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抗がん剤標的酵素の精密構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K06600
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47020:薬系分析および物理化学関連
研究機関熊本大学

研究代表者

中村 照也  熊本大学, 大学院先導機構, 准教授 (40433015)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード構造生物学 / X線結晶構造解析 / 中性子結晶構造解析
研究成果の概要

本研究では、微量重力下で得られた結晶を用いた超高分解能X線結晶構造解析、大型結晶を用いたX線・中性子結晶構造解析を行うことで、ヒト酸化ヌクレオチド加水分解酵素の基質認識・阻害剤結合に重要な活性部位の水素原子の位置を明らかにした。また、新規基質の同定、その他の基質複合体構造解析を行うことで、基質特異性の構造学的知見を積み上げた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

酵素などのタンパク質の機能を原子レベルで理解するには、水素原子までをも明らかにする精密構造解析が必要不可欠である。本研究では、酸化ヌクレオチド加水分解酵素の精密構造解析を行うことで、酵素反応機構、阻害剤結合において重要な活性部位の水素原子を含めた構造情報を得た。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] RAD18 mediates DNA double-strand break-induced ubiquitination of chromatin protein2021

    • 著者名/発表者名
      Mustofa Md Kawsar、Tanoue Yuki、Chirifu Mami、Shimasaki Tatsuya、Tateishi Chie、Nakamura Teruya、Tateishi Satoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: in press 号: 1 ページ: 33-40

    • DOI

      10.1093/jb/mvab010

    • NAID

      40022722273

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lactose-appended β-cyclodextrin as an effective nanocarrier for brain delivery2020

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama Ryoma、Taharabaru Toru、Nishida Takumi、Ohno Yoshitaka、Maeda Yuki、Sato Masahiro、Ishikura Kandai、Yanagihara Kazunori、Takagi Hiroki、Nakamura Teruya、Ito Shingo、Ohtsuki Sumio、Arima Hidetoshi、Onodera Risako、Higashi Taishi、Motoyama Keiichi
    • 雑誌名

      Journal of Controlled Release

      巻: 328 ページ: 722-735

    • DOI

      10.1016/j.jconrel.2020.09.043

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Conformational Escape Reaction of HIV-1 against an Allosteric Integrase Inhibitor2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Tomofumi、Nakamura Teruya、Amano Masayuki、Miyakawa Toshikazu、Yamagata Yuriko、Matsuoka Masao、Nakata Hirotomo
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 94 号: 19 ページ: 1-20

    • DOI

      10.1128/jvi.00486-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural analysis of TIFA: Insight into TIFA-dependent signal transduction in innate immunity2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Teruya、Hashikawa Chie、Okabe Kohtaro、Yokote Yuya、Chirifu Mami、Toma-Fukai Sachiko、Nakamura Narushi、Matsuo Mihoko、Kamikariya Miho、Okamoto Yoshinari、Gohda Jin、Akiyama Taishin、Semba Kentaro、Ikemizu Shinji、Otsuka Masami、Inoue Jun-ichiro、Yamagata Yuriko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 5152-5152

    • DOI

      10.1038/s41598-020-61972-6

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] X-ray Structure Analysis of Human Oxidized Nucleotide Hydrolase MTH1 using Crystals Obtained under Microgravity2019

    • 著者名/発表者名
      Nakamura T, Hirata K, Fujimiya K, Chirifu M, Arimori T, Tamada T, Ikemizu S, Yamagata Y
    • 雑誌名

      International Journal of Microgravity Science and Application

      巻: 36 号: 1 ページ: 360103

    • DOI

      10.15011//jasma.36.360103

    • NAID

      130007769928

    • ISSN
      2188-9783
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] SIRT7 has a critical role in bone formation by regulating lysine acylation of SP7/Osterix2018

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Masatoshi、Yoshizawa Tatsuya et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9 号: 1 ページ: 2833-2833

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05187-4

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Anammox Organism KSU-1 Expresses a Novel His/DOPA Ligated Cytochrome c2018

    • 著者名/発表者名
      Hira Daisuke、Kitamura Ryuji、Nakamura Teruya、Yamagata Yuriko、Furukawa Kenji、Fujii Takao
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 430 号: 8 ページ: 1189-1200

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2018.02.017

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 自然免疫に関わるシグナル分子TIFAの構造学的研究2020

    • 著者名/発表者名
      中村照也
    • 学会等名
      日本結晶学会 令和2年度年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 酵素の基質特異性に関わる水素原子の観察2020

    • 著者名/発表者名
      中村照也
    • 学会等名
      CBI学会 2020年大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 酵素の精密構造解析 抗がん剤標的分子の基質認識における水素原子の役割2019

    • 著者名/発表者名
      中村 照也
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会 2019年大会・第70回日本電気泳動学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト酸化ヌクレオチド加水分解酵素の新規基質の同定2019

    • 著者名/発表者名
      藤宮 佳菜、中村 照也、平田 啓介、池鯉鮒 麻美、池水 信二、山縣 ゆり子
    • 学会等名
      第43回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ゲノム安定性維持機構の構造生物学2019

    • 著者名/発表者名
      中村 照也
    • 学会等名
      第2回熊本大学ライフサイエンスシーズ探索研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Crystal structure of human oxidative nucleotide hydrolase in complex with a newly found substrate2018

    • 著者名/発表者名
      Teruya Nakamura
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト酸化ヌクレオチド加水分解酵素の構造学的研究-水素原子レベルでの酵素反応機構の解明を目指して-2018

    • 著者名/発表者名
      中村 照也
    • 学会等名
      平成30年度iBIX-JAXA-KEK物構研-QST合同タンパク質研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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