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全ゲノム解析を用いた大腸癌肝転移のがんゲノム進化の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18H06154
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
審査区分 0901:腫瘍学およびその関連分野
研究機関北海道大学

研究代表者

川俣 太  北海道大学, 大学病院, 医員 (70825629)

研究期間 (年度) 2018-08-24 – 2019-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2018年度)
配分額 *注記
2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード大腸癌 / 大腸癌肝転移 / ゲノム解析 / ドライバー遺伝子
研究実績の概要

[背景] 大腸癌の原発巣と転移巣での遺伝子変異の詳細は不明であり、化学療法や分子標的治療の有効性の個人差の原因となる可能性がある。教室では大腸癌の原発巣、肝転移巣の腫瘍部、非腫瘍部を全ゲノム解析し、転移巣で特異的に増減する遺伝子の絞り込みに成功した。
[目的] 肝転移形成過程におけるこれらの「大腸癌肝転移におけるドライバー遺伝子」の機能を解明することが目的である。1) 臨床試料、2) 各々の標的遺伝子導入/欠失大腸癌細胞株、を用いてゲノム・エピゲノム解析を行うものである。
[成果] 臨床試料の解析:肝転移を来さなかった大腸癌の癌部・非癌部 (大腸)組織 (各n=3)、肝転移を来した大腸癌の癌・非癌部 (大腸)組織 (各n=4)、肝転移巣の癌・非癌部 (肝)組織 (各n=3)、計20試料をcDNA array解析に供した。肝転移を来した大腸癌の原発巣、あるいは、肝転移巣で特異的に変化する遺伝子群が同定され、転移との関係が未報告のものもあった。同じ患者組織からmicro RNA、タンパク質、ゲノムDNA、FFPE組織切片を作成した(保管中)。Proteomics解析系を確立し、約4000分子の検出に成功した。また、幾つかのタンパク質の免疫染色を行った。
In vitro解析の準備:標的候補遺伝子の欠失、あるいは、安定高発現の細胞株を作成中である。G-Luc, Luc, Td-Tomato の発現細胞は作成済である。
[まとめ] 申請者の一身上の都合により研究を中止するが、上記の成果と抽出、調製された試料は所属研究室に適切に保管され、後任者がすぐに利用できるようになっている。今後、micro RNA、Proteomics解析により真の注目対象分子を絞り込み、それらの発現と機能を制御する遺伝子変異を同定すれば、大腸癌肝転移のリスク予測と新規治療標的が明らかになるはずである。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(1件)
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Tumor budding and human chorionic gonadotropin-β expression correlate with unfavorable patient outcome in colorectal carcinoma.2018

    • 著者名/発表者名
      Konishi Y, Kawamata F, Nishihara H, Homma S, Kato Y, Tsuda M, Kohsaka S, Einama T, Liu C, Yoshida T, Nagatsu A, Tanino M, Tanaka S, Kawamura H, Kamiyama T, Taketomi A.
    • 雑誌名

      Med Oncol.

      巻: 35 号: 7 ページ: 104-104

    • DOI

      10.1007/s12032-018-1164-x

    • NAID

      120006649177

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ゲノム解析を利用した大腸癌原発巣およびその肝転移巣に対する新規治療戦略2018

    • 著者名/発表者名
      川俣太、沢田尭史、市川伸樹、吉田雅、柴崎晋、本間重紀、川村秀樹、武冨紹信
    • 学会等名
      第39回日本大腸肛門病学会北海道支部例会(札幌)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] pT1(SM)早期大腸癌の臨床病理学的特徴と治療成績2018

    • 著者名/発表者名
      吉田雅、本間重紀、川俣太、市川伸樹、柴崎晋、川村秀樹、武冨紹信
    • 学会等名
      第89回大腸癌研究会(新潟)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] pT1(SM)早期大腸癌の臨床病理学的特徴と治療成績2018

    • 著者名/発表者名
      吉田雅、本間重紀、川俣太、市川伸樹、柴崎晋、川村秀樹、武冨紹信
    • 学会等名
      第73回日本大腸肛門病学会学術集会(東京)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

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公開日: 2018-08-27   更新日: 2019-12-27  

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