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CAGを超える恒常的プロモーターの新規同定

研究課題

研究課題/領域番号 18K06039
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分42040:実験動物学関連
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

中武 悠樹  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師 (20415251)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードプロモーター / 遺伝子発現 / 網羅的解析 / 恒常発現 / 転写制御 / 恒常的プロモータ / 発現ベクター / 恒常的プロモーター / CAGプロモーター / 合成生物学
研究成果の概要

生物の持つ分子メカニズムを解析するため、分子生物学の分野では、特定の遺伝子を誘導する実験が一般的である。遺伝子誘導には、プロモーターと呼ばれる配列を、目的遺伝子の上流に配置するが、体系的に有用な配列を探索する試みはされておらず、改善余地が大きいと考えられる。本研究では、最先端のオミックスデータをもとに、今まであまり着目されていなかった遺伝子の転写活性を検証した。
本研究成果により同定されたプロモーター配列は、十分な活性を有していたが、古典的に使用されていたCAGプロモーターを超えなかった。これらのことから、配列そのものではなく、プロモーターの構造が重要であることが示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

古典的に使用されている分子生物学的ツールは、特段に不都合が無ければ、あまり着目されることもなく、盲目的に使用される傾向にある。ただ、実験目的によっては、既存のツールがうまく機能せず、得たい実験結果が得られない等のトラブルが生じる。本研究は、そのような申請者の実経験から着想され、最新の知見を駆使することで、古い固定概念を覆そうとした。今後、本知見を踏まえ、さらに良いツールの開発がされれば、今までできなかった実験評価が実施できるなど、生物学の分子メカニズムの解明への貢献が期待される。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2020 2018 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Generation and Profiling of 2,135 Human ESC Lines for the Systematic Analyses of Cell States Perturbed by Inducing Single Transcription Factors2020

    • 著者名/発表者名
      Nakatake Y、Ko S B.H.、Sharov A A.、Wakabayashi S、Murakami M、Sakota M、Chikazawa N、Ookura C、Sato S、Ito N、Ishikawa-Hirayama M、Mak Siu S、Jakt Lars M、Ueno T、Hiratsuka K、Matsushita M、Goparaju S K、Akiyama T、Ishiguro K、Oda M、Gouda N、Umezawa A、Akutsu H、Nishimura K、Matoba R、Ohara O、Ko M S.H.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 31 号: 7 ページ: 107655-107655

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2020.107655

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] CAGプロモータを超える新規恒常的プロモーターの同定2018

    • 著者名/発表者名
      中武悠樹
    • 学会等名
      第41回分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] ヒト幹細胞分化に関係する転写因子の網羅的な同定とその解析 -AI技術開発に期待ー

    • URL

      https://www.ncchd.go.jp/press/2020/pr_20200717.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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