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ホモダイマー型光合成反応中心に存在するキノン分子の特異な電子移動反応の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K06153
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

大岡 宏造  大阪大学, 理学研究科, 准教授 (30201966)

研究分担者 熊崎 茂一  京都大学, 理学研究科, 准教授 (40293401)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード光合成 / 反応中心 / ヘリオバクテリア / 緑色イオウ細菌 / エネルギー移動 / 電子移動 / X線結晶構造解析 / 一分子分光 / 1分子分光 / 蛍光スペクトル / シトクロム複合体 / 鉄硫黄タンパク質 / キノン / FTIR / 超高速分光 / タイプ1 / ホモダイマー
研究成果の概要

ヘリオバクテリア反応中心の高分解能X線結晶構造解析が終了し、キノン分子の存在する構造を明らかにした。現在、論文発表に向けて準備中である。また高純度に精製されたhRC標品を準備し、フェムト秒ポンプ・プローブ分光法を用いることで光誘起により生じるhRC内の励起エネルギー移動および初期電荷分離形成過程をサブピコ秒からナノ秒の時間領域で詳細に追跡した。その結果、hRCの光エネルギー変換の初期過程に関する構造的基盤を明らかにした。グローバル解析により,時定数20 psで観測される初期電荷分離状態形成に伴い,波長816 nmにおいて減衰する新規な成分(red-BChls)を見いだした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

緑色イオウ細菌、へリオバクテリアの反応中心は酸素に対して不安定であるために標品調製が難しく、長らく構造解析に基づく機能解析には至らなかった。本研究では、へリオバクテリア反応中心の構造解析を、キノンを保持したまま解明できたことは非常に意義深い。またフェムト秒ポンプ・プローブ分光法を用い、へリオバクテリア反応中心の励起エネルギー移動から初期電荷分離形成過程までを追跡し、最長波長成分(red-BChls)を見いだした。始原型反応中心であるhRCの光エネルギー変換機構を理解する上で大変意義のある成果であり、今後、詳細な構造機能相関の解明に大いに貢献するものと期待される。

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (37件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (27件) (うち国際学会 6件、 招待講演 1件) 図書 (3件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Energy transfer fluctuation observed by single-molecule spectroscopy of red-shifted bacteriochlorophyll in the homodimeric photosynthetic reaction center2022

    • 著者名/発表者名
      Kondo Toru、Mutoh Risa、Arai Shun、Kurisu Genji、Oh-oka Hirozo、Fujiyoshi Satoru、Matsushita Michio
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 156 号: 10 ページ: 105102-105102

    • DOI

      10.1063/5.0077290

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Energy transfer and primary charge separation upon selective femtosecond excitation at 810 nm in the reaction center complex from Heliobacterium modesticaldum2020

    • 著者名/発表者名
      Kojima Risa、Yamamoto Hayata、Azai Chihiro、Uragami Chiasa、Hashimoto Hideki、Kosumi Daisuke、Oh-oka Hirozo
    • 雑誌名

      Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry

      巻: 401 ページ: 112758-112758

    • DOI

      10.1016/j.jphotochem.2020.112758

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Green Bacteria ? Energy Transfer and Electron Transport2020

    • 著者名/発表者名
      Oh-oka Hirozo、Harada Jiro、Azai Chihiro.
    • 雑誌名

      Reference Module in Life Sciences

      巻: 1 ページ: 1-19

    • DOI

      10.1016/b978-0-12-819460-7.00031-1

    • ISBN
      9780128220405
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cryogenic Single-Molecule Spectroscopy of the Primary Electron Acceptor in Photosynthetic Reaction Center2020

    • 著者名/発表者名
      T. Kondo, R. Mutoh, H. Tabe, G. Kurisu, H. Oh-oka, S. Fujiyoshi, and M. Matsushita
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. Lett.

      巻: - 号: 10 ページ: 3980-3986

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.0c00891

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 嫌気性緑色硫黄細菌におけるRieske/cytb複合体とc型シトクロムとの構造機能相関の解析2022

    • 著者名/発表者名
      岸本拓、浅井智広、武藤梨沙、田中秀明、宮ノ入洋平、栗栖源嗣、大岡宏造
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヘリオバクテリア光合成反応中心におけるカロテノイド励起後のエネルギー移動反応解析2022

    • 著者名/発表者名
      小島理沙、野原大暉、浅井智広、小澄大輔、大岡宏造
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 細菌と植物のもつ多様な光合成I 型反応中心の光捕集機能に関する比較2021

    • 著者名/発表者名
      木村明洋、鬼頭宏任、浜口祐、米倉功治、川上恵典、菓子野康浩、浅井智広、大岡宏造、伊藤繁
    • 学会等名
      量子生命科学会第3回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Structure-function relationships between the Rieske/cytb complex and c-type cytochromes in anaerobic photosynthetic green sulfur bacteria2021

    • 著者名/発表者名
      H. Kishimoto, C. Azai, R. Mutoh, H. Tanaka, Y. Miyanoiri, G. Kurisu, H. Oh-oka
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌におけるRieske/cytb複合体の嫌気的精製とc型シトクロムとの相互作用解析2021

    • 著者名/発表者名
      岸本拓、長岡孝浩、浅井智広、武藤梨沙、田中秀明、宮ノ入洋平、栗栖源嗣、大岡宏造
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Studies on interaction between Rieske/cytb complex and c-type cytochromes in strictly anaerobic photosynthetic green sulfur bacteria2020

    • 著者名/発表者名
      H. Kishimoto, T. Nagaoka, C. Azai, R. Mutoh, H. Tanaka, Y. Miyanoiri,G. Kurisu and H. Oh-oka
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Studies on excitation energy transfer and primary charge separation in the reaction center complex from Heliobacterium modesticaldum2020

    • 著者名/発表者名
      R. Kojima, H. Yamamoto, C. Azai, C. Uragami, H. Hashimoto,D. Kosumi, H. Oh-oka
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌におけるRieske/cytb複合体の精製検討とcyt c-556との相互作用部位の同定2020

    • 著者名/発表者名
      岸本拓、長岡孝浩、浅井智広、武藤梨沙、田中秀明、宮ノ入洋平、栗栖源嗣、大岡宏造
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Heliobacterium modesticaldumの反応中心におけるエネルギーおよび電子移動機構の時間分解分光測定2020

    • 著者名/発表者名
      小島理沙、山元颯太、浅井智広、小澄大輔、大岡宏造
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Time-resolved spectroscopy of electron transfer processes upon selective excitation in the reaction center complex from Heliobacterium modesticaldum2019

    • 著者名/発表者名
      R. Kojima, C. Azai, S. Ando, T. Nakaniwa, H. Tanaka, G. Kurisu, C. Uragami, H. Hashimoto, D. Kosumi, H. Oh-oka
    • 学会等名
      International Conference on Artificial Photosynthesis 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural Analysis of the homodimeric photosynthetic reaction center with bound quinone from Heliobacterium modesticaldum2019

    • 著者名/発表者名
      T. Nakaniwa, R. Mutoh, K. Fushimi, T. Kondo, C. Azai, S. Itoh, T. Mizoguchi, H. Tamiaki, H. Tanaka, H. Oh-oka, G. Kurisu
    • 学会等名
      International Symposium on Diffraction Structural Biology 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural Analysis of the homodimeric photosynthetic reaction center from Heliobacterium modesticaldum2019

    • 著者名/発表者名
      T. Nakaniwa, R. Mutoh, K. Fushimi, T. Kondo, C. Azai, S. Itoh, T. Mizoguchi, H. Tamiaki, H. Tanaka, H. Oh-oka, G. Kurisu
    • 学会等名
      1st Japan-US Binational Semninar 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structure-function relationships among the soluble domain of the Rieske protein and cytochromes in green sulfur bacteria2019

    • 著者名/発表者名
      H. Kishimoto, T. Yamamoto, R. Mutoh, H. Tanaka, G. Kurisu, H. Oh-oka
    • 学会等名
      1st Japan-US Binational Semninar 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Isolation of the Rieske/cytochrome b complex from green sulfur bacteria and interaction of the Rieske protein with cytochrome c-5562019

    • 著者名/発表者名
      H. Kishimoto, T. Nagaoka, C. Azai, R. Mutoh, H. Tanaka, Y. Miyanoiri, G. Kurisu and H. Oh-oka
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Improved preparation of the reaction center complex from the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum2019

    • 著者名/発表者名
      K. Wada, C. Azai, T. Nakaniwa, G. Kurisu and H. Oh-oka
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Heliobacterium modesticaldum光合成反応中心への選択励起における励起エネルギー移動および電子移動反応2019

    • 著者名/発表者名
      小島理沙、山元颯太、浅井智広、小澄大輔、大岡宏造
    • 学会等名
      第30回光物性研究会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ヘリオバクテリア膜の光駆動キノン還元反応をFTIR分光法により検出する試み2018

    • 著者名/発表者名
      小島理沙、岸利華子、木村行宏、大岡宏造
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会および公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌のRieske/cyt b型シトクロム複合体の可溶化・精製の試み2018

    • 著者名/発表者名
      岸本拓、浅井智広、武藤梨沙、田中秀明、栗栖源嗣、大岡宏造
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会および公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] ヘリオバクテリア由来タイプ1光合成反応中心の構造機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      安藤俊介、仲庭哲津子、小島理沙、伏見こころ、田中秀明、大岡宏造、栗栖源嗣
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Solubilization and purification of the Rieske/cytochrome b complex in green sulfur bacteria2018

    • 著者名/発表者名
      H. Kishimoto, C. Azai, R. Mutoh, H. Tanaka, G. Kurisu and H. Oh-oka
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] The orientation of menaquinone in the heliobacterial reaction center analyzed with the EPR spectroscopy2018

    • 著者名/発表者名
      T. Kondo, C. Azai, S. Itoh and H. Oh-oka
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] X-ray structure of the type-I reaction center from Heliobacterium modesticaldum at 3.2 angstrom2018

    • 著者名/発表者名
      T. Nakaniwa, R. Mutoh, K. Fushimi, A. Yasuda, T. Mizoguchi, H. Tamiaki, C. Azai, H. Tanaka, S. Itoh, H. Oh-oka and G. Kurisu
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 多孔質ガラス板にcyt c6/光化学系 I/白金ナノ粒子複合体を固定化した光誘起水素発生実験2018

    • 著者名/発表者名
      平野誠人, 野地智康, 川上恵典, 神哲郎, 近藤政晴, 大岡宏造, 神谷信夫
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] へリオバクテリアが持つタイプ1型光合成反応中心のX線結晶構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      伏見こころ,仲庭哲津子,武藤梨沙,安田亜矢,溝口正,民秋均,浅井智広,田中秀明,伊藤繁,大岡宏造, 栗栖源嗣
    • 学会等名
      日本結晶学会2018年度年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Menaquinone (MQ) in the reaction center of Heliobacterium modesticaldum studied by ESP-EPR signal of P800+MQ-: its implication in the 3D structure2018

    • 著者名/発表者名
      H. Oh-oka, T. Kondo, C. Azai, T. Nakaniwa, H. Tanaka, G. Kurisu and S. Itoh
    • 学会等名
      16th International Symposium on Phototrophic Prokaryotes
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The electron acceptor menaquinone (MQ) in heliobacterial type-1 reaction center: the detection of the ESP-EPR signal of P800+MQ- state and its interpretation in the 3D structure2018

    • 著者名/発表者名
      H. Oh-oka, T. Kondo, C. Azai, S. Itoh, T. Nakaniwa, H. Tanaka, G. Kurisu
    • 学会等名
      2018 International Symposium of Innovative Research and Graduate Education in Biomedical Sciences
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌のRieske/cytb複合体とc型シトクロムの相互作用解析2018

    • 著者名/発表者名
      岸本拓、浅井智広、武藤梨沙、田中秀明、宮ノ入洋平、栗栖源嗣、大岡宏造
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [図書] 光合成2021

    • 著者名/発表者名
      日本光合成学会
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      朝倉書店
    • ISBN
      9784254171761
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 膜タンパク質工学ハンドブック 第3編 第7章「光合成電子伝達鎖における膜結合型シトクロム」2020

    • 著者名/発表者名
      岸本拓、大岡宏造(分担執筆)
    • 出版者
      株式会社エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860435370
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 膜タンパク質工学ハンドブック「光合成電子伝達鎖における膜結合型シトクロムc」2019

    • 著者名/発表者名
      岸本拓、大岡宏造(分担執筆)
    • 出版者
      株式会社エヌ・ティー・エス
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 光合成反応の分子機構

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/~ohoka/index.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 光合成反応の分子機構

    • URL

      http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/~ohoka/index.html

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書 2019 実施状況報告書
  • [備考] 光合成反応の分子機構

    • URL

      http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/~ohoka/publications.html

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

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