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離散原像問題の解析と応用

研究課題

研究課題/領域番号 18H04113
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分61:人間情報学およびその関連分野
研究機関京都大学

研究代表者

阿久津 達也  京都大学, 化学研究所, 教授 (90261859)

研究分担者 永持 仁  京都大学, 情報学研究科, 教授 (70202231)
細川 浩  京都大学, 情報学研究科, 講師 (90359779)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
43,420千円 (直接経費: 33,400千円、間接経費: 10,020千円)
2021年度: 10,530千円 (直接経費: 8,100千円、間接経費: 2,430千円)
2020年度: 10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円)
2019年度: 10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円)
2018年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
キーワード逆問題 / ニューラルネットワーク / 整数計画法 / ケモインフォマティクス / バイオインフォマティクス / グラフアルゴリズム / 特徴ベクトル / 生成AI
研究成果の概要

離散データを入力としてその特性などを出力とする予測関数を機械学習法などで得た後で、望ましい特性を与えてその逆像を計算することにより新規の構造データを生成するという離散原像問題について、化学構造の設計を主対象に研究を行い、混合整数線形計画法に基づく実用的な手法を開発した。予測関数としては主にニューラルネットワークを用い、逆像問題を効率的に解くために化学構造を階層的に表現する二層モデルなどの新たな概念を提案し、中規模の化学構造について現実的な時間で離散逆像問題が解けることを示した。一方、理論的観点からは、線形閾値関数に基づく自己符号化器の圧縮能力と頂点数などの関係を解析するなどの成果を得た。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究により、新規構造データ生成のための新たな方法論である離散原像問題という枠組みを確立した。原像(逆像)の計算自体は一般に計算困難なクラスに属するが、混合整数線形計画法を効果的に適用するための計算手法や数理モデルを開発し、中規模の化学構造データに対し、実際に原像が計算可能なことを示した。近年、生成AIが注目を集めているが、既存手法とは大きく異なる方法論を示したこともあり、独創的でかつ発展性の高い成果が得られたと考えられる。
この方法論を発展・拡張することにより新規で有用な化合物、さらには、タンパク質などの設計につながる可能性があり、社会的観点からも応用可能性の高い成果が得られたと考えられる。

報告書

(5件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (57件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (28件) (うち国際共著 13件、 査読あり 28件、 オープンアクセス 12件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 19件、 招待講演 8件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] Monash University(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] 国立交通大学(その他の国・地域)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Manchester(英国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] The University of Hong Kong(中国)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Monash University(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] A Method for Molecular Design Based on Linear Regression and Integer Programming2022

    • 著者名/発表者名
      Zhu Jianshen、Azam Naveed A.、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Proc. 12th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics

      巻: N/A ページ: 21-28

    • DOI

      10.1145/3510427.3510431

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Adjustive Linear Regression and Its Application to the Inverse QSAR2022

    • 著者名/発表者名
      Zhu Jianshen、Haraguchi Kazuya、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Proc. 15th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies - BIOINFORMATICS

      巻: N/A ページ: 144-151

    • DOI

      10.5220/0010853700003123

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of periodic attractors in Boolean networks using a priori information2022

    • 著者名/発表者名
      Munzner Ulrike、Mori Tomoya、Krantz Marcus、Klipp Edda、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      PLOS Computational Biology

      巻: 18 号: 1 ページ: e1009702-e1009702

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1009702

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A novel graph convolutional neural network for predicting interaction sites on protein kinase inhibitors in phosphorylation2022

    • 著者名/発表者名
      Wang Feiqi、Chen Yun-Ti、Yang Jinn-Moon、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 229-229

    • DOI

      10.1038/s41598-021-04230-7

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A novel method for inference of acyclic chemical compounds with bounded branch-height based on artificial neural networks and integer programming2021

    • 著者名/発表者名
      Azam Naveed Ahmed、Zhu Jianshen、Sun Yanming、Shi Yu、Shurbevski Aleksandar、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Algorithms for Molecular Biology

      巻: 16 号: 1 ページ: 18-18

    • DOI

      10.1186/s13015-021-00197-2

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 機械学習QSARの整数計画法に基づく逆解析法2021

    • 著者名/発表者名
      NAGAMOCHI Hiroshi、ZHU Jianshen、AZAM Naveed Ahmed、HARAGUCHI Kazuya、ZHAO Liang、AKUTSU Tatsuya
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 20 号: 3 ページ: 106-111

    • DOI

      10.2477/jccj.2021-0030

    • NAID

      130008130265

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An Improved Integer Programming Formulation for Inferring Chemical Compounds with Prescribed Topological Structures2021

    • 著者名/発表者名
      Zhu Jianshen、Azam Naveed Ahmed、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Computer Science

      巻: 12798 ページ: 197-209

    • DOI

      10.1007/978-3-030-79457-6_17

    • ISBN
      9783030794569, 9783030794576
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Inverse QSAR Method Based on Decision Tree and Integer Programming2021

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Kouki、Zhu Jianshen、Azam Naveed Ahmed、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Computer Science

      巻: 12837 ページ: 628-644

    • DOI

      10.1007/978-3-030-84529-2_53

    • ISBN
      9783030845285, 9783030845292
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Discrimination of attractors with noisy nodes in Boolean networks2021

    • 著者名/発表者名
      Cheng Xiaoqing、Ching Wai-Ki、Guo Sini、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Automatica

      巻: 130 ページ: 109630-109630

    • DOI

      10.1016/j.automatica.2021.109630

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Uncovering and classifying the role of driven nodes in control of complex networks2021

    • 著者名/発表者名
      Yuma Shinzawa, Tatsuya Akutsu and Jose C. Nacher
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 9627-9627

    • DOI

      10.1038/s41598-021-88295-4

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Probabilistic Critical Controllability Analysis of Protein Interaction Networks Integrating Normal Brain Ageing Gene Expression Profiles2021

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Eimi、Akutsu Tatsuya、Nacher Jose C.
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 18 ページ: 9891-9891

    • DOI

      10.3390/ijms22189891

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An Inverse QSAR Method Based on a Two-Layered Model and Integer Programming2021

    • 著者名/発表者名
      Shi Yu、Zhu Jianshen、Azam Naveed Ahmed、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 6 ページ: 2847-2847

    • DOI

      10.3390/ijms22062847

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] ReCGBM: a gradient boosting-based method for predicting human dicer cleavage sites2021

    • 著者名/発表者名
      Liu Pengyu、Song Jiangning、Lin Chun-Yu、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 22 号: 1 ページ: 63-63

    • DOI

      10.1186/s12859-021-03993-0

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Weighted minimum feedback vertex sets and implementation in human cancer genes detection2021

    • 著者名/発表者名
      Li Ruiming、Lin Chun-Yu、Guo Wei-Feng、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 22 号: 1 ページ: 143-143

    • DOI

      10.1186/s12859-021-04062-2

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular Design Based on Artificial Neural Networks, Integer Programming and Grid Neighbor Search2021

    • 著者名/発表者名
      Azam Naveed Ahmed、Zhu Jianshen、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Proc. 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine

      巻: N/A ページ: 360-363

    • DOI

      10.1109/bibm52615.2021.9669710

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel method for inference of chemical compounds of cycle index two with desired properties based on artificial neural networks and integer programming2020

    • 著者名/発表者名
      Jianshen Zhu, Chenxi Wang, Aleksandar Shurbevski, Hiroshi Nagamochi,Tatsuya Akutsu
    • 雑誌名

      Algorithms

      巻: 13 号: 5 ページ: 124-124

    • DOI

      10.3390/a13050124

    • NAID

      120006993972

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparison of Pseudoknotted RNA Secondary Structures by Topological Centroid Identification and Tree Edit Distance2020

    • 著者名/発表者名
      Wang Feiqi、Akutsu Tatsuya、Mori Tomoya
    • 雑誌名

      Journal of Computational Biology

      巻: 27 号: 9 ページ: 1443-1451

    • DOI

      10.1089/cmb.2019.0512

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extracting boolean and probabilistic rules from trained neural networks2020

    • 著者名/発表者名
      Liu Pengyu、Melkman Avraham A.、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Neural Networks

      巻: 126 ページ: 300-311

    • DOI

      10.1016/j.neunet.2020.03.024

    • NAID

      120006936364

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] A New Integer Linear Programming Formulation to the Inverse QSAR/QSPR for Acyclic Chemical Compounds Using Skeleton Trees2020

    • 著者名/発表者名
      Zhang Fan、Zhu Jianshen、Chiewvanichakorn Rachaya、Shurbevski Aleksandar、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Computer Science

      巻: 12114 ページ: 433-444

    • DOI

      10.1007/978-3-030-55789-8_38

    • NAID

      120006893967

    • ISBN
      9783030557881, 9783030557898
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Convolutional neural network approach to lung cancer classification integrating protein interaction network and gene expression profiles2019

    • 著者名/発表者名
      Teppei Matsubara, Tomoshiro Ochiai, Morihiro Hayashida, Tatsuya Akutsu and Jose C. Nacher
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology

      巻: 17 号: 03 ページ: 1940007-1940007

    • DOI

      10.1142/s0219720019400079

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deep learning with evolutionary and genomic profiles for identifying cancer subtypes2019

    • 著者名/発表者名
      C-Y. Lin, P. Ruan, R. Li, J-M. Yang, S. See, J. Song, T. Akutsu
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology

      巻: 17 号: 03 ページ: 1940005-1940005

    • DOI

      10.1142/s0219720019400055

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of the structure of a probabilistic Boolean network from samples including frequencies of outcomes2019

    • 著者名/発表者名
      T. Akutsu, A. A. Melkman
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems

      巻: 30 号: 8 ページ: 2383-2396

    • DOI

      10.1109/tnnls.2018.2884454

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Probabilistic controllability approach to metabolic fluxes in normal and cancer tissues2019

    • 著者名/発表者名
      Jean-Marc Schwartz, Hiroaki Otokuni, Tatsuya Akutsu and Jose C. Nacher
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 2725-2725

    • DOI

      10.1038/s41467-019-10616-z

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] On the Number of Driver Nodes for Controlling a Boolean Network when the Targets are Restricted to Attractors2019

    • 著者名/発表者名
      Wenpin Hou, Peying Ruan, Wai-Ki. Ching, Tatsuya Akutsu
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biolog

      巻: 463 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2018.12.012

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Resource Cut, a New Bounding Procedure to Algorithms for Enumerating Tree-Like Chemical Graphs2019

    • 著者名/発表者名
      Yuhei Nishiyama, Aleksandar Shurbevski , Hiroshi Nagamochi, Tatsuya Akutsu
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 16 号: 1 ページ: 77-90

    • DOI

      10.1109/tcbb.2018.2832061

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identifying a Probabilistic Boolean Threshold Network From Samples2018

    • 著者名/発表者名
      Avraham A. Melkman, Xiaoqing Cheng, Wai-Ki Ching, Tatsuya Akutsu
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems

      巻: 29 号: 4 ページ: 869-881

    • DOI

      10.1109/tnnls.2017.2648039

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Enumerating Substituted Benzene Isomers of Tree-Like Chemical Graphs2018

    • 著者名/発表者名
      J. Li, H. Nagamochi, T. Akutsu
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Trans. Comput. Biology Bioinform.

      巻: 15(2) 号: 2 ページ: 633-646

    • DOI

      10.1109/tcbb.2016.2628888

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Determining the minimum number of protein-protein interactions required to support known protein complexes2018

    • 著者名/発表者名
      Natsu Nakajima, Morihiro Hayashida, Jesper Jansson, Osamu Maruyama, Tatsuya Akutsu
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 13 号: 4 ページ: e0195545-e0195545

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0195545

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Adjustive Linear Regression and Its Application to the Inverse QSAR2022

    • 著者名/発表者名
      Zhu Jianshen、Haraguchi Kazuya、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 学会等名
      15th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies - BIOINFORMATICS
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A Method for Molecular Design Based on Linear Regression and Integer Programming2022

    • 著者名/発表者名
      Zhu Jianshen、Azam Naveed A.、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 学会等名
      12th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Graph Theoretic Approaches to Analysis and Control of Biological Networks2021

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Akutsu
    • 学会等名
      2021 IEEE the 9th International Conference on Bioinformatics and Computational Biology
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Control and Observation of Boolean Networks when Targets are Restricted to Attractors2021

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Akutsu
    • 学会等名
      Modeling and Control of Boolean Dynamical Systems (Workshop in European Control Conference 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] On the Compressive Power of Boolean Threshold Autoencoders2021

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Akutsu
    • 学会等名
      The 1st Online Conference on Algorithms
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 機械学習QSARの整数計画法に基づく逆解析法2021

    • 著者名/発表者名
      NAGAMOCHI Hiroshi、ZHU Jianshen、AZAM Naveed Ahmed、HARAGUCHI Kazuya、ZHAO Liang、AKUTSU Tatsuya
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2021年春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] An Improved Integer Programming Formulation for Inferring Chemical Compounds with Prescribed Topological Structures2021

    • 著者名/発表者名
      Zhu Jianshen、Azam Naveed Ahmed、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 学会等名
      34th International Conference on Industrial, Engineering and Other Applications of Applied Intelligent Systems
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] An Inverse QSAR Method Based on Decision Tree and Integer Programming2021

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Kouki、Zhu Jianshen、Azam Naveed Ahmed、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 学会等名
      17th International Conference on Intelligent Computing
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular Design Based on Artificial Neural Networks, Integer Programming and Grid Neighbor Search2021

    • 著者名/発表者名
      Azam Naveed Ahmed、Zhu Jianshen、Haraguchi Kazuya、Zhao Liang、Nagamochi Hiroshi、Akutsu Tatsuya
    • 学会等名
      2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A New Integer Linear Programming Formulation to the Inverse QSAR/QSPR for Acyclic Chemical Compounds Using Skeleton Trees2020

    • 著者名/発表者名
      F. Zhang, J. Jianshen, R. Chiewvanichakorn , A. Shurbevski, H. Nagamochi, T. Akutsu
    • 学会等名
      33rd International Conference on Industrial, Engineering and Other Applications of Applied Intelligent Systems (IEA/AIE 2020)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A novel method for the inverse QSAR/QSPR to monocyclic chemical compounds based on artificial neural networks and integer programming2020

    • 著者名/発表者名
      R. Ito, N. A. Azam, C. Wang, A. Shurbevski, H. Nagamochi, T. Akutsu
    • 学会等名
      21st International Conference on Bioinformatics & Computational Biology
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A novel method for the inverse QSAR/QSPR based on artificial neural networks and mixed integer linear programming with guaranteed admissibility2020

    • 著者名/発表者名
      N. A. Azam, R. Chiewvanichakorn, F. Zhang, A. Shurbevski, H. Nagamochi, T. Akutsu
    • 学会等名
      13th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] A method for the inverse QSAR/QSPR based on artificial neural networks and mixed integer linear programming2020

    • 著者名/発表者名
      R. Chiewvanichakorn, C. Wang, Z. Zhan, A. Shurbevski, H. Nagamochi, T. Akutsu
    • 学会等名
      12th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A method for the inverse QSAR/QSPR based on artificial neural networks and mixed integer linear programming2019

    • 著者名/発表者名
      R. Chiewvanichakorn, C. Wang, Z. Zhan, A. Shurbevski, H. Nagamochi, T. Akutsu
    • 学会等名
      第123回MPS・第58回BIO合同研究発表会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Graph theoretic approaches to controllability of biological networks2019

    • 著者名/発表者名
      T. Akutsu
    • 学会等名
      Workshop on Bioinformatics and Data Analysis
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞種情報解析における数理モデル概説2019

    • 著者名/発表者名
      阿久津達也
    • 学会等名
      第1回 幹細胞情報学イニシアティブ研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] T. Akutsu2019

    • 著者名/発表者名
      On control and observation of attractors in Boolean networks
    • 学会等名
      International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Integration and Analysis of Heterogeneous Biological Data via Convolutional Neural Networks and Matrix Factorization2019

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Akutsu
    • 学会等名
      9th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A Mixed Integer Linear Programming Formulation to Artificial Neural Networks2019

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Akutsu, Hiroshi Nagamochi
    • 学会等名
      2nd International Conference on Information Science and System
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Algorithms for Analysis and Control of Boolean Networks2018

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Akutsu
    • 学会等名
      5th International Conference on Algorithms for Computational Biology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Deep Learning with Evolutionary and Genomic Profiles for Identifying Cancer Subtypes2018

    • 著者名/発表者名
      Chun-Yu Lin, Ruiming Li, Tatsuya. Akutsu, Peiyng Ruan, Simon Sea, Jinn-Moon. Yang
    • 学会等名
      International Workshop on Cancer Bioinformatics and Intelligent Medicine 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Convolutional Neural Network Approach to Lung Cancer Classification Integrating Protein Interaction Network and Gene Expression Profiles2018

    • 著者名/発表者名
      Teppei Matsubara, Jose C. Nacher, Tomoshiro Ochiai, Morihiro Hayashida, Tatsuya Akutsu
    • 学会等名
      International Workshop on Cancer Bioinformatics and Intelligent Medicine 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] New and Improved Algorithms for Unordered Tree Inclusion2018

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Akutsu, Jesper Jansson, Ruiming Li, Atsuhiro Takasu, Takeyuki Tamura
    • 学会等名
      29th International Symposium on Algorithms and Computation
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] バイオインフォマティクス, Python による実践レシピ2020

    • 著者名/発表者名
      Antao,T. (著)、阿久津 達也、竹本和広 (訳)
    • 総ページ数
      320
    • 出版者
      朝倉書店
    • ISBN
      9784254122541
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-01-30  

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