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ソフトマター中のマイクロマシンの非平衡ダイナミクス

研究課題

研究課題/領域番号 18K03567
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
研究機関東京都立大学

研究代表者

好村 滋行  東京都立大学, 理学研究科, 准教授 (90234715)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードマイクロマシン / ソフトマター / マイクロスイマー / マイクロレオロジー / ラチェット
研究成果の概要

本研究の目的は、ソフトマター中のマイクロマシンが示す自律的遊泳や能動輸送などの非平衡ダイナミクスの理論を、ソフトマター物理学や非平衡物理学に立脚して確立することである。具体的な研究成果としては、高分子ゲル中のマイクロマシンの遊泳挙動について調べ、ゲルの不均一構造がその運動に及ぼす影響を明らかにした。また、タンパク質や酵素の内部自由度の非平衡性に着目し、熱的に駆動されるマイクロマシンが、熱運動のみによって方向性のある運動を獲得できることを示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

微生物の遊泳の問題は古くから考えられてきたが、多くの場合は環境が水のような純粘性流体であった。しかし、微生物の環境は多くの場合、高分子ゲルのようなソフトマターであり、粘弾性的な性質を示す。ソフトマターの特徴は、内部に特徴的な構造や時間を有していることである。我々の研究により、マイクロマシンの大きさとソフトマターの内部構造の競合により、ソフトマター中では新しい遊泳機構が存在することがわかった。我々の研究は、マイクロマシンとマイクロレオロジーの研究を融合する新しい試みである。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (54件)

すべて 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (12件) 雑誌論文 (17件) (うち国際共著 8件、 査読あり 16件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 6件、 招待講演 4件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] Tel Aviv University(イスラエル)

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  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

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  • [国際共同研究] Institut Curie(フランス)

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  • [国際共同研究] University of New South Wales(オーストラリア)

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  • [国際共同研究] 国立清華大学/国立中央大学(その他の国・地域)

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  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

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  • [国際共同研究] Universite Paris Diderot(フランス)

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  • [国際共同研究] Tel Aviv University(イスラエル)

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  • [国際共同研究] 国立清華大学/国立中央大学(その他の国・地域)

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  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

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  • [国際共同研究] Universite Paris Diderot(フランス)

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  • [国際共同研究] Tel Aviv University/Weizmann Institute of Science(イスラエル)

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  • [雑誌論文] Irreversibility and entropy production of a thermally driven micromachine2021

    • 著者名/発表者名
      Sou Isamu、Hosaka Yuto、Yasuda Kento、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      Physica A: Statistical Mechanics and its Applications

      巻: 562 ページ: 125277-125277

    • DOI

      10.1016/j.physa.2020.125277

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      2020 実績報告書
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  • [雑誌論文] Autonomous elastic microswimmer2021

    • 著者名/発表者名
      Era Katsutomo、Koyano Yuki、Hosaka Yuto、Yasuda Kento、Kitahata Hiroyuki、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      EPL (Europhysics Letters)

      巻: 133 号: 3 ページ: 34001-34001

    • DOI

      10.1209/0295-5075/133/34001

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    • 著者名/発表者名
      Liang Chia-Chun、Yasuda Kento、Komura Shigeyuki、Wu Kuo-An、Chen Hsuan-Yi
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 101 号: 4 ページ: 042601-042601

    • DOI

      10.1103/physreve.101.042601

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  • [雑誌論文] Brownian Motion Confined in a Brownian Surface2020

    • 著者名/発表者名
      Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      JPSJ News and Comments

      巻: 17 ページ: 08-08

    • DOI

      10.7566/jpsjnc.17.08

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      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Reciprocal microswimmers in a viscoelastic fluid2020

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Kento、Kuroda Mizuki、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      Physics of Fluids

      巻: 32 号: 9 ページ: 093102-093102

    • DOI

      10.1063/5.0018540

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      2020 実績報告書
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  • [雑誌論文] Dynamics of passive and active membrane tubes2020

    • 著者名/発表者名
      Al-Izzi Sami C.、Sens Pierre、Turner Matthew S.、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      Soft Matter

      巻: 16 号: 40 ページ: 9319-9330

    • DOI

      10.1039/d0sm01290d

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      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Mechanochemical enzymes and protein machines as hydrodynamic force dipoles: the active dimer model2020

    • 著者名/発表者名
      Hosaka Yuto、Komura Shigeyuki、Mikhailov Alexander S.
    • 雑誌名

      Soft Matter

      巻: 16 号: 47 ページ: 10734-10749

    • DOI

      10.1039/d0sm01138j

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      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Lateral diffusion on a frozen random surface2020

    • 著者名/発表者名
      Ohta Takao、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      EPL (Europhysics Letters)

      巻: 132 号: 5 ページ: 50007-50007

    • DOI

      10.1209/0295-5075/132/50007

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      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Shear viscosity of two-state enzyme solutions2020

    • 著者名/発表者名
      Hosaka Yuto、Komura Shigeyuki、Andelman David
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 101 号: 1 ページ: 012610-012610

    • DOI

      10.1103/physreve.101.012610

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    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Hydrodynamic interaction between two elastic microswimmers2019

    • 著者名/発表者名
      Kuroda Mizuki、Yasuda Kento、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      Journal of the Physical Society of Japan

      巻: 88 号: 5 ページ: 054804-054804

    • DOI

      10.7566/jpsj.88.054804

    • NAID

      40021885959

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      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nonequilibrium probability flux of a thermally driven micromachine2019

    • 著者名/発表者名
      Sou Isamu、Hosaka Yuto、Yasuda Kento、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 100 号: 2 ページ: 022607-022607

    • DOI

      10.1103/physreve.100.022607

    • NAID

      130008156909

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      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pattern formation of skin cancers: Effects of cancer proliferation and hydrodynamic interactions2019

    • 著者名/発表者名
      Takuma Hoshino、Ming-Wei Liu、Kuo-An Wu、Hsuan-Yi Chen、Tatsuaki Tsuruyama,、Shigeyuki Komura
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 99 号: 3 ページ: 032416-032416

    • DOI

      10.1103/physreve.99.032416

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      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Thermal and active fluctuations of a compressible bilayer vesicle2018

    • 著者名/発表者名
      T V Sachin Krishnan, Kento Yasuda, Ryuichi Okamoto, and Shigeyuki Komura
    • 雑誌名

      Journal of Physics: Condensed Matter

      巻: 30 号: 17 ページ: 175101-175101

    • DOI

      10.1088/1361-648x/aab6c7

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      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamics of a bilayer membrane with membrane-solvent partial slip boundary conditions2018

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Kento、Okamoto Ryuichi、Komura Shigeyuki、Fournier Jean-Baptiste
    • 雑誌名

      Soft Materials

      巻: 16 号: 3 ページ: 186-191

    • DOI

      10.1080/1539445x.2018.1462830

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  • [雑誌論文] Three-disk microswimmer in a supported fluid membrane2018

    • 著者名/発表者名
      Ota Yui、Hosaka Yuto、Yasuda Kento、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 97 号: 5 ページ: 052612-052612

    • DOI

      10.1103/physreve.97.052612

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      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A three-sphere microswimmer in a structured fluid2018

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Kento、Okamoto Ryuichi、Komura Shigeyuki
    • 雑誌名

      EPL (Europhysics Letters)

      巻: 123 号: 3 ページ: 34002-34002

    • DOI

      10.1209/0295-5075/123/34002

    • NAID

      130008148111

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Linear response functions of an electrolyte solution in a uniform flow2018

    • 著者名/発表者名
      Adar Ram M.、Uematsu Yuki、Komura Shigeyuki、Andelman David
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 98 号: 3 ページ: 032604-032604

    • DOI

      10.1103/physreve.98.032604

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      2018 実施状況報告書
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  • [学会発表] 熱的に駆動されるマイクロマシンの遊泳効率2021

    • 著者名/発表者名
      曹勇, 保阪悠人, 安田健人, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 第76回年次大会
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      2020 実績報告書
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      江良勝智, 小谷野由紀, 保阪悠人, 安田健人, 北畑裕之, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 第76回年次大会
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  • [学会発表] 不均一な輸送係数を持つ二成分系のミクロ相分離ダイナミクス2021

    • 著者名/発表者名
      劉芳美, 好村滋行
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      2020 実績報告書
  • [学会発表] 層状弾性体における力学応答2021

    • 著者名/発表者名
      笹田智暉, 保阪悠人, 安田健人, 好村滋行
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  • [学会発表] 粘弾性流体中の相反マイクロスイマー2021

    • 著者名/発表者名
      安田健人, 黒田瑞季, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 第76回年次大会
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  • [学会発表] 反対称粘性率を持つ二次元圧縮性流体の流体力学的応答II2021

    • 著者名/発表者名
      保阪悠人, 好村滋行, David Andelman
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      日本物理学会 第76回年次大会
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  • [学会発表] 生体ナノマシンの状態サイクルモデルⅡ2020

    • 著者名/発表者名
      安田健人, 好村滋行
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      日本物理学会 2020年秋季大会
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      2020 実績報告書
  • [学会発表] 細胞シートにおける亀裂進展の理論モデル2020

    • 著者名/発表者名
      古屋智博, 作道直幸, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 2020年秋季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 反対称粘性率を持つ二次元圧縮性流体の流体力学的応答2020

    • 著者名/発表者名
      保阪悠人, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 2020年秋季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 熱的に駆動されるマイクロマシンのエントロピー生成2020

    • 著者名/発表者名
      好村滋行, 曹勇, 保阪悠人, 安田健人
    • 学会等名
      日本物理学会 2020年秋季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 自律的に速度を選択する弾性スイマー2020

    • 著者名/発表者名
      江良勝智, 小谷野由紀, 保阪悠人, 安田健人, 北畑裕之, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 2020年秋季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 自己推進粒子を用いた捕食者・被食者系のシミュレーション2020

    • 著者名/発表者名
      伊藤碧, 山下晃史, 松尾寛, 佐藤拓哉, 立木佑弥, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 2020年秋季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] A three-sphere microswimmer in a structured fluid2020

    • 著者名/発表者名
      Shigeyuki Komura
    • 学会等名
      Fluid-Structure Interactions: From Engineering to Biomimetic Systems
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 熱的に駆動するマイクロマシンの非平衡確率流2020

    • 著者名/発表者名
      好村滋行, 曹勇, 保阪悠人, 安田健人
    • 学会等名
      日本物理学会 第75回年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] オッド粘性率を持つ膜ドメインの流体力学2020

    • 著者名/発表者名
      保阪悠人, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 第75回年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 生体ナノマシンの状態サイクルモデル2020

    • 著者名/発表者名
      安田健人, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 第75回年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Thermally driven elastic micromachines2019

    • 著者名/発表者名
      Shigeyuki Komura
    • 学会等名
      Soft Matter Out of Equilibrium: from driven to active systems
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Shear viscosity of two-state enzyme solutions2019

    • 著者名/発表者名
      Yuto Hosaka, Shigeyuki Komura
    • 学会等名
      Soft Matter Out of Equilibrium: from driven to active systems
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Swimmer-microrheology2019

    • 著者名/発表者名
      Kento Yasuda and Shigeyuki Komura
    • 学会等名
      Soft Matter Out of Equilibrium: from driven to active systems
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 酵素溶液のずり粘性率2019

    • 著者名/発表者名
      保阪悠人, David Andelman, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 第74回年次大会
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  • [学会発表] 構造流体中の三つ玉スイマーの遊泳2019

    • 著者名/発表者名
      安田健人, 岡本隆一, 好村滋行
    • 学会等名
      日本物理学会 第74回年次大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Thermal and active fluctuations of a compressible bilayer vesicle2018

    • 著者名/発表者名
      Shigeyuki Komura
    • 学会等名
      27th International Liquid Crystal Conference
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Thermal and active fluctuations of a compressible bilayer vesicle2018

    • 著者名/発表者名
      Shigeyuki Komura
    • 学会等名
      Mechanics of Membranes: From Differential Geometry to Cell
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 好村滋行のバイオ・ソフトマター研究

    • URL

      https://www.comp.tmu.ac.jp/shigekomura/list-e.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 好村滋行のバイオ・ソフトマター研究

    • URL

      http://www.comp.tmu.ac.jp/shigekomura/

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書 2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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