• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

フェリチンを用いた新規「蛋白質ケージ構造解析法」の技術基盤の確立

研究課題

研究課題/領域番号 18K05314
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関東京工業大学

研究代表者

金丸 周司  東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (50376951)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード単粒子解析 / ケージ蛋白質 / 立体構造解析 / 構造解析 / 蛋白質ケージ / Scaffold / クライオ電顕 / scaffold / scafold
研究成果の概要

クライオ電顕単粒子解析法を用いて50kDa以下の小さい蛋白質の構造決定を目標として、まず大腸菌大量発現系を構築しフェリチン24量体蛋白質ケージの内部空洞に標的蛋白質を閉じ込めることに成功した。また、適切な精製タグを用いることで標的蛋白質の導入されたケージのみを選択的に精製することに成功した。
一方で、内部空洞における標的蛋白質の導入数は内部空間を狭くすることで、ある程度制御できることが分かったが、標的蛋白質の位置と方向をそろえることはリンカーの種類や長さを変えても困難であり、標的蛋白質の高分解能構造の取得には至らなかった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で開発したフェリチン24量体内部空洞に効率的に標的蛋白質を導入し、単離精製する方法は、内部空洞の大きさよりも小さい蛋白質であれば標的蛋白質の配列を変えることなく簡便に導入することが出来る。フェリチンのもつ高い熱安定性・pH安定性を利用することで内部空洞に導入した蛋白質に機能を改変せずに安定性を付加することができると期待される。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 4件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Rapid and sensitive SARS-CoV-2 detection using a homogeneous fluorescent immunosensor Quenchbody with crowding agents2022

    • 著者名/発表者名
      Zhu Bo、Nosaka Nobuyuki、Kanamaru Shuji、Dong Jinhua、Dai Yancen、Inoue Akihito、Yang Yinghui、Kobayashi Kaori、Kitaguchi Tetsuya、Iwasaki Hiroshi、Koike Ryuji、Wakabayashi Kenji、Ueda Hiroshi
    • 雑誌名

      The Analyst

      巻: 147 号: 22 ページ: 4971-4979

    • DOI

      10.1039/d2an01051h

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cell-free protein crystallization for nanocrystal structure determination2022

    • 著者名/発表者名
      Abe Satoshi、Tanaka Junko、Kojima Mariko、Kanamaru Shuji、Hirata Kunio、Yamashita Keitaro、Kobayashi Ayako、Ueno Takafumi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 16031-16031

    • DOI

      10.1038/s41598-022-19681-9

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Heterogeneous IgE reactivities to <i>Staphylococcus pseudintermedius</i> strains in dogs with atopic dermatitis, and the identification of DM13-domain-containing protein as a bacterial IgE-reactive molecule2022

    • 著者名/発表者名
      Takemura-Uchiyama Iyo、Tsurui Hiroki、Shimakura Hidekatsu、Nasukawa Tadahiro、Imanishi Ichiro、Uchiyama Jumpei、Fukuyama Tomoki、Sakamoto Shuji、Morisawa Keiko、Fujimura Masato、Murakami Hironobu、Kanamaru Shuji、Kurokawa Kenji、Kawamoto Keiko、Iyori Keita、Sakaguchi Masahiro
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters

      巻: 369 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1093/femsle/fnac019

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A conserved Ctp1/CtIP C-terminal peptide stimulates Mre11 endonuclease activity2021

    • 著者名/発表者名
      Zdravkovic Aleksandar、Daley James M.、Dutta Arijit、Niwa Tatsuya、Murayama Yasuto、Kanamaru Shuji、Ito Kentaro、Maki Takahisa、Argunhan Bilge、Takahashi Masayuki、Tsubouchi Hideo、Sung Patrick、Iwasaki Hiroshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 118 号: 11 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1073/pnas.2016287118

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Oxidation of aromatic and aliphatic aldehydes to carboxylic acids by Geotrichum candidum aldehyde dehydrogenase2020

    • 著者名/発表者名
      Hoshino Tomoyasu、Yamabe Emi、Hawari Muhammad Arisyi、Tamura Mayumi、Kanamaru Shuji、Yoshida Keisuke、Koesoema Afifa Ayu、Matsuda Tomoko
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 76 号: 33 ページ: 131387-131387

    • DOI

      10.1016/j.tet.2020.131387

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Real-time tracking reveals catalytic roles for the two DNA binding sites of Rad512020

    • 著者名/発表者名
      Ito Kentaro、Murayama Yasuto、Kurokawa Yumiko、Kanamaru Shuji、Kokabu Yuichi、Maki Takahisa、Mikawa Tsutomu、Argunhan Bilge、Tsubouchi Hideo、Ikeguchi Mitsunori、Takahashi Masayuki、Iwasaki Hiroshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16750-3

    • NAID

      120007117439

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure and Function of the T4 Spackle Protein Gp61.32020

    • 著者名/発表者名
      Kanamaru Shuji、Uchida Kazuya、Nemoto Mai、Fraser Alec、Arisaka Fumio、Leiman Petr G.
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 12 号: 10 ページ: 1070-1070

    • DOI

      10.3390/v12101070

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cooperative interactions facilitate stimulation of Rad51 by the Swi5-Sfr1 auxiliary factor complex.2020

    • 著者名/発表者名
      Argunhan B, Sakakura M, Afshar N, Kurihara M, Ito K, Maki T, Kanamaru S, Murayama Y, Tsubouchi H, Takahashi M, Takahashi H, Iwasaki H.
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 9

    • DOI

      10.7554/elife.52566

    • NAID

      120007117502

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] T2 類縁ファージのレセプター結合ドメインによる宿主認識2021

    • 著者名/発表者名
      金丸周司
    • 学会等名
      第8回ファージ研究会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ファージレセプター結合蛋白質と宿主レセプターの相互作用解析2021

    • 著者名/発表者名
      金丸 周司, 竹村 和浩, Aleksandar Zdravkovic
    • 学会等名
      第59回生物物理年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] フェリチン1 分子中のH, L サブユニットの割合制御と鉄ナノ粒子の結晶性の比較2021

    • 著者名/発表者名
      金丸 朋子, 金丸 周司, 吉村 英恭
    • 学会等名
      第59回生物物理年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Bacteriophage T4 as a platform for molecular engine2020

    • 著者名/発表者名
      Shuji Kanamaru, Takafumi Ueno
    • 学会等名
      The 1st International Symposium on "Molecular Engine"
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural and functional analysis of phage receptor binding protein and OmpC2019

    • 著者名/発表者名
      Shuji Kanamaru
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] PP01ファージのgp38レセプター結合ドメインの構造2018

    • 著者名/発表者名
      金丸周司
    • 学会等名
      第7回ファージ研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Structure and function of phage receptor binding protein2018

    • 著者名/発表者名
      金丸周司
    • 学会等名
      第56回生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi