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タンパク質の細胞内局在に基づく糖鎖修飾糖種分布の作成

研究課題

研究課題/領域番号 18J02059
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

越中谷 賢治  国立研究開発法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 特別研究員(PD) (90806499)

研究期間 (年度) 2018-04-25 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2018年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードGlycosylation / Protein / Sugar type / Bioinformatics / GPI modification
研究実績の概要

本年度は、タンパク質の細胞内局在に寄与する因子による分類と糖種の相関をもとに、タンパク質の細胞内局在性に応じた糖鎖修飾分布を明らかにした。加えて、バイオインフォマティクス解析の結果を実験的に明らかにするためにモデルタンパク質を選定し局在を人工的にコントロール可能な手法を構築した。
[A] 植物タンパク質を利用した、ヒト培養細胞内の様々なオルガネラに輸送可能な評価モデルの構築。植物由来のGPIアンカー型タンパク質CEBiPをもとに、局在性に関与するシグナル領域前後にAcGFPを導入し、最適な条件を検討した。GPI修飾に寄与するAS領域の前にGFPを導入することで、適切にオルガネラを経由し細胞膜に局在化することが本研究で示された。
> 2018年7月にチェコ・プラハで行われたThe 43rd FEBS Congressにてポスター発表行った。また、当該論文を投稿準備中である。
[B] 膜タンパク質の膜貫通領域を用いてオルガネラ膜局在の構築。小胞体やゴルジ体に局在化する膜タンパク質を対象に、モデルタンパク質を選定し膜貫通領域をAcGFPに導入し、HeLa細胞を用いてオルガネラ局在性を確認した。その結果、膜貫通領域周辺を蛍光タンパク質に導入することで、Nativeタンパク質と同様に輸送されることが確認された。この結果により、細胞内の様々なオルガネラに目的のキメラタンパク質を輸送する基盤が構築できたことが示された。
> Proceedings of the Eighteenth International Symposium on Advanced Fluid Informationに投稿した。また、2018年11月に日本・仙台で行われた15th International Conference on Flow Dynamicにて口頭発表を行った。

現在までの達成度 (段落)

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

今後の研究の推進方策

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

報告書

(1件)
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] The Role of Signal-anchor Region of Type 2 Transmembrane Protein in Subcellular localization2018

    • 著者名/発表者名
      Kenji ETCHUYA, Tatsuki KIKEGAWA, Makoto Ohta, Yuri MUKAI
    • 雑誌名

      Proceedings of the Eighteenth International Symposium on Advanced Fluid Information

      巻: - ページ: 130-131

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] The Role of Signal-anchor Region of Type 2 Transmembrane Protein in Subcellular localization2018

    • 著者名/発表者名
      Kenji ETCHUYA, Tatsuki KIKEGAWA, Makoto Ohta, Yuri MUKAI
    • 学会等名
      Fifteenth International Conference on Flow Dynamics
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparative analysis of GPI modification mechanisms between human and rice proteins2018

    • 著者名/発表者名
      Kenji ETCHUYA, Tatsuki KIKEGAWA, Hiromu SUGITA, Hanae KAKU, Yuri MUKAI
    • 学会等名
      The 43rd FEBS Congress
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2018-05-01   更新日: 2024-03-26  

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