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コナダニ類の脂質代謝に関わる酸化的な炭素鎖短縮反応の分子基盤

研究課題

研究課題/領域番号 18K05468
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分38040:生物有機化学関連
研究機関京都先端科学大学

研究代表者

清水 伸泰  京都先端科学大学, バイオ環境学部, 教授 (30434658)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードコナダニ / 脂質代謝 / 炭化水素 / ギ酸エステル / Baeyer-Villiger酸化 / 生合成 / 炭素鎖短縮反応
研究成果の概要

コナダニの脂肪酸由来代謝物の生合成に深く関与する新規なBaeyer-Villiger 酸化酵素(BVMO)の同定を目的とし、粗酵素の遠心分離、塩析、各種クロマトグラフィーによる精製を進めた。それに並行して本酵素の同定を目指したトランスクリプトーム解析により生合成遺伝子群の絞り込みを行った。コナダニのトランスクリプトーム塩基配列について、既知のBVMOと配列類似性を示すタンパク質を検索したところ、6種のタンパク質が特有のBVMOモチーフ配列と2カ所のRossmanモチーフ配列をもつことが明らかとなった。候補遺伝子の酵素機能を調べるため、コナダニからmRNAを抽出し、候補遺伝子をクローニングした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

これまで微生物を中心に発見されたBVMOが触媒する反応形式は、環状ケトンをラクトンに、あるいは芳香族ケトンをエステルに変換するものが大半である。それに比べコナダニ由来の酸化酵素は、アルデヒドを基質として直接、1炭素短縮したアルコールあるいはギ酸エステルへ変換可能な新規な反応を触媒する。BVMOはケトンのラセミ体からエナンチオ選択的酸化により、光学活性ラクトンあるいはエステルを供給できる点において、特に天然物や医薬品の有機合成分野で有用な生体触媒になりうる。酵素遺伝子および生成機構の全容が解明できれば緩和に減炭反応を成し遂げる新たな生体触媒の開発が期待できる。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 4件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (17件) (うち招待講演 2件) 図書 (2件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Do ‘cheese factory-specific’ mites (Acari: Astigmata) exist in the cheese-ripening cabinet?2022

    • 著者名/発表者名
      Shimano Satoshi、Hiruta Shimpei F.、Shimizu Nobuhiro、Hagino Wataru、Aoki Jun-ichi、OConnor Barry M.
    • 雑誌名

      Experimental and Applied Acarology

      巻: 87 号: 1 ページ: 49-65

    • DOI

      10.1007/s10493-022-00725-8

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Mite secretions from three traditional mite-ripened cheese types: are ripened French cheeses flavored by the mites (Acari: Astigmata)?2022

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Nobuhiro、OConnor Barry M.、Hiruta Shimpei F.、Hagino Wataru、Shimano Satoshi
    • 雑誌名

      Experimental and Applied Acarology

      巻: 87 号: 4 ページ: 309-323

    • DOI

      10.1007/s10493-022-00734-7

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] ヤスデ綱が分泌する防御分泌物の多様性2021

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰
    • 雑誌名

      Edaphologia

      巻: 109 ページ: 1-8

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Influence of Age and Mating Status on Pheromone Production in a Powderpost Beetle Lyctus africanus (Coleoptera: Lyctinae)2020

    • 著者名/発表者名
      Kartika Titik, Shimizu Nobuhiro, Himmi Khoirul Setiawan, Guswenrivo Ikhsan, Tarmadi Didi, Yusuf Sulaeman, Yoshimura Tsuyoshi
    • 雑誌名

      Insects

      巻: 12 号: 1 ページ: 8-8

    • DOI

      10.3390/insects12010008

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Biosynthesis of the widely distributed hydrocarbon (Z,Z)-6,9-heptadecadiene in astigmatid mites2020

    • 著者名/発表者名
      Moriyama Daisuke、Shimizu Nobuhiro
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 84 号: 6 ページ: 1119-1122

    • DOI

      10.1080/09168451.2020.1723403

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書 2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Behavioral changes of powderpost beetle, Lyctus africanus Lesne (Coleoptera: Bostrichidae): responses on female extract2019

    • 著者名/発表者名
      Kartika Titik、Shimizu Nobuhiro、Yoshimura Tsuyoshi
    • 雑誌名

      IOP Conference Series: Earth and Environmental Science

      巻: 374 号: 1 ページ: 012022-012022

    • DOI

      10.1088/1755-1315/374/1/012022

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] セミナー室 / 農芸化学の中での化学生態学研究-その発展と展望- 昆虫のフェロモン2 脂肪酸に由来するフェロモンの生合成と受容機構2019

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰、藤井毅、戎煜、石川幸男、櫻井健志、光野秀文
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 57 ページ: 749-759

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] ダニと昆虫の多機能フェロモンとその活用術2018

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰
    • 雑誌名

      昆虫と自然

      巻: 53 ページ: 4-7

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] ササラダニ類が産生するシアン化合物からシアン化水素の生成機構2023

    • 著者名/発表者名
      森山太介、高原千尋、島野智之、清水伸泰
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ダニ共生微生物群の菌叢解析とその諸性質の解析2022

    • 著者名/発表者名
      櫻間晴子、清水伸泰、坂本文夫、萩下大郎
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実施状況報告書
  • [学会発表] トウキョウコシビロダンゴムシのフェロモンの解析2021

    • 著者名/発表者名
      吉野広軌、清水伸泰
    • 学会等名
      日本土壌動物学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] トウキョウコシビロダンゴムシのフェロモンの解析2021

    • 著者名/発表者名
      吉野広軌、清水伸泰
    • 学会等名
      日本土壌動物学会 第43回大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] コナダニ類に由来する脂肪族ギ酸エステルの生合成2020

    • 著者名/発表者名
      森山太介、荒谷剛史、清水伸泰
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] コナダニ類における多機能フェロモン2019

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰
    • 学会等名
      日本土壌動物学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 良いチーズを熟成するチーズコナダニTyrolichus casei Oudemans, 1910(Acariformes: Sarcoptiformes: Acaridae)の分子系統解析2019

    • 著者名/発表者名
      島野智之、蛭田眞平、清水伸泰
    • 学会等名
      日本動物分類学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] チーズを熟成するチーズコナダニTyrolichus casei Oudemans, 1910(Acariformes: Sarcoptiformes: Acaridae)の分子系統解析2019

    • 著者名/発表者名
      島野智之、蛭田眞平、清水伸泰
    • 学会等名
      日本動物学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] チーズを熟成するチーズコナダニTyrolichus casei Oudemans, 1910(Acariformes: Sarcoptiformes: Acaridae)の分子系統解析2019

    • 著者名/発表者名
      島野智之、蛭田眞平、清水伸泰
    • 学会等名
      日本ダニ学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 節足動物が産生する情報化学物質の生物有機化学的研究2019

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰
    • 学会等名
      日本環境動物昆虫学会 学会賞受賞講演
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] コナダニ類の警報フェロモンneryl formate分子を形成するギ酸の生合成2019

    • 著者名/発表者名
      森山太介、吉田直樹、清水伸泰
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] ワラジムシ由来の防御物質キナルジン酸誘導体の同定と生物活性評価2019

    • 著者名/発表者名
      永井禎己、石丸善明、唐澤重考、清水伸泰
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] シキミグンバイ若虫分泌物とその類縁体の抗菌活性評価2019

    • 著者名/発表者名
      高原千尋、清水伸泰
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 微小な衛生・不快害虫のフェロモン研究からわかってきたこと2018

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰
    • 学会等名
      日本環境動物昆虫学会セミナー
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 日本産タマヤスデの防御分泌物に含まれるアルカロイドとタンパク質2018

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰、井上萌佳、小野淳也
    • 学会等名
      日本土壌動物学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 節足動物の防御物質を用いた殺虫および殺ダニ効果の検証2018

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰、小野淳也、平坂高一、市川直美、川瀬穂高
    • 学会等名
      日本環境動物昆虫学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] シキミグンバイ若虫分泌物に含まれる抗菌活性物質の構造活性相関研究2018

    • 著者名/発表者名
      高原千尋、清水伸泰
    • 学会等名
      日本環境動物昆虫学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [図書] 土の中の生き物たちのはなし2022

    • 著者名/発表者名
      島野 智之、長谷川 元洋、萩原 康夫
    • 総ページ数
      168
    • 出版者
      朝倉書店
    • ISBN
      9784254171792
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] 土の中の生き物の話 / ヤスデとダニの化学防衛2021

    • 著者名/発表者名
      清水伸泰
    • 出版者
      朝倉書店
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 個人ホームページ

    • URL

      https://lab.kuas.ac.jp/~bioorgchem/

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 京都先端科学大学、教員紹介

    • URL

      https://www.kuas.ac.jp/profile/nobuhiro-shimizu

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [産業財産権] グンバイ由来ポリケチドとその合成類縁体の抗菌活性2019

    • 発明者名
      高原千尋、清水伸泰
    • 権利者名
      高原千尋、清水伸泰
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2019
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-01-30  

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