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放射線抵抗性細菌のDNA損傷応答誘導因子PprIの機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K05423
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構

研究代表者

佐藤 勝也  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子応用研究所 放射線生物応用研究部, 上席研究員(定常) (90370402)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2018年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード放射線抵抗性細菌 / デイノコッカス・ラジオデュランス / DNA損傷応答機構 / DNA修復機構 / PprI / 放射線乾燥応答モチーフ / DdrA / DdrO / PprIタンパク質 / DdrOタンパク質 / DdrAタンパク質 / DNA修復 / DNA損傷応答 / タンパク質 / 遺伝子
研究成果の概要

変異型PprIを用いて、DNA損傷応答機構への影響について解析を行った。E119Q及びE149Qを含む変異型PprIは、DNA損傷応答反応を示さなかったことからメタロプロテアーゼ活性の欠失により、DdrOが分解されずRDRレギュロン発現の脱抑制が起こらないと考えられた。また、Y196A、V237A及びH260Lを含む変異型PprIは、低いDNA損傷応答反応を示したことから、それぞれ、DNA結合性及び環状ヌクレオチドの結合性を低下させ立体構造及び触媒活性に影響を与えていると考えられた。このように、DNA損傷応答機構におけるPprIの機能に関わるアミノ酸部位について重要な知見を得ることができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

PprIは、放射性抵抗性細菌において高次に保存される特有のタンパク質であり、機能ドメインとして、メタロプロテアーゼドメイン、DNA結合ドメイン、GAF様結合ドメインを有している。本研究によって、放射性抵抗性細菌に特有のDNA損傷依存的なDNA修復タンパク質群の発現誘導の分子機構において、PprIのメタロプロテアーゼ部位が最も重要な役割を担っていることを見出した。これにより、放射線抵抗性細菌の極めて効率的なDNA修復機構の一端を明らかにすることができた。さらに、DNA修復に重要な役割を担うタンパク質を有用微生物資源として、生命科学・バイオ技術分野の新たな研究開発にも貢献できると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Construction of Luciferase Reporter Strains for Functional Analysis of DNA Damage Response Regulators2021

    • 著者名/発表者名
      Katsuya Satoh, Toshihiko Sanzen, Yutaka Oono, Issay Narumi.
    • 雑誌名

      QST Takasaki Annual Report 2019

      巻: QST-M-29 ページ: 96-96

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional analysis of radiation-inducible protein DdrA and its paralog DdrAP in Deinococcus radiodurans2021

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Futami, Katsuya Satoh, Naoki Tomita, Toshihiko Sanzen, Taichi Shimosaka, Yutaka Oono, Issay Narumi.
    • 雑誌名

      QST Takasaki Annual Report 2019

      巻: QST-M-29 ページ: 97-97

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of the Cesium-Accumulating Bacterium Rhodococcus qingshengii CS98, Isolated from Soil in Japan2020

    • 著者名/発表者名
      Satoh Katsuya、Ozawa Shogo、Hayashi Hidenori、Tomioka Noriko、Narumi Issay、Oono Yutaka
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 9 号: 50

    • DOI

      10.1128/mra.01188-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional analysis of PprI in the DNA damage response mechanism of Deinococcus radiodurans2020

    • 著者名/発表者名
      Katsuya Satoh, Toshihiko Sanzen, Yutaka Oono, Issay Narumi.
    • 雑誌名

      QST Takasaki Annual Report 2018

      巻: QST-M-23 ページ: 83-83

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Expression of the Deinococcus grandis imuB and dnaE2 Genes in Escherichia coli2020

    • 著者名/発表者名
      Toshihiko Sanzen, Katsuya Satoh, Yutaka Oono, Issay Narumi.
    • 雑誌名

      QST Takasaki Annual Report 2018

      巻: QST-M-23 ページ: 89-89

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Studies on Application of Ion Beam Breeding to Industrial Microorganisms at TIARA2019

    • 著者名/発表者名
      Satoh Katsuya、Oono Yutaka
    • 雑誌名

      Quantum Beam Science

      巻: 3 号: 2 ページ: 11-11

    • DOI

      10.3390/qubs3020011

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of a Radioresistant Bacterial Strain, Deinococcus grandis ATCC 436722019

    • 著者名/発表者名
      Shibai Atsushi、Satoh Katsuya、Kawada Masako、Kotani Hazuki、Narumi Issay、Furusawa Chikara
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 8 号: 45

    • DOI

      10.1128/mra.01226-19

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Extended structure of pleiotropic DNA repair-promoting protein PprA from Deinococcus radiodurans2019

    • 著者名/発表者名
      Motoyasu Adachi, Rumi Shimizu, Chie Shibazaki, Katsuya Satoh, Satoru Fujiwara, Shigeki Arai, Issay Narumi. Ryota Kuroki
    • 雑誌名

      The FASEB Journal

      巻: 33 号: 3 ページ: 3647-3658

    • DOI

      10.1096/fj.201801506r

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome analysis of the radioresistant bacterium Deinococcus aerius TR01252019

    • 著者名/発表者名
      Katsuya Satoh, Hiroki Arai, Toshihiko Sanzen, Hidenori Hayashi, Issay Narumi, Yutaka Oono
    • 雑誌名

      QST Takasaki Annual Report 2017

      巻: QST-M-16 ページ: 100-100

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] デイノコッカス・ラジオデュランスのDNA損傷応答機構におけるPprIタンパク質の変異解析2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤 勝也, 三善 英彦, 鳴海 一成, 大野 豊
    • 学会等名
      極限環境生物学会2020年度(第21回)年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 放射線抵抗性細菌デイノコッカス・ラジオデュランスのDNA修復機構の正確性に関する比較ゲノム解析2020

    • 著者名/発表者名
      三善 英彦, 佐藤 勝也, 大野 豊, 鳴海 一成
    • 学会等名
      本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Deinococcus radioduransのDNA損傷応答タンパク質PprIの機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      三善 英彦, 佐藤 勝也, 大野 豊, 鳴海 一成.
    • 学会等名
      極限環境生物学会2019年度(第20回)年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 放射線抵抗性細菌Deinococcus radioduransのDNA損傷誘導性DdrAタンパク質をコードする遺伝子およびそのパラログDdrAPタンパク質をコードする遺伝子の欠失株の特性解析2019

    • 著者名/発表者名
      二見 祐作, 佐藤 勝也, 冨田 尚希, 三善 英彦, 下坂 泰地, 大野 豊, 鳴海 一成.
    • 学会等名
      QST高崎サイエンスフェスタ2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] The comparative genomic analysis between Deinococcus radiodurans, D. grandis, and D. aerius2018

    • 著者名/発表者名
      Katsuya Satoh, Toshihiko Sanzen, Issay Narumi, Yutaka Oono
    • 学会等名
      The 12th International Conference on Extremophiles (Extremophiles 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Expression of translesion DNA polymerase genes from Deinococcus grandis in Escherichia coli2018

    • 著者名/発表者名
      Toshihiko Sanzen, Katsuya Satoh, Issay Narumi
    • 学会等名
      The 12th International Conference on Extremophiles (Extremophiles 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] イオンビームで産業微生物をつくる2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤 勝也
    • 学会等名
      第17回放射線プロセスシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Deinococcus grandis由来TLSポリメラーゼの大腸菌内での発現2018

    • 著者名/発表者名
      三善 英彦, 佐藤 勝也, 鳴海 一成
    • 学会等名
      極限環境生物学会2018年度(第19回)年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 放射線抵抗性細菌由来TLSポリメラーゼの大腸菌での発現解析2018

    • 著者名/発表者名
      三善 英彦, 佐藤 勝也, 大野 豊, 鳴海 一成
    • 学会等名
      QST高崎サイエンスフェスタ2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 量子科学技術研究開発機構・プロジェクト「イオンビーム変異誘発研究」

    • URL

      https://www.qst.go.jp/site/ion-beam-mutagenesis/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実施状況報告書
  • [備考] 量子科学技術研究開発機構・プロジェクト「イオンビーム変異誘発研究」

    • URL

      https://www.qst.go.jp/site/taka/2060.html

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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