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概日時計による細胞運命決定制御の普遍性

研究課題

研究課題/領域番号 18H02461
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

遠藤 求  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (80551499)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2020年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2019年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2018年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
キーワードシロイヌナズナ / 概日リズム / 分化全能性 / 1細胞トランスクリプトーム / 概日時計 / 細胞運命決定 / 1細胞解析 / 植物 / 分化誘導 / 1細胞トランスクリプトーム / 分化
研究成果の概要

植物は分化全能性を示すことが大きな特徴であり、概日リズムが関わっている可能性が示唆されてきた。しかし、植物の未分化細胞を直接単離することは難しく、概日時計が細胞分化に関わっているのか、関わっているとすればどの時計遺伝子がどのように関わっているのかを明らかにすることは困難であった。そこで本研究では、葉肉細胞から維管束細胞への分化誘導系(VISUAL)を活用すると共に、ガラスキャピラリを用いた時系列1細胞トランスクリプトーム解析を実施した。その結果、細胞分裂の後期には時計遺伝子LUXが特異的に発現誘導され、これが細胞分裂周期や細胞分化関連の遺伝子の発現を直接誘導することを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究により、概日時計遺伝子が直接、細胞運命決定に関わっていることが明らかとなった。また、細胞運命の決定に先立って概日リズム形成が起こっていることが明らかになったことから、概日リズムはこれまでに考えられている以上に広範な現象に関わっている可能性が示唆された。
植物細胞が分化全能性を示す一方で、動物細胞が示さないことは大きな謎であるが、動物細胞、植物細胞の両方において概日時計の関与が示唆されたことから、概日時計の機能あるいはその制御対象の違いがこうした違いを生み出している可能性が考えられ、分化全能性に対する理解がさらに進むきっかけになると期待される。

報告書

(4件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (37件) (うち国際学会 22件、 招待講演 6件)

  • [雑誌論文] A guiding role of the Arabidopsis circadian clock in cell differentiation revealed by time-series single-cell RNA sequencing2022

    • 著者名/発表者名
      Torii K, Inoue K, Bekki K, Haraguchi K, Kubo M, Kondo Y, Suzuki T, Kubota A, Uemoto K, Shimizu H, Saito M, Fukuda H, Araki T, Endo M
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 40 ページ: 111059-111059

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sulfanilamide Regulates Flowering Time through Expression of the Circadian Clock Gene LUX2022

    • 著者名/発表者名
      Hirohata Atsuhiro、Yamatsuta Yuta、Ogawa Kaori、Kubota Akane、Suzuki Takamasa、Shimizu Hanako、Kanesaka Yuki、Takahashi Nozomu、Endo Motomu
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: - 号: 5 ページ: 649-657

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac027

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Color-Changing Fluorescent Barcode Based on Strand Displacement Reaction Enables Simple Multiplexed Labeling2022

    • 著者名/発表者名
      Makino Koki、Susaki Etsuo A.、Endo Motomu、Asanuma Hiroyuki、Kashida Hiromu
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 144 号: 4 ページ: 1572-1579

    • DOI

      10.1021/jacs.1c09844

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Na+/Ca2+ exchanger mediates cold Ca2+ signaling conserved for temperature-compensated circadian rhythms2021

    • 著者名/発表者名
      Kon Naohiro、Wang Hsin-tzu、Kato Yoshiaki S.、Uemoto Kyouhei、Kawamoto Naohiro、Kawasaki Koji、Enoki Ryosuke、Kurosawa Gen、Nakane Tatsuto、Sugiyama Yasunori、Tagashira Hideaki、Endo Motomu、Iwasaki Hideo、Iwamoto Takahiro、Kume Kazuhiko、Fukada Yoshitaka
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 7 号: 18 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1126/sciadv.abe8132

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Time-Series Single-Cell RNA-Seq Data Reveal Auxin Fluctuation during Endocycle2020

    • 著者名/発表者名
      Kotaro Torii
    • 雑誌名

      Plant cell & physiology

      巻: 61 号: 2 ページ: 243254-243254

    • DOI

      10.1093/pcp/pcz228

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ELF in the root2020

    • 著者名/発表者名
      Akane Kubota & Motomu Endo
    • 雑誌名

      Nature Plants

      巻: 6 号: 4 ページ: 336-337

    • DOI

      10.1038/s41477-020-0636-0

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] 時計遺伝子PRR7は光受容体phototropinのシグナル伝達系を制御する2022

    • 著者名/発表者名
      森本隆弘、Carlo F M Gian 粕谷日向子、久保田茜、高橋望、中道範人、遠藤求
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 栄養素の輸送を介した器官間でのカップリングが概日時計の安定性を高める2022

    • 著者名/発表者名
      上本恭平、国本由美、森史、伊藤浩史、江頭春樹、久保田茜、木下俊則、荒木崇、遠藤求
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Different root expression patterns of circadian clock in Arabidopsis thaliana2022

    • 著者名/発表者名
      Yu Leng, Akane Kubota, Nozomu Takahashi, Tatsuaki Goh, Motomu Endo
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 組織特異的な時計遺伝子の機能解明2022

    • 著者名/発表者名
      大畑駿一郎、高橋望、久保田茜、遠藤求
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] B-boxファミリーGroupVは低温下で花成を制御する2022

    • 著者名/発表者名
      近藤祐雅、久保田茜、菅野茂夫、村中智明、高橋望、今泉貴登、遠藤求
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 時差ボケ実験から植物の外的符合モデルを再考する2021

    • 著者名/発表者名
      久保田茜、山本いずみ、遠藤求
    • 学会等名
      第28回 日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Clock genes show different spatiotemporal expression in Arabidopsis thaliana root2021

    • 著者名/発表者名
      Yu Leng, Akane Kubota, Nozomu Takahashi, Tatsuaki Goh, Motomu Endo
    • 学会等名
      第28回 日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Shoot-root two0way communication stabilizes circadian rhythm in Arabidopsis2021

    • 著者名/発表者名
      上本恭平、国本有美、荒木崇、遠藤求
    • 学会等名
      第28回 日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 地上部の概日時計による根毛伸長メカニズムの解析2021

    • 著者名/発表者名
      池田ひかり、内川大雅、近藤洋平、久保田茜、遠藤求
    • 学会等名
      日本植物学会 第85回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 野外環境における光と温度によるFT遺伝子の発現制御機構2021

    • 著者名/発表者名
      久保田茜、近藤祐雅、遠藤求、今泉貴登
    • 学会等名
      日本植物学会 第85回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 高温による花成制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      尾崎友亮、久保田茜、今泉貴登、遠藤求
    • 学会等名
      日本植物学会 第85回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Seasonal cues control the daily expression patterns of FT to optimize flowering time in nature2021

    • 著者名/発表者名
      Akane Kubota, Yusuke Ozaki, Yoshinori Kondo, Motomu Endo, Takato Imaizumi
    • 学会等名
      第44回分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Time to update the external coincidence model in Arabidopsis2021

    • 著者名/発表者名
      Motomu Endo
    • 学会等名
      Sapporo Symposium on Biological Rhythm 2021
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 野外環境における日長認識機構の解明に向けて2020

    • 著者名/発表者名
      久保田 茜, 今村 慎吾,遠藤 求, 今泉 貴登
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 慢性的な時差ボケは古い葉の光障害を増加させる2020

    • 著者名/発表者名
      山中 美和子, 久保田 茜, 遠藤 求
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 糖と栄養素の輸送による時間情報伝達が概日時計の安定性を生み出す2020

    • 著者名/発表者名
      上本 恭平, 国本 有美, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Origination of the circadian clock system in stem cells regulates cell differentiation2020

    • 著者名/発表者名
      鳥井 孝太郎,井上 圭佑,荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 植物における 3D single cell トランスクリプトーム技術の開発2020

    • 著者名/発表者名
      内川 大雅, 久保田 茜, 遠藤 求
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] PRR7 は光受容体 phototropin のシグナル伝達系を制御する2020

    • 著者名/発表者名
      鷲見 駿太, 粕谷 日向子, 鳥井 孝太郎, 久保田 茜, 遠藤 求
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 概日時計を介した季節認識機構の制御2020

    • 著者名/発表者名
      廣畑 敦洋, 山蔦 祐太, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effect of light and temperature fluctuation on daily FT expression pattern2019

    • 著者名/発表者名
      Akane Kubota, Nayoung Lee, YoungHun Song, Motomu Endo, and Takato Imaizumi
    • 学会等名
      International Symposium on Plant Photobiology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 器官間での時間情報伝達に栄養素が関わる2019

    • 著者名/発表者名
      上本 恭平, 国本 有美, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第26回学術大会日本時間生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Origination of the circadian clock system in stem cells regulates cell differentiation2019

    • 著者名/発表者名
      鳥井 孝太郎,井上 圭佑,荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第26回学術大会日本時間生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] PRR7は光受容体PHOTのシグナル伝達系を制御する2019

    • 著者名/発表者名
      粕谷 日向子, 鳥井 孝太郎, 遠藤 求
    • 学会等名
      第26回学術大会日本時間生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 概日時計を介した季節認識機構の制御2019

    • 著者名/発表者名
      廣畑 敦洋, 山蔦 祐太, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第26回学術大会日本時間生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 野外環境における温度と光によるFT遺伝子の発現制御機構2019

    • 著者名/発表者名
      久保田 茜, Nayoung Lee, 遠藤 求, 今泉 貴登
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] シロイヌナズナにおける、組織間で時間情報を共有する仕組みの解明2019

    • 著者名/発表者名
      上本 恭平, 国本 有美, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 細胞タイプ特異的な概日時計が細胞の運命を決定する2019

    • 著者名/発表者名
      鳥井 孝太郎, 井上 佳祐, 別城 啓太, 遠藤 求
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 概日時計の調節による季節認識メカニズムの制御2019

    • 著者名/発表者名
      廣畑 敦洋, 山蔦 祐太, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Origination of the circadian clock system in stem cells regulates cell differentiation in Arabidopsis thaliana2019

    • 著者名/発表者名
      Motomu Endo
    • 学会等名
      Photobiology world congress 2019
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 根から地上部へ時間情報を伝達する仕組みの解明2018

    • 著者名/発表者名
      上本 恭平, 国本 有美, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      新学術領域 環境記憶統合 第4回若手の会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Regulation of floering by light and temperature2018

    • 著者名/発表者名
      Akane Kubota, YoungHun Song, Nayoung Lee, and Takato Imaizumi
    • 学会等名
      第25回日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] シロイヌナズナにおける、組織間で時間情報を共有する仕組みの解明2018

    • 著者名/発表者名
      上本 恭平, 国本 有美, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第25回日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Cell-type specific clock system regulates plant cell fate2018

    • 著者名/発表者名
      鳥井 孝太郎, 井上 佳祐, 別城 啓太, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第25回日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 概日時計は細胞周期を介して細胞運命決定を制御する2018

    • 著者名/発表者名
      別城 啓太, 鳥井 孝太郎, 井上 佳祐, 清水 華子, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      第25回日本時間生物学会学術大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナにおいて、組織間で時間情報を共有する仕組みの解明2018

    • 著者名/発表者名
      上本 恭平, 国本 有美, 荒木 崇, 遠藤 求
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Circadian clocks in Arabidopsis regulates cell-fate determination.2018

    • 著者名/発表者名
      Motomu Endo
    • 学会等名
      apporo Symposium on Biological Rhythm in 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-01-30  

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