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ウシ心筋チトクロムc酸化酵素の反応中間体の精密結晶構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K06092
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関兵庫県立大学

研究代表者

月原 冨武  兵庫県立大学, 理学研究科, 特任教授 (00032277)

研究分担者 吉川 信也  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 特任教授(名誉教授) (40068119)
島田 敦広  岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (80723874)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードチトクロムc酸化酵素 / 膜蛋白質 / 呼吸酵素 / X線結晶構造解析 / 立体構造 / プロトン能動輸送 / 酸素還元 / 生体超分子 / 膜タンパク質 / 生体エネルギー変換 / 構造と機能 / タンパク質複合体 / プロトンポンプ / チトクロム酸化酵素
研究成果の概要

チトクロムc酸化酵素(CcO)は呼吸鎖末端酵素で、酸素の還元を担っている。酸素還元反応の際に分子内を電子が伝達されるのに同期して、プロトンが能動輸送される。酵素反応サイクル中の中間体及び中間体類似の構造を決定して、この酸素還元に伴う電子移動とプロトン能動輸送の同期の仕組みの解明を目指している。
酸素還元は6種の反応中間体、R, A, P, F, O, Eを経て段階的に進行する。これらの反応中間体のうちすでに構造決定していたR以外のA、P、F、O、E中間体の構造を決定し、反応サイクル中の6中間体全ての構造を確定した。これらの構造に基づいてプロトン能動輸送機構を提案している。

研究成果の学術的意義や社会的意義

チトクロムc酸化酵素(CcO)は呼吸鎖末端酵素で、酸素の還元とそれに同期したプロトンの能動輸送によってエネルギーを生産している。我々は長年酸素還元・プロトン能動輸送の仕組みの解明のためにウシCcOの結晶構造解析を行ってきた。
種々の反応中間体類似体等の構造解析を行い、酸素還元・プロトン能動輸送機構を提案している。この提案に対して、細菌CcOの変異体の機能解析等による多くの反論が出た。それらの反論を逐次新たな構造解析によって克服して、哺乳類に関する酸素還元・プロトン能動輸送機構としては我々の提案が認知されるようになってきた。この度の反応中間体の構造も我々の提案を一層強く支持する結果である。

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (14件) (うち招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Critical roles of the CuB site in efficient proton pumping as revealed by crystal structures of mammalian cytochrome c oxidase catalytic intermediates2021

    • 著者名/発表者名
      Atsuhiro Shimada, Fumiyoshi Hara, Kyoko Shinzawa-Itoh, Nobuko Kanehisa, Eiki Yamashita, Kazumasa Muramoto2, Tomitake Tsukihara, and Shinya Yoshikawa
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 297 号: 3 ページ: 100967-100967

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.100967

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The 1.3-angstrom resolution structure of bovine cytochrome c oxidase suggests a dimerization mechanism2020

    • 著者名/発表者名
      K. Shinzawa-Itoh, M. Hatanaka, K. Fujita, N. Yano, Y. Ogasawara, J. Iwata, E. Yamashita, T. Tsukihara, S. Yoshikawa, K. Muramoto
    • 雑誌名

      BBA Advances

      巻: 1 ページ: 100009-100009

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] X-ray structures of catalytic intermediates of cytochrome c oxidase provide insights into its O2 activation and unidirectional proton-pump mechanisms2020

    • 著者名/発表者名
      A. Shimada, Y. Etoh, R. Kitoh-Fujisawa, A. Sasaki, K. Shinzawa-Itoh, T. Hiromoto, E. Yamashita, K. Muramoto, T. Tsukihara, S. Yoshikawa
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 295 号: 17 ページ: 5818-5833

    • DOI

      10.1074/jbc.ra119.009596

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Low-dose X-ray structure analysis of cytochrome c oxidase utilizing high-energy X-rays.2019

    • 著者名/発表者名
      G. Ueno, A. Shimada, E. Yamashita, K. Hasegawa, T. Kumasaka, K. Shinzawa-Itoh, S. Yoshikawa, T. Tsukihara, M. Yamamoto.
    • 雑誌名

      J Synchrotron Radiat.

      巻: 26 号: 4 ページ: 912-921

    • DOI

      10.1107/s1600577519006805

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 私の蛋白質結晶学-チトクロムcからチトクロムc酸化酵素2021

    • 著者名/発表者名
      月原冨武
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] O2-activation and unidirectional proton-pump mechanisms of cytochrome c oxidase elucidated by X-ray structures of its catalytic intermediates2020

    • 著者名/発表者名
      A. Shimada, Y. Eto, K. Shinzawa-Itoh, E. Yamashita, K. Muramoto, T. Tsukihara, S. Yoshikawa
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 構造から見たチトクロム酸化酵素のH-経路を介したプロトン能動輸送機構の普遍性2020

    • 著者名/発表者名
      島田敦広、月原冨武、吉川信也
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ウシ心筋シトクロム酸化酵素の1.3オングストローム分解能構造が示唆する二量体化機構2020

    • 著者名/発表者名
      伊藤・新澤恭子、畑中美紀、藤田和也、矢野直峰、小笠原由美、岩田淳、山下栄樹、月原冨武、吉川信也、村本和優
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Monomeric structure of an active form of respiratory oxygen reductase from bovine mitochondria2019

    • 著者名/発表者名
      K. Shinzawa-Itoh, T. Sugimura, T. Misaki, Y. Tadehara, S. Yamamoto, M. Hanada, N. Yano, T. Nakagawa, S. Uene, T. Yamada, H. Aoyama, E. Yamashita, T. Tsukihara, S. Yoshikawa, K. Muramoto
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Intermediate structure of cytochrome c oxidase provide insights into the mechanism of unidirectional proton pump coupled with O2 reduction.2019

    • 著者名/発表者名
      A. Shimada, K. Muramoto, K. Shinzawa-Itoh, T. Tsukihara, S. Yoshikawa.
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Structure determination of reduced cytochrome c oxidase using non-frozen crystal.2019

    • 著者名/発表者名
      T. Mizutani, A. Miyamoto, K. Ashida, K. Shinzawa-Itoh, A. Shimada, T. Tsukihara, S. Yoshikawa.
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Influence of differences in X-ray dose on crystal structure of cytochrome c oxidase.2019

    • 著者名/発表者名
      G. Syo, A. Miyamoto, K. Ashida, K. Shinzawa-Itoh, A. Shimada, T. Tsukihara, S. Yoshikawa.
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] チトクロム酸化酵素の構造・機能研究から見た結晶学の役割2019

    • 著者名/発表者名
      月原冨武
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Reaction mechanism of cytochrome c oxidase elucidated by high-resolution crystal structural analyses2018

    • 著者名/発表者名
      Tomitake Tsukihara, Atsuhiro Shimada, Shinya Yoshikawa
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A nanosecond time-resolved XFEL structure analysis reveals the structural changes associated with CO release from Cytochrome c Oxidase2018

    • 著者名/発表者名
      Atsuhiro Shimada, Minoru Kubo, Seiki Baba, Hideo Ago, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Structure changes induced by O2-binding tightly regulate the proton-pumping of cytochrome c oxidase2018

    • 著者名/発表者名
      Atsuhiro Shimada, Minoru Kubo, Seiki Baba, Hideo Ago, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] A unique respiratory adaptation in Drosophila independent of supercomplex formation2018

    • 著者名/発表者名
      Satoru Shimada, Marika Oosaki, Ryoko Takahashi, Shigefumi Uene, Sachiko Yanagisawa, Tomitake Tsukihara, Kyoko Shinzawa-Itoh
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 構造解析における動的揺らぎと構造多型の区別-CO結合還元型チトクロム酸化酵素のX線結晶構造解析の場合2018

    • 著者名/発表者名
      島田敦広、矢野直峰、山下栄樹、廣本武史、伊藤-新澤恭子、吉川信也、月原冨武
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

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