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シアノバクテリアの異化細胞形成過程における細胞内酸素ダイナミクスの解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K06150
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関東京工業大学

研究代表者

野亦 次郎  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 助教 (40583216)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 交付 (2019年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2020年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード酸素 / 変異 / ヘム / シアノバクテリア / 蛍光タンパク質 / 光合成 / 酸素ダイナミクス / 窒素固定 / 嫌気
研究実績の概要

分子状酸素(O2)は、生物にとって最も重要なガス分子の1つである。酸素は呼吸、免疫、活性酸素種の生成、クロロフィル生合成など多様な生化学反応において利用される。また、酸素が転写因子や酵素を直接的に活性化(不活性化)するなど、シグナル分子としてはたらくことも報告されている。しかし、生体内の酸素濃度やその変動に関する知見は今日でも限定的である。
糸状性ラン藻Anabaena sp.PCC7120(A.7120)は、窒素固定能を有し、窒素欠乏条件下におかれると細胞十数個おきにヘテロシストと呼ばれる異化細胞を分化する。ヘテロシストは、酸素感受性の窒素固定酵素ニトロゲナーゼを酸素から保護するため、その内部を低酸素化すると考えられているが、ヘテロシスト分化において細胞内が低酸素化されていく過程はこれまで明らかにされていない。申請者は昨年度、細菌に由来する天然の酸素センサータンパク質(DosP; Direct oxygen sensor protein)のヘム結合領域(DosH)と蛍光タンパク質を組み合わせることで、細胞内の酸素濃度をモニター可能な蛍光タンパク質プローブを作成し、in vitroにおける酸素の検出や酸素濃度定量に成功した。この新規の酸素センサータンパク質を ANA(anaerobic/aerobic sensing fluorescence protein)と名付けた (Nomata and Hisabori,2018, Sci.Rep.)。本年度は、ANAのin vivoでの利用に向けた改変を行い、酸素存在下におけるシグナル変化率の大幅な改善、およびプロテアーゼ耐性を付与に成功した

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究では、細胞内の酸素濃度をモニター可能な蛍光タンパク質プローブを開発し、このプローブを用いて、窒素固定性ラン藻Anabaena sp.PCC7120(A.7120)の異化細胞ヘテロシストが形成される過程で細胞内酸素動態がどのように変化するのかを調べることを目的とする。本年度は、既に開発した酸素センサータンパク質ANA(Nomata and Hisabori,2018, Sci.Rep.)をベースとし、in vivoでの使用に向け様々な改変を加えた。まず、ANAの酸素存在下での蛍光強度変化は1.7倍でありin vivoにおける観察には充分とは言えなかったため、酸素存在下におけるシグナル変化率を改善しようと試みた。様々な変異を加えた変異型のANAを大腸菌において発現させ、精製して酸素存在下におけるシグナル強度変化を調べたところ、変異型ANAの1つ(ANA-5)は240μMの酸素存在下において2.5倍以上のシグナル強度の増加を示した。次に精製したANAタンパク質を詳細に解析したところ、ANAはバクテリア細胞に内在するプロテアーゼによって部分分解を受けることがわかったので、ANA-5をベースとし、新たに様々な変異を導入してプロテアーゼに耐性を示す変異型ANAを選抜した。その結果、80%以上が分解を免れる新たな変異型ANA(ANA-153)を作出することに成功した。
以上から、本研究は概ね順調に進んでいる。

今後の研究の推進方策

申請者は開発した酸素センサータンパク質ANAのin vivoでの使用に向け、様々な試行を行い改変を加えることで、シグナル変化率の改善およびプロテアーゼ分解耐性を示す、改良型のANAを作出することができた。今後はこの新規ANAをコードする遺伝子をラン藻A.7120に導入して組み換え株を単離し、この組み換え株を利用して細胞内酸素濃度をモニターする系を確立する。 また、マルチカラー観察に向けた、蛍光色の異なるANAの開発も同時に行う。

報告書

(2件)
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Development of heme protein based oxygen sensing indicators.2018

    • 著者名/発表者名
      Nomata, J., Hisabori, T
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 号: 1 ページ: 11849-11849

    • DOI

      10.1038/s41598-018-30329-5

    • NAID

      120006605595

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 酸素センサータンパク質プローブを利用した細胞内酸素のモニタリング2019

    • 著者名/発表者名
      野亦次郎, 久堀徹
    • 学会等名
      2019年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 遺伝子コード型酸素センサー蛍光タンパク質ANAを利用した細胞内酸素のリアルタイムモニタリング2019

    • 著者名/発表者名
      野亦次郎, 久堀徹
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Designing heme protein based oxygen sensing indicators2018

    • 著者名/発表者名
      Jiro Nomata, Toru Hisabori
    • 学会等名
      第60回植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 酸素センサータンパク質プローブの開発2018

    • 著者名/発表者名
      野亦次郎
    • 学会等名
      第22回酸素ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Designing a FRET-based oxygen sensing protein2018

    • 著者名/発表者名
      Jiro Nomata
    • 学会等名
      National Institute of Genomics Biology Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 高感度な酸素センサータンパク質を開発

    • URL

      https://www.titech.ac.jp/news/2018/042187.html

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] Genetically encoded sensor tracks changes in...

    • URL

      https://www.titech.ac.jp/english/news/2018/042226.html

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-01-27  

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