| 研究課題/領域番号 |
18K03820
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分17050:地球生命科学関連
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| 研究機関 | 筑波大学 |
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研究代表者 |
石谷 佳之 筑波大学, 計算科学研究センター, 研究員 (60772043)
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| 研究分担者 |
氏家 由利香 高知大学, 教育研究部自然科学系理工学部門, 准教授 (20573041)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2020年度)
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| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
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| キーワード | 有孔虫 / SAR / 分岐年代推定 / カンブリア紀 / 放散虫 / 大規模遺伝子データ / 真核生物 / 発現遺伝子解析 / 大規模データ |
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| 研究成果の概要 |
人類を含め地球上の生物の進化の根幹となる真核生物の誕生と初期進化は、これまで化石記録や生物が寄与したと考えられる環境要素（例：酸素濃度）の変化などから調べられてきた。しかし、真核生物の初期進化は数十億年以上前と予測され、得られる情報量が制限される。そこで本研究では、全生物がもつ遺伝子情報に基づく分岐年代推定法に着目した。真核生物の初生的な祖先は「単細胞」であると考えられ、実際に単細胞真核生物は複数の系統的に主要なグループを構成している。本研究では単細胞真核生物や化石となる生物の遺伝子情報を収集し、真核生物を明らかにする。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究により真核生物全体の大規模分岐年代推定用データセットを作成した。また、分岐年代推定方法の検定を行い、①疑わしい化石記録の検出や②高精度に推定する手法を見出した。このことから、分岐年代推定法がただの推定だけではなく、化石記録の妥当性の検証方法としても応用可能となった。また、今回得られた推定結果を事前確率として用いることで、生物群毎の分岐年代推定を高精度に行え、今後、分岐年代推定が多く行われることが期待される。
今回、得られたSARグループの分岐がカンブリア紀初期の所謂「カンブリア大爆発」の時期であったことは、生物多様化の理解や現生生物型の生態系がいつ整ったかを理解するのに大いに貢献した。
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