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Runx依存性遺伝子サイレンサーを介した遺伝子発現制御の新たな作動原理

研究課題

研究課題/領域番号 18H02620
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分48040:医化学関連
研究機関九州大学 (2020-2021)
国立研究開発法人理化学研究所 (2018-2019)

研究代表者

香城 諭  九州大学, 生体防御医学研究所, 准教授 (70360542)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2020年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2019年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2018年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
キーワード転写因子RUNX / 胸腺細胞分化 / Cd4遺伝子 / サイレンサー / エンハンサーRNA / 遺伝子発現 / enhancer RNA / CD4 / RUNX / Silencer / Runx
研究成果の概要

RUNXは、血液細胞分化に重要な役割を担う転写因子である。RUNXを介した遺伝子発現制御機構の一つに、RUNX依存性遺伝子サイレンサーによる標的遺伝子の発現抑制があるが、その制御機構についてはほとんど解明されていない。
本研究では、Cd4遺伝子を対象とし、サイレンサーに近接する遺伝子領域を確認した。その結果、サイレンサー活性が高く遺伝子発現を抑制する状況において、サイレンサー部とエンハンサー領域のゲノム近接が認められ、サイレンサーによる遺伝子発現の抑制は、エンハンサーを対象として誘導されるものであると考えられた。また、その抑制メカニズムとして、エンハンサーRNAの発現制御が示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

遺伝子発現は生体を構成する細胞の機能や分化を司る極めて重要な生物学的プロセスである。また、免疫細胞は生体の防御を担う重要な細胞集団であり、その機能や分化機構を明らかにすることは重要な意味を持つ。本研究では、免疫細胞の一つT細胞の分化過程で生じる遺伝子発現について、新たな制御機構の存在を明らかにするものである。本機構は、免疫細胞分化のみならず様々な細胞で利用されている可能性もあり、生体の仕組みを理解するうえでの重要な発見であると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2021 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Runx-mediated regulation of CCL5 via antagonizing two enhancers influences immune cell function and anti-tumor immunity2020

    • 著者名/発表者名
      Seo Wooseok、Shimizu Kanako、Kojo Satoshi、Okeke Arinze、Kohwi-Shigematsu Terumi、Fujii Shin-ichiro、Taniuchi Ichiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-16

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15375-w

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Constitutive CD8 expression drives innate CD8+ T-cell differentiation via induction of iNKT2 cells2020

    • 著者名/発表者名
      Kojo Satoshi、Ohno-Oishi Michiko、Wada Hisashi、Nieke Sebastian、Seo Wooseok、Muroi Sawako、Taniuchi Ichiro
    • 雑誌名

      Life Science Alliance

      巻: 3 号: 2 ページ: 1-13

    • DOI

      10.26508/lsa.202000642

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Runx/Cbfβ complexes protect group 2 innate lymphoid cells from exhausted-like hyporesponsiveness during allergic airway inflammation2019

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto Chizuko、Kojo Satoshi、Yamashita Motoi、Moro Kazuyo、Lacaud Georges、Shiroguchi Katsuyuki、Taniuchi Ichiro、Ebihara Takashi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 447-447

    • DOI

      10.1038/s41467-019-08365-0

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Runx-dependent and silencer-independent repression of a maturation enhancer in the Cd4 gene2018

    • 著者名/発表者名
      Kojo Satoshi、Yasmin Nighat、Muroi Sawako、Tenno Mari、Taniuchi Ichiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9 号: 1 ページ: 3593-3593

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05803-3

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Epigenomic and genetic approaches to identify Rorc enhancers indispensable for LTi cell development2022

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Kojo, Takuma Fukui, Shinichiro Sawa
    • 学会等名
      The 30th Hot Spring Harbor International Symposium
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] A do novo missense mutation of Bcl11b gene causes an abnormal thymopoiesis2021

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Okuyama, Motoi Yamashita, Kazuaki Matsumoto, Michiko Ohno-Oishi, Satoshi Kojo, Tomohiro Morio, Hideyuki Yoshida, Ichiro Taniuchi
    • 学会等名
      50th Japanese Society for Immunology
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Phosphorylation of the last tyrosine residue regulates Runx1 function during T cell development2021

    • 著者名/発表者名
      Chihiro Ogawa, Satoshi Kojo, Kazuki Okuyama, Sawako Muroi, Ichiro Taniuchi
    • 学会等名
      50th Japanese Society for Immunology
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Runx3 C末端アミノ酸残基による免疫細胞分化制御2019

    • 著者名/発表者名
      香城 諭, 海老原隆, 太野路子, 室井佐和子, 谷内一郎
    • 学会等名
      第29回Kyoto T Cell Conference
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Bcl11b ミスセンス変異によるT細胞分化異常の発症機序2019

    • 著者名/発表者名
      奥山一生, 山下 基, 太野路子, 香城 諭, 谷内一郎
    • 学会等名
      第29回Kyoto T Cell Conference
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Pathogenesis for T cell deficiency caused by a missense mutation of Bcl11b gene2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Okuyama, Motoi Yamashita, Michiko Ohno, Satoshi Kojo, Hideyuki Yoshida, Ichiro Taniuchi
    • 学会等名
      48th Japanese Society for Immunology
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
  • [学会発表] Runx3 C末端アミノ酸残基による免疫細胞分化制御2019

    • 著者名/発表者名
      香城 諭, 海老原隆, 太野路子, 室井佐和子, 谷内一郎
    • 学会等名
      第29回Kyoto T Cell Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Bcl11b ミスセンス変異によるT細胞分化異常の発症機序2019

    • 著者名/発表者名
      奥山一生, 山下 基, 太野路子, 香城 諭, 谷内一郎
    • 学会等名
      第29回Kyoto T Cell Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Constitutive CD8 expression during thymocyte development drives differentiation of innate-like CD8+ T cell and NKT2 subset.2018

    • 著者名/発表者名
      Kojo S, Ohno-Oishi M, Muroi S, Taniuchi I
    • 学会等名
      47th Japanese Society for Immunology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Interactome study of Bcl11b during T cell development2018

    • 著者名/発表者名
      Okuyama K, Kojo S, Muroi S, Taniuchi I
    • 学会等名
      47th Japanese Society for Immunology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Constitutive CD8 expression drives innate-like CD8+ T cell differentiation via NKT2 induction.2018

    • 著者名/発表者名
      Kojo S, Ohno-Oishi M, Wada H, Nieke S, Muroi S, Taniuchi I
    • 学会等名
      The 3rd International Conference on Innate Lymphoid Cells.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] An enhancer RNA is a crucial target of Runx-dependent silencer for Cd4 gene repression2018

    • 著者名/発表者名
      香城 諭, 室井佐和子, 谷内一郎
    • 学会等名
      第28回 Kyoto T Cell Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 新たなT細胞分化制御機構を発見 -Cd4サイレンサー非依存的なCd4遺伝子発現制御-

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2018/20180905_1/index.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

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