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イヌの新規ゲノムワイドDNAメチル化解析:腫瘍性疾患特異的DNAメチル化の同定

研究課題

研究課題/領域番号 18K05964
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分42020:獣医学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

山崎 淳平  北海道大学, 獣医学研究院, 特任准教授 (20732902)

研究分担者 市居 修  北海道大学, 獣医学研究院, 准教授 (60547769)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードエピジェネティクス / DNAメチル化 / 腫瘍 / エピゲノム / 臨床 / 癌
研究成果の概要

正常イヌ2頭由来の16種類の正常組織、イヌの悪性黒色腫28症例と正常犬の口腔内粘膜組織、イヌの肝細胞癌12症例と正常犬の肝細胞ならびにステロイド投与群由来サンプルについて次世代シークエンサーによる解析を行ったところ、約100,000-150,000箇所のCpGサイトのDNAメチル化の定量的な解析が可能であった。
これにより、各正常組織特有のDNAメチル化パターンの存在、悪性黒色腫症例や肝細胞癌症例における正常組織と比較したDNAメチル化状態の明らかな違いが認められた。臨床的には違いが明確でない悪性黒色腫や肝細胞癌症例がDNAメチル化パターンによって複数群に分類されることが初めて明らかとなった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

これまで研究されてきたイヌの腫瘍疾患におけるDNAメチル化の異常は、かなり局所的な解析によるものにとどまっていたが、本研究によってその解析範囲が大幅に改善されたことで広範な異常が存在することが明らかとなり、イヌの腫瘍疾患における分子生物学的なメカニズムの理解が刷新されたことは学術的意義が深い。
また本研究の成果による、獣医診療におけるバイオマーカー樹立や新規治療法の策定などの臨床応用への可能性が示唆された点においては、コンパニオンアニマルとしてのイヌ、およびともに暮らす人間のより良い暮らしといった社会的意義につながる。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] Coriell Institute for Medical Research(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] MD Anderson Cancer Center/Department of Pediatrics(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Coriell Institute for Medical Research(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] MD Anderson Cancer Center/Department of Pediatrics(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] DNA methylation landscape of 16 canine somatic tissues by methylation-sensitive restriction enzyme-based next generation sequencing2021

    • 著者名/発表者名
      Jumpei Yamazaki, Yuki Matsumoto, Jaroslav Jelinek, Teita Ishizaki, Shingo Maeda, Kei Watanabe, Genki Ishihara, Junya Yamagishi, Mitsuyoshi Takiguchi
    • 雑誌名

      Scientific Report

      巻: -

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide DNA methylation analysis of dogs with high lead exposure living near a lead mining area in Kabwe, Zambia.2021

    • 著者名/発表者名
      Jumpei Yamazaki, Haruya Toyomaki, Shouta M.M. Nakayama, John Yabe, Kaampwe Muzandu, Jaroslav Jelinek, Shoko Yokoyama, Yoshinori Ikenaka, Mitsuyoshi Takiguchi, Mayumi Ishizuka
    • 雑誌名

      Environmental Pollution

      巻: -

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] エピジェネティック治療2020

    • 著者名/発表者名
      山崎淳平
    • 雑誌名

      Veterinary Oncology

      巻: 5 ページ: 34-43

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Genome-wide DNA methylation analysis in canine gastrointestinal lymphoma2020

    • 著者名/発表者名
      OHTA Hiroshi、YAMAZAKI Jumpei、JELINEK Jaroslav、ISHIZAKI Teita、KAGAWA Yumiko、YOKOYAMA Nozomu、NAGATA Noriyuki、SASAKI Noboru、TAKIGUCHI Mitsuyoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Veterinary Medical Science

      巻: 82 号: 5 ページ: 632-638

    • DOI

      10.1292/jvms.19-0547

    • NAID

      130007844434

    • ISSN
      0916-7250, 1347-7439
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Long interspersed nucleotide element-1 hypomethylation in canine malignant mucosal melanoma2020

    • 著者名/発表者名
      Ishizaki Teita、Yamazaki Jumpei、Meagawa Shinji、Yokoyama Nozomu、Aoshima Keisuke、Takiguchi Mitsuyoshi、Kimura Takashi
    • 雑誌名

      Veterinary and Comparative Oncology

      巻: - 号: 4 ページ: 854-860

    • DOI

      10.1111/vco.12591

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] イヌのがんにおける異常DNAメチル化解析2020

    • 著者名/発表者名
      山崎淳平
    • 学会等名
      遺伝研研究会「コンパニオンアニマルのゲノム医療」
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] イヌの悪性黒色腫自然発症例に認められた広範なDNA 脱メチル化2020

    • 著者名/発表者名
      石﨑禎太、山﨑淳平、青島圭佑、木村享史
    • 学会等名
      第16回日本獣医内科学アカデミー学術大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] イヌ腫瘍の新たなメカニズム~異常DNAメチル化~2020

    • 著者名/発表者名
      山﨑淳平
    • 学会等名
      第16回日本獣医内科学アカデミー学術大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Genome-wide quantitative DNA methylation analysis in canine malignant melanoma2019

    • 著者名/発表者名
      Teita Ishizaki, Jumpei Yamazaki, Keisuke Aoshima, Takashi Kimura
    • 学会等名
      VCS Annual Conference
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] イヌの悪性黒色腫におけるDNAメチル化の網羅的解析2019

    • 著者名/発表者名
      石﨑禎太、山﨑淳平、中川貴之、青島圭佑、木村享史
    • 学会等名
      第15回日本獣医内科学アカデミー学術大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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