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NMRを用いたALS関連タンパク質SOD1の線維形成メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 18J22192
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物物理学
研究機関京都大学

研究代表者

岩川 直都  京都大学, 工学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2018-04-25 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2020年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2019年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2018年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワードアミロイド線維 / Rheo-NMR / 構造変化 / ALS / SOD1 / アミロイド / 高分子混雑 / NMR / superoxide dismutase 1 / せん断力 / 構造安定性
研究実績の概要

細胞内を模倣した混雑環境におけるアミロイド形成機構の解析
昨年度までの研究により、細胞内を模倣した混雑環境ではoff-pathway状態が安定化されることによりSOD1のアミロイド線維形成が抑制されることを明らかにしている。
本年度は、このoff-pathway状態、特に混雑分子との結合状態についてより詳細に解析するために、NMR滴定実験を行った。NMR滴定実験の結果、SOD1は混雑分子と弱く相互作用していることが明らかとなった。さらに、変性構造のSOD1について同様のNMR滴定実験を行うことで、比較的強い相互作用が存在することを明らかにした。これらの相互作用が、線維の前駆体である混雑分子と結合していない変性状態の存在比を低下させ、アミロイド線維形成を抑制する機構を明らかにした。以上の研究成果をまとめ、国際学術雑誌へ論文を投稿した。

Rheo-NMR法を用いたアミロイド形成機構の解析
アミロイド線維形成過程におけるSOD1のNMRシグナルの時間変化を解析した。アミロイド形成に伴い、多くのピークは一様なピーク強度減少を示す一方、一部の残基において特徴的な強度変化を示すピークが見られた。特徴的な強度変化として、①遅延時間で他のピークよりも大きくシグナル強度が減少するもの、②線維形成終了後にシグナル強度が0にならずNMRシグナルとして観測可能なものの2点が挙げられる。これらの知見は、①アミロイド形成に先立ち構造が壊れる領域および②アミロイド線維またはオリゴマー中で柔軟な構造を有する領域であることを示唆している。さらに、CLEANEX-PM測定により、遅延時間において水素交換速度が抑制される残基を特定した。これは、これらの残基を介した分子間相互作用により線維の核が形成することを示唆している。これらは、SOD1のアミロイド形成に関する初めての残基分解能での構造変化情報であると考えている。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] Stockholm University(スウェーデン)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Transient Diffusive Interactions with a Protein Crowder Affect Aggregation Processes of Superoxide Dismutase 1 β-Barrel2021

    • 著者名/発表者名
      Iwakawa Naoto、Morimoto Daichi、Walinda Erik、Leeb Sarah、Shirakawa Masahiro、Danielsson Jens、Sugase Kenji
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 125 号: 10 ページ: 2521-2532

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c11162

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Conformational exchange in the potassium channel blocker ShK2019

    • 著者名/発表者名
      Iwakawa Naoto、Baxter Nicola J.、Wai Dorothy C. C.、Fowler Nicholas J.、Morales Rodrigo A. V.、Sugase Kenji、Norton Raymond S.、Williamson Mike P.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1038/s41598-019-55806-3

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Rheo-NMR法を用いたSOD1アミロイド形成機構の高分解能構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      岩川 直都、森本 大智、Erik Walinda、白川 昌宏、菅瀬 謙治
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic Analysis of Amyloid Formation of Superoxide Dismutase 1 Using Rheo-NMR Spectroscopy2019

    • 著者名/発表者名
      Naoto Iwakawa、Daichi Morimoto、Erik Walinda、Masahiro Shirakawa、Kenji Sugase
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Elucidation of the Fibrillization Mechanism of an ALS-Related Protein SOD1 by Using Novel Rheo-NMR Spectroscopy2018

    • 著者名/発表者名
      Naoto Iwakawa, Daichi Morimoto, Erik Walinda, Masahiro Shirakawa, Kenji Sugase
    • 学会等名
      28th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2018-05-01   更新日: 2024-03-26  

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