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ゲノムワイドなアミノ酸配列比較に基づく形態形質進化の分子基盤解明

研究課題

研究課題/領域番号 18J13859
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 進化生物学
研究機関国立遺伝学研究所 (2019)
総合研究大学院大学 (2018)

研究代表者

飯塚 朋代  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2018-04-25 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2019年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2018年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード並行進化 / 収れん進化 / 形態進化 / 担子菌類 / 隔壁孔キャップ / 比較ゲノム解析 / 平行進化
研究実績の概要

形態形質の進化は生物多様性を生み出す主要な要因の1つである。本研究では担子菌門ハラタケ亜門の隔壁微細構造にみられる隔壁孔キャップ(SPC)に着目した。SPCの形態形質には主に3タイプ(Vesiculate, Imperforate, Perforate)が存在し、中でもImperforate SPCからPerforate SPCへの進化では収れん進化現象が起きていることが知られている。しかし、この形態の違いをもたらした遺伝的背景は不明である。そこで申請者はSPCの形態形質の違いと相関する変異を担子菌ゲノムから検出し、形態進化をもたらした候補遺伝子を得ることを目的として比較ゲノム解析を行った。その結果、タンパク質コード遺伝子spc33が検出された。この遺伝子ではPerforate SPCがみられる複数の系統で同一のアミノ酸置換が生じていた。加えてシンテニー解析、祖先配列推定、遺伝子系統解析の結果、これらのアミノ酸置換は水平遺伝子移行の結果ではなく、平行置換の結果であると推定された。このことから、Perforateタイプのspc33はそれぞれのPerforateタイプの系統における独立な進化イベントにより獲得されたことが示された。一方、Vesiculate SPCを持つ種のゲノム配列にはspc33遺伝子がコードされていないことが明らかになった。そこでVesiculateタイプ種におけるspc33の祖先遺伝子を調べた結果、MRCK Ser-Thr protein kinaseが検出された。以上の結果により、spc33がSPCの形態進化における有力な候補遺伝子であることを示したと共に、SPCの形態レベルの進化に伴うspc33遺伝子の配列レベルでの進化を明らかにした。これにより、形態進化の遺伝基盤を知るための基礎的な知見を提供することができた。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2019 2018

すべて 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [学会発表] Genomic changes associated with morphological evolution of septal pore cap in Agaricomycotina2019

    • 著者名/発表者名
      飯塚朋代, 池尾一穂
    • 学会等名
      日本進化学会第21回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Genome-wide survey for understanding genetic basis of morphological evolution of septal pore cap in Agaricomycetes2018

    • 著者名/発表者名
      飯塚朋代
    • 学会等名
      11th International Mycological Congress
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2018-05-01   更新日: 2024-03-26  

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