyclic Ras-inhibitor peptides revealed by coupled Nose Hoover equation2021

    • 著者名/発表者名
      Kei Moritsugu, Koh Takeuchi, Narutoshi Kamiya, Junichi Higo, Isao Yasumatsu, Yoshifumi Fukunishi and Ikuo Fukuda
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling

      巻: 61 号: 4 ページ: 1921-1930

    • DOI

      10.1021/acs.jcim.0c01427

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Revisiting biomolecular NMR spectroscopy for promoting small-molecule drug discovery”2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Hanzawa, Takashi Shimada, Mizuki Takahashi and Hideo Takahashi
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR

      巻: 74 号: 10-11 ページ: 501-508

    • DOI

      10.1007/s10858-020-00314-0

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Fingerprints of an Intact Monoclonal Antibody Acquired under Formulated Storage Conditions via 15N Direct Detection Nuclear Magnetic Resonance2020

    • 著者名/発表者名
      Tokunaga Yuji、Takeuchi Koh、Okude Junya、Ori Kazutomo、Torizawa Takuya、Shimada Ichio
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: - 号: 10 ページ: 5360-5366

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.0c00231

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Targeting the cryptic sites: NMR-based strategy to improve protein druggability by controlling the conformational equilibrium2020

    • 著者名/発表者名
      Mizukoshi Yumiko、Takeuchi Koh、Tokunaga Yuji、Matsuo Hitomi、Imai Misaki、Fujisaki Miwa、Kamoshida Hajime、Takizawa Takeshi、Hanzawa Hiroyuki、Shimada Ichio
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 6 号: 40

    • DOI

      10.1126/sciadv.abd0480

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cooperative interactions facilitate stimulation of Rad51 by the Swi5-Sfr1 auxiliary factor complex.2020

    • 著者名/発表者名
      Argunhan B, Sakakura M, Afshar N, Kurihara M, Ito K, Maki T, Kanamaru S, Murayama Y, Tsubouchi H, Takahashi M, Takahashi H, Iwasaki H.
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 9

    • DOI

      10.7554/elife.52566

    • NAID

      120007117502

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural mechanisms underlying activity changes in an AMPA-type glutamate receptor induced by substitutions in its ligand-binding domain2019

    • 著者名/発表者名
      Masayoshi Sakakura, Yumi Ohkubo, Hiraku Oshima, Suyong Re, Masahiro Ito, Yuji Sugita, and Hideo Takahashi
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 27 号: 11 ページ: 1698-1709

    • DOI

      10.1016/j.str.2019.09.004

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational equilibrium defines the variable induction of the multidrug-binding transcriptional repressor QacR2019

    • 著者名/発表者名
      Koh Takeuchi, Misaki Imai, and Ichio Shimada
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 116 号: 40 ページ: 19963-19972

    • DOI

      10.1073/pnas.1906129116

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Emerging solution NMR methods to illuminate the structural and dynamic properties of proteins2019

    • 著者名/発表者名
      Haribabu Arthanari, KohTakeuchi, Abhinav Dubey, and Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Struct. Biol.

      巻: 58 ページ: 294-304

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2019.06.005

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Population shift mechanism for partial agonism of AMPA receptor2019

    • 著者名/発表者名
      Oshima H, Re S, Sakakura M, Takahashi H, Sugita Y.
    • 雑誌名

      Biophys. J.

      巻: 116 号: 1 ページ: 52-68

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2018.11.3122

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aromatic 19F-13C TROSY: a background-free approach to probe biomolecular structure, function, and dynamics2019

    • 著者名/発表者名
      Boeszoermenyi A, Chhabra S, Dubey A, Radeva D. L, Burdzhiev N. T, Chanev C. D, Petrov O. I, Gelev V. M, Zhang M, Anklin C, Kovacs H, Wagner G, Kuprov I, Takeuchi K, Arthanari H.
    • 雑誌名

      Nat. Methods

      巻: 16 号: 4 ページ: 333-340

    • DOI

      10.1038/s41592-019-0334-x

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Phosphoinositide binding by the PH domain in ceramide transfer protein (CERT) is inhibited by hyperphosphorylation of an adjacent serine-repeat motif2018

    • 著者名/発表者名
      Sugiki Toshihiko、Egawa Daichi、Kumagai Keigo、Kojima Chojiro、Fujiwara Toshimichi、Takeuchi Koh、Shimada Ichio、Hanada Kentaro、Takahashi Hideo
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 293 号: 28 ページ: 11206-11217

    • DOI

      10.1074/jbc.ra118.002465

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Methyl-selective isotope labeling using α-ketoisovalerate for the yeast Pichia pastoris recombinant protein expression system2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Rika、Sakakura Masayoshi、Mori Masaki、Fujii Moe、Akashi Satoko、Takahashi Hideo
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR

      巻: 71 号: 4 ページ: 213-223

    • DOI

      10.1007/s10858-018-0192-3

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] シャルコー・マリー・トゥース病関連変異型ミエリンタンパク質ゼロの機能構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、三尾和弘、田辺幹雄、高橋栄夫
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Solution NMR analysis of Rubrobacter xylanophilus rhodopsin in different membrane-mimetic environments2021

    • 著者名/発表者名
      Rika Suzuki, Masafumi Hirohata, Chika Hoyano, Keiichi Kojima, Yuki Sudo, and Hideo Takahashi
    • 学会等名
      22nd ICMRBS & 9th APNMR
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 生体発動分子の機能構造解析に向けた検討2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木里佳、廣畑雅史、穂谷野知佳、藤田陽、高橋栄夫
    • 学会等名
      第1回発動分子科学研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 異なる膜様環境下におけるプロトンポンプ型ロドプシンRxRの機能および構造変化の解析2021

    • 著者名/発表者名
      廣畑雅史、鈴木里佳、穂谷野知佳、藤田陽、吉田真帆子、村田武士、小島慧一、須藤雄気、高橋栄夫
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] プロトンポンプ型ロドプシンTRのNMR解析に向けた試料調製法の確立2021

    • 著者名/発表者名
      穂谷野知佳、鈴木里佳、廣畑雅史、村田武士、小島慧一、須藤雄気、高橋栄夫
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] シャルコー・マリー・トゥース病関連変異がミエリンタンパク質ゼロの構造および機能に及ぼす影響の解明2021

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、三尾和弘、田辺幹雄、高橋栄夫
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 溶液NMR法を用いた光駆動プロトンポンプRxRの機能構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木里佳、廣畑雅史、穂谷野知佳、藤田陽、高橋栄夫
    • 学会等名
      第2回発動分子科学研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] NMRを用いた動的生命現象の理解と創薬への応用2021

    • 著者名/発表者名
      竹内恒
    • 学会等名
      第65回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 神経栄養因子NGF高親和性受容体TrkAドメイン5と新規結合ペプチドの相互作用解析2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木里佳、登坂綺水、浴本亨、髙橋真帆、山根努、坂倉正義、水越弓子、竹内恒、嶋田一夫、池口満徳、高橋栄夫
    • 学会等名
      日本薬学会第140年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 脂質二重膜の多重層化に重要なミエリンタンパク質ゼロ細胞外ドメインのホモ相互作用メカニズムの解明2021

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、田辺幹雄、三尾和弘、高橋栄夫
    • 学会等名
      日本薬学会第140年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 溶液NMRを用いた微生物型プロトンポンプロドプシンRxRの機能・構造解析2020

    • 著者名/発表者名
      廣畑雅史、鈴木里佳、小島慧一、吉田真帆子、村田武士、須藤雄気、高橋栄夫
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 脂質二重膜の重層化を担うミエリンタンパク質ゼロ細胞外ドメインのホモ相互作用メカニズムの解明2020

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、田辺幹雄、三尾和弘、高橋栄夫
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 溶液NMRを用いた動的構造創薬2020

    • 著者名/発表者名
      竹内恒
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 溶液NMRを用いた動的構造創薬2020

    • 著者名/発表者名
      竹内恒
    • 学会等名
      2020年度 日本分光学会NMR分光部会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] NMR相互作用解析による創薬アプローチ2019

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 学会等名
      生有研シンポジウム「生体分子間に働く相互作用解析法の現状と今後の可能性」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 溶液NMR法を用いた界面活性剤ミセル中における膜タンパク質の比較構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      里佳、吉田真帆子、廣畑雅史、村田武士、小島慧一、須藤雄気、高橋栄夫
    • 学会等名
      第58回NMR討論会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] リコンビナーゼRad51と補助因子Swi5-Sfr1のNMR相互作用解析に向けた基盤研究2019

    • 著者名/発表者名
      井出優希、坂倉正義、真木孝尚、岩崎博史、高橋栄夫
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Rhomboid proteaseの様々な膜環境変化における酵素活性と熱安定性の評価2019

    • 著者名/発表者名
      薬袋勇樹、畠山彩由子、平島かれん、坂倉正義、高橋栄夫
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 異なる疑似膜環境中における耐熱性膜タンパク質RxRの構造安定性と機能の解析2019

    • 著者名/発表者名
      吉田真帆子、鈴木里佳、廣畑雅史、村田武士、小島慧一、須藤雄気、高橋栄夫
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Conformational equilibrium defines variable transcriptional repression of a multidrug binding transcriptional repressor, QacR2019

    • 著者名/発表者名
      Koh Takeuchi
    • 学会等名
      8th Asia-Pacific NMR Symposium 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Targeting the cryptic sites: NMR-based strategy to improve the draggability of proteins by controlling the conformational equilibrium.2019

    • 著者名/発表者名
      Ko Takeuchi
    • 学会等名
      第57回生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] NMRを用いたAMPA型グルタミン酸受容体リガンド結合ドメインの運動性解析2018

    • 著者名/発表者名
      大久保優美、坂倉正義、横井誠矢、高橋栄夫
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Rhomboid proteaseの活性メカニズム解明に向けた機能・構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      畠山彩由子、薬袋勇樹、長倉玲音、坂倉正義、高橋栄夫
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 末梢神経ミエリンの膜重層化に関与するタンパク質MPZと脂質との相互作用解析2018

    • 著者名/発表者名
      森雅樹、坂倉正義、三尾和弘、高橋栄夫
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] NMR analysis of the structural and functional stability of proteins2018

    • 著者名/発表者名
      Hideo Takahashi
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Methyl-selective 13C incorporation using alpha-ketoisovalerate for the yeast Pichia pastoris expression system2018

    • 著者名/発表者名
      Rika Suzuki, Masayoshi Sakakura, Hideo Takahashi
    • 学会等名
      XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] NMR を用いたアミロイド前駆蛋白質 C99 の構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、真嶋健大、三尾和弘、Charles Sanders、高橋栄夫
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [図書] 先端の分析法 第2版 第2章2.多次元NMR測定2022

    • 著者名/発表者名
      高橋栄夫
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860437374
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] NMRによる有機材料分析とその試料前処理、データ解釈 第6章第5節 NMRによるペプチドの立体構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      坂倉正義、高橋栄夫
    • 出版者
      技術情報協会
    • ISBN
      9784861048609
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

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