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柔軟な構造を持つ生体分子の構造化手法の確立と応用

研究課題

研究課題/領域番号 18H02552
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分47010:薬系化学および創薬科学関連
研究機関東京大学

研究代表者

大和田 智彦  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (20177025)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2021年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2020年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2019年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2018年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円)
キーワードペプチド / ヘリックス構造 / ストランド構造 / MDM2-p53 / MDMX-p53 / タンパク質-タンパク質相互作用 / リゾリン脂質 / リゾリン脂質」 / アミノ酸 / プロリン / βーストランド構造 / MDM2-P53 / 脂肪酸 / 動的構造 / 創デザイン / ヘリックス / 不飽和脂肪酸 / 生体内リガンド / 脂質 / アミド / コンフォメーション / βストランド / 脂質メディエーター / 分子シミュレーション
研究成果の概要

本研究課題は分子に規則構造を作り出し機能を創製することにある。生体内リガンドをミミックする分子を構築するための「構造化の有機化 学」という基礎サイエンスの確立とメディシナルケミストリーやケミカルバイオロジーへの応用を目的とする「機能創出のサイエンス」の連携である。構造有機化学の基礎研究に加えて実際の生物活性物質の取得によって本研究の仮説を評価した。特に生体内で見られる、構造柔軟性の高い回転しやすい3級アミド結合の シスートランス平衡を動的に固定して堅牢な規則構造を構築し、タンパク質-タンパク質相互作用を制御することが可能であることを示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

天然界に存在しない構造特性(構造的なパラメーター)を有する規則構造を取る有機化学物を創製し、それがなぜ規則性を示すのかの要因を解明することは自然科学としての有機化学の根源的な問いであると同時に、そのような非天然な規則構造が、天然界に存在する(具体的には生体内に存在する)規則構造をもつ物質と相補的な相互作用をするかの問いに答えことは、メディシナルケミストリーやケミカルバイオロジー研究において、新たなタンパク質の機能を変更する化学物質の発見につながり、さらには医薬品の構造の多様性につながる。

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (48件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち国際共著 1件、 査読あり 13件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (32件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Building on endogenous lipid mediators to design synthetic receptor ligands2022

    • 著者名/発表者名
      Luying Chen, Ge Yan, Tomohiko Ohwada
    • 雑誌名

      European Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 231 ページ: 114154-114154

    • DOI

      10.1016/j.ejmech.2022.114154

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Contribution of solvents to geometrical preference in the Z/E equilibrium of N-phenylthioacetamide2022

    • 著者名/発表者名
      Song S, Hyodo T, Ikeda H, Kim A, Tang Y, Chan E, Otani, Y, Inagaki S, Yamaguchi K, Ohwada T,
    • 雑誌名

      J Org Chem.

      巻: 87 号: 3 ページ: 1641-1660

    • DOI

      10.1021/acs.joc.1c00801

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Elaboration of Non-naturally Occurring Helical Tripeptides as p53–MDM2/MDMX Interaction Inhibitors2021

    • 著者名/発表者名
      Su Aoze、Tabata Yuko、Aoki Kiyono、Sada Akane、Ohki Rieko、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei、Wang Siyuan、Otani Yuko、Ohwada Tomohiko
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 69 号: 7 ページ: 681-692

    • DOI

      10.1248/cpb.c21-00238

    • NAID

      130008060029

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2021-07-01
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Switching Lysophosphatidylserine G Protein-coupled Receptor Agonists to Antagonists by Acylation of the Hydrophilic Serine Amine2021

    • 著者名/発表者名
      Misa Sayama, Akiharu Uwamizu, Masaya Ikubo, Luying Chen, Ge Yan, Yuko Otani, Asuka Inoue, Junken Aoki, Tomohiko Ohwada
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 64(14) 号: 14 ページ: 10059-10101

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.1c00347

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unexpectedly Rigid Short Peptide Foldamers in which NH-p and CH-p Interactions are Reserved in Solution Luhan Zhai, Masayuki Nara, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada2021

    • 著者名/発表者名
      Luhan Zhai, Masayuki Nara, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 57 (67) 号: 67 ページ: 8344-8347

    • DOI

      10.1039/d1cc02998c

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rhodium and Palladium Complexes of NHeterocyclic Olefin (NHO) Ligand Fused with the 9,10-Dihydro-9,10-ethanoanthracene Framework2021

    • 著者名/発表者名
      Shin Ando, Akio Ohara, Tomohiko Ohwada, Tadao Ishizuka
    • 雑誌名

      Organometallics

      巻: 40 号: 21 ページ: 3668-3677

    • DOI

      10.1021/acs.organomet.1c00503

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of Medium-Ring-Sized Benzolactams by Using Strong Electrophiles and Quantitative Evaluation of Ring-Size Dependency of the Cyclization Reaction Rate2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Kurouchi and Tomohiko Ohwada
    • 雑誌名

      J. Org. Chem.

      巻: 85, 号: 2 ページ: 876-901

    • DOI

      10.1021/acs.joc.9b02843

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Exploiting a C-N Bond Forming Cytochrome?P450 Monooxygenase for C?S Bond Formation2020

    • 著者名/発表者名
      Morita Iori、Mori Takahiro、Mitsuhashi Takaaki、Hoshino Shotaro、Taniguchi Yoshimasa、Kikuchi Takashi、Nagae Kei、Nasu Norihiro、Fujita Makoto、Ohwada Tomohiko、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 号: 10 ページ: 3988-3993

    • DOI

      10.1002/anie.201916269

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Conformational preference of bicyclic β‐amino acid dipeptides2020

    • 著者名/発表者名
      Otani Yuko、Park Seokhwi、Ohwada Tomohiko
    • 雑誌名

      Chirality

      巻: 32 号: 6 ページ: 790-807

    • DOI

      10.1002/chir.23220

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequential Suzuki-Miyaura Coupling / Lewis Acid Catalyzed Cyclization: An Entry to Functionalized Cycloalkane-Fused Naphthalenes2020

    • 著者名/発表者名
      Mahecha-Mahecha, Camilo; Leconu, Frederic, Akinari, Sumita; Charote, Thomas; Gamba-Sanchez, Diego; Ohwada, Tomohiko; Thibaudeau, Sebastien
    • 雑誌名

      Organic Letters, 22, 16, 6267-6271

      巻: 22 号: 16 ページ: 6267-6271

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c02020

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Peptide-based short single β-strand mimics without hydrogen bonding or aggregation2020

    • 著者名/発表者名
      Zhai Luhan、Otani Yuko、Hori Yukiko、Tomita Taisuke、Ohwada Tomohiko
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 号: 10 ページ: 1573-1576

    • DOI

      10.1039/c9cc08378b

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Application of C-terminal 7-azabicyclo[2.2.1]heptane to stabilize β?strand-like extended conformation of a neighboring α-amino acid2018

    • 著者名/発表者名
      Luhan Zhai  et al
    • 雑誌名

      J. Org. Chem.,

      巻: 83 号: 21 ページ: 13063-13079

    • DOI

      10.1021/acs.joc.8b01756

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unexpected Resistance to Base-catalyzed Hydrolysis of Nitrogen Pyramidal Amides Based on the 7-Azabicyclic[2.2.1]heptane Scaffold2018

    • 著者名/発表者名
      Diego Antonio Ocampo Gutierrez de Velasco et al
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 23 号: 9 ページ: 1-22

    • DOI

      10.3390/molecules23092363

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ベンズアニリド含有非天然アミノ酸ペプチドの光誘起的なコンホメーション変化2022

    • 著者名/発表者名
      一瀬 朝海1、○尾谷 優子1、大和田 智彦1
    • 学会等名
      日本薬学会 第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] トリプトファンの酵素的環化を利用したペプチド三次元構造制御の検討2022

    • 著者名/発表者名
      笠原 彰友1、尾谷 優子1、澄本 慎平2、岡田 正弘2、大和田 智彦1
    • 学会等名
      日本薬学会 第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 分子内ジスルフィド結合生成によるアミドのシストランス平衡の可逆的制御2022

    • 著者名/発表者名
      程 雨荷1、尾谷 優子1、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 窒素原子を含む結合活性化学種の発見2022

    • 著者名/発表者名
      大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 二環性β-アミノ酸の水素結合性側鎖によるアミドのシス-トランス異性化制御2021

    • 著者名/発表者名
      王 し泓1、尾谷 優子1、兵頭 直2、山口 健太郎2、大和田 智彦
    • 学会等名
      第65回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Identification of Inverse Agonists Starting from Agonists for Lipid Mediator Lysophatidylserine Receptors2021

    • 著者名/発表者名
      Ge Yan1、Misa Sayama1、Luying Chen1、Akiharu Uwamizu1、Yuko Otani1、Asuka Inoue2、Junken Aoki1、Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      第65回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Access to Inactive States of Lysolipid G Protein Coupled Receptor through Generation of Inverse Agonists, Switching from Antagonists2021

    • 著者名/発表者名
      Junjun Huang1、Ge Yan1、Luying Chen1、Misa Sayama1、Akiharu Uwamizu1、Yuko Otani1、Asuka Inoue2、Junken Aoki1、Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      第65回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ベンズアニリド誘導体におけるアミドシス-トランス制御によるペプチドコンホメーション変化2021

    • 著者名/発表者名
      一瀬 朝海、尾谷 優子、大和田 智彦
    • 学会等名
      第65回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] トリプトファン環化体によるプロリン立体配座の構築2021

    • 著者名/発表者名
      笠原彰友、尾谷優子、大和田智彦
    • 学会等名
      第47回反応と合成の進歩シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Effect of cis-trans transformation of benzanilide derivatives on peptide conformation2021

    • 著者名/発表者名
      Asami Ichinose, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      第58回ペプチド討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Mix-and-Match Strategy to Generate Lyso Phospholipd Agonists toward Membrane Receptors2021

    • 著者名/発表者名
      Tomohiko Ohwada, Masaya Ikubo, Sejin Jung, Sho Nakamura, Misa Sayama, Luying Chen, Yuko Otani
    • 学会等名
      13th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Investigation of Hydrophobic Requirement for P2Y10/LPS2 Selective Agonist Development and In-silico Construction of P2Y10-Agonist Binding Model2021

    • 著者名/発表者名
      Luying Chen, Misa Sayama, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      13th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Access to Inactive States of Lysolipid Receptor GPR34 through Generation of Inverse Agonists, Switching from Antagonists2021

    • 著者名/発表者名
      Junjun Huang, Luying Chen, Yuko Otani, Misa Sayama, Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      13th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 脂質メディエーターリゾリン脂質受容体の拮抗薬の設計と合成2021

    • 著者名/発表者名
      閻 格、佐山 美沙、陳 露瑩、上水 明治、尾谷 優子、井上 飛鳥、青木 淳賢、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 新たなリガンドデザインによるLysoPS受容体P2Y10の疎水性結合様式の解明2021

    • 著者名/発表者名
      陳 露瑩、佐山 美紗、尾谷 優子、上水 明治、井上 飛鳥、青木 淳賢、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] アミノカルボン酸を基質としたFriedel-Crafts アシル化反応2021

    • 著者名/発表者名
      呉 昊、澄田 明成、兵頭 直、山口 健太郎、尾谷 優子、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 置換基効果によるオキシムの立体選択性の解析とベックマン転位への応用2021

    • 著者名/発表者名
      藤野 智大、尾谷 優子、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 7-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン構造をもつβ-プロリン誘導体による単鎖βストランドの安定化2021

    • 著者名/発表者名
      ザイ ルーハン、尾谷 優子、堀 由紀子、富田 泰輔、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] チオアセトアニリドのシス-トランス異性化における溶媒分子の関与2021

    • 著者名/発表者名
      宋 舒イ,湯 玉蘭、尾谷 優子、池田 博隆、兵頭 直、山口 健太郎、稲垣 都士、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ベンズアニリド誘導体における外部刺激誘起によるアミド異性体の選択的生成2021

    • 著者名/発表者名
      一瀬 朝海、尾谷 優子、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] トリプトファン環化体による三級アミド平衡とペプチド局所構造の制御2021

    • 著者名/発表者名
      笠原 彰友、尾谷 優子、大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会 第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] アミノカルボン酸を基質としたFriedel-Craftsアシル化反応2020

    • 著者名/発表者名
      呉昊、澄田明成、尾谷優子、大和田智彦
    • 学会等名
      第64回日本薬学会 関東支部大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Design and Synthesis of Inverse Agonists for Lipid Mediator Lysophosphatidylserine Receptors2020

    • 著者名/発表者名
      Yan Ge 、Misa Sayama、Luying Chen、Akiharu Uwamizum 、Yuko Otani 、Asuka Inoue、Junken Aoki 、Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      第64回日本薬学会 関東支部大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] チオアセトアニリドのシス-トランス異性化に与える効果の解析2020

    • 著者名/発表者名
      宋 舒イ、湯玉蘭 、尾谷優子、池田博隆、兵頭直 、山口健太郎、稲垣都士 、大和田智彦
    • 学会等名
      第64回日本薬学会 関東支部大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] リゾホスファチジルセリン受容体P2Y10の活性化構造の解明と化合物による検証2020

    • 著者名/発表者名
      陳露瑩、佐山美紗 、尾谷優子、上水明治 、井上飛鳥、青木淳賢、大和田智彦
    • 学会等名
      第64回日本薬学会 関東支部大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] p53-MDM2/MDMX間相互作用を阻害する非天然ヘリックス分子の創製2020

    • 著者名/発表者名
      尾谷優子、蘇 奥澤、王 思遠、ザイ ルーハン、佐田あかね、大木理恵子、長門石 暁、津本浩平、奈良雅之、川幡正俊、山口健太郎、大和田智彦
    • 学会等名
      反応と合成の進歩2020特別企画シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] トリプトファン環化体による特定プロリンコンフォメーションの構築2020

    • 著者名/発表者名
      笠原彰友、尾谷優子、大和田智彦
    • 学会等名
      第80回有機合成化学協会関東支部シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] p53-MDM2/MDMX 間相互作用を阻害する非天然ヘリックス分子の創製2019

    • 著者名/発表者名
      蘇奥澤、王思遠、佐田あかね、尾谷優子、大木理恵子、大和田智彦
    • 学会等名
      第63回日本薬学会関東支部大会 (北里大学薬学部・東京)2019年9月
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 内在性脂肪酸と脂肪酸アナローグの立体配座の比較2019

    • 著者名/発表者名
      Mian Wu 、佐山美紗 、佐藤薫 、高橋華奈子 、尾谷優子 、大和田智彦
    • 学会等名
      第47回構造活性相関シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] フォルダマーの魅力-設計・構造・機能- S09-5 非天然型規則構造をもつペプチドミミックの構造特性と応用2018

    • 著者名/発表者名
      尾谷優子
    • 学会等名
      日本薬学会第138年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] p53-MDM2/MDMX間相互作用を阻害するヘリック分子の創製2018

    • 著者名/発表者名
      蘇奧澤、王思遠、ザイ ルーハン、大野久史、尾谷優子、清水未来、佐田あかね、大木理恵子、大和田智彦
    • 学会等名
      日本薬学会第138年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Amide nitrogen pyramidalization changes lactam amide spinning2018

    • 著者名/発表者名
      Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      Foldamers Meeting 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 論文紹介

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/article02.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 研究活動

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/activity.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 東京大学大学院薬学系研究科 薬化学教室

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/index.html

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

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