| 研究課題/領域番号 |
18H02497
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分45030:多様性生物学および分類学関連
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| 研究機関 | 長浜バイオ大学 |
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研究代表者 |
倉林 敦 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 (00327701)
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| 研究分担者 |
太田 英利 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (10201972)
田辺 秀之 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)
森 哲 京都大学, 理学研究科, 教授 (80271005)
米澤 隆弘 東京農業大学, 農学部, 准教授 (90508566)
松田 洋一 名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (70165835)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2023-03-31
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| 研究課題ステータス |
中途終了 (2022年度)
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| 配分額 *注記 |
16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円)
2022年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2021年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2020年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2019年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2018年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
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| キーワード | 遺伝子水平伝播 / ブラーミニメクラヘビ / 全ゲノム解析 / Indotyphlops属 / Psammophis condortus / BovB / 遺伝子の水平伝播 / 生物地理 / パンデミック / ウィルス / メクラヘビ / 水平伝播 / 次世代シークエンス / メタゲノム / 南アジア / マダガスカル / 染色体FISH / 分子系統 / 分岐年代 / 系統地理 / 脊椎動物 / 生物系統地理 / 分子系統解析 / インド / 外来生物 |
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| 研究実績の概要 |
本研究では、ヘビからカエルに水平伝播したLINEレトロトランスポゾンBovBについて、（1）水平伝播時期と地域の解明、（2）水平伝播遺伝子の視覚化、（3）爬虫類・両生類以外のマダガスカル産脊椎動物にもBovBの水平伝播が生じているかの解明、（4）水平伝播を媒介した寄生虫・ウィルスの探索、（5）南アジア原産のブラーミニメクラヘビが、マダガスカルのヘビタイプのBovBを持っている理由の解明、の5点を目的としている。
本年度は、主に（5）について研究を行った。まず、水平伝播によってBovB配列を持つようになったと思われるブラーミニメクラヘビのゲノムに転移が可能な完全なBovB配列が存在しているかを明らかにするために、本種の全ゲノム配列を決定した。その結果、ブラーミニメクラヘビには転移可能な完全なBovB配列が存在することが確認された。また、本種の全ゲノム情報をScientific Data (IF=8.6)において公表した。
さらに、スリランカとバングラデシュ産のIndotyphlops類の標本（26と35標本）の輸出許可を得ることに成功した。これらのサンプルについて分子系統解析を行い、9種の未記載種が含まれている可能性を示した。また、これらのメクラヘビ類からはBovBの増幅が見られた。さらに、ブラーミニメクラヘビのBovBの起源と思われるアレチヘビ類の中でも例外的にアジアに産する Psammophis condortus の入手にも成功し、本種からもBovBの増幅を確認した。
今後、Indotyphlops類とPsammophisのBovBとブラーミニメクラヘビのBovBの関係が明らかにすることで、ブラーミニメクラヘビへのBovBの水平伝播がアフリカで生じたのか、アジア起源なのかが明らかにできる。
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| 現在までの達成度 (段落) |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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