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染色体ドメインを形造るグアニン四重鎖結合タンパク質Rif1の分子形態解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K06102
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関公益財団法人東京都医学総合研究所

研究代表者

森山 賢治  公益財団法人東京都医学総合研究所, 基礎医科学研究分野, 研究員 (00250217)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードRif1 / タンパク質精製 / オリゴマー / グアニン四重鎖 / G4 DNA / 電子顕微鏡 / 単粒子解析 / 天然変性領域 / クライオ電子顕微鏡 / DNAループ / 染色体ドメイン
研究成果の概要

Rif1オリゴマー、及びそのグアニン四重鎖(G4)DNAとの複合体の微細形態を単粒子解析で決定する目的でマウスRif1(2,418アミノ酸)の大量精製を進めた。全長産物の精製は困難だったので、その2つの機能ドメイン(NTDとCTD)の間にある長い天然変性領域(968アミノ酸)を欠失したRif1-NCを精製し電顕観察した。その結果、オリゴマーではあるが、その形態は高解像度には確定できなかった。そこで、元々小さい分裂酵母のRif1(SpRif1、1,400アミノ酸)を解析することにした。全長SpRif1の精製は困難であったが、N末端欠失体(SpRif1dN92)の精製に成功し、解析を進めている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

研究代表者の先行研究の中で、Rif1が複数のG4(グアニン四重鎖)DNA結合部位を持つオリゴマーであることを生化学的に示してはいたが、今回の電子顕微鏡解析によりRif1がオリゴマーであることを視覚的に裏付けることができたのは学術的に意義深い。また、本研究は米国のクライオ電顕解析のエキスパートであるHuilin Li教授達(Van Andel Research Institute)との国際共同研究であり、科学的な国際強調の観点でその社会的意義は大きい。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Van Andel Research Institute(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Van Andel Research Institute(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Van Andel Research Institute(米国)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] G-quadruplex binding protein Rif1, a key regulator of replication timing2020

    • 著者名/発表者名
      Alavi Sana、Ghadiri Hamed、Dabirmanesh Bahareh、Moriyama Kenji、Khajeh Khosro、Masai Hisao
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 169 号: 1 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa128

    • NAID

      40022490610

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Rif1 promotes association of G-quadruplex (G4) by its specific G4 binding and oligomerization activities2019

    • 著者名/発表者名
      Masai Hisao、Fukatsu Rino、Kakusho Naoko、Kanoh Yutaka、Moriyama Kenji、Ma Yue、Iida Keisuke、Nagasawa Kazuo
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 8618-8618

    • DOI

      10.1038/s41598-019-44736-9

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] In search of a universal mode of DNA replication.2019

    • 著者名/発表者名
      Masai, H., Kanoh, Y., Tanaka, T., Yoshizawa, N., Ito, S., Moriyama, K., et al.
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会 2019.12.4. 福岡国際会議場(2PW-04-4)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 複製タイミング制御因子Rif1の欠失が誘導する2細胞期胚様細胞のZscan4遺伝子エンハンサー構造2019

    • 著者名/発表者名
      吉沢直子、森山賢治、正井久雄
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会 2019.12.6. 福岡国際会議場(4P-0217)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Identification of dual G-quadruplex DNA-binding domains in murine Rif1, a key organizer of higher-order chromatin architecture2018

    • 著者名/発表者名
      森山賢治、吉沢直子、正井久雄
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA-RNA hybrid and G-quadruplex: exploring their biological significance as new genome signatures2018

    • 著者名/発表者名
      正井久雄、加納豊、覚正直子、深津理乃、田中卓、吉沢直子、森山賢治、小林駿介、鷺朋子、關口直樹、松本清治、加藤宏幸
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 東京都医学総合研究所 ゲノム動態プロジェクト

    • URL

      http://www.igakuken.or.jp/genome/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実施状況報告書 2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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