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がん微小環境における免疫抑制性細胞分化制御ネットワークのregulome解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K07204
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分50010:腫瘍生物学関連
研究機関東京医科歯科大学 (2020)
横浜市立大学 (2018-2019)

研究代表者

中林 潤  東京医科歯科大学, 統合教育機構, 教授 (80322733)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2019年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2018年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードネットワーク / 細胞分化 / 転写制御 / 遺伝子発現 / TAM / 転写制御ネットワーク / 細胞種特異的転写因子 / 運命決定 / モジュール / centrality / degree distribution / 階層構造 / ディープラーニング
研究成果の概要

近年、発がんのプロセスにおいて、Tumor Associated MAcrophage(TAM)が非常に重要な役割を果たすことが明らかとなっている。本研究ではTAMの分化を制御する転写制御ネットワークを解明することを目的として行った。まずTAM分化のモデルとして、血球系細胞系譜の分化を制御する転写制御ネットワークの解明を試みた。血球系細胞の遺伝子発現パターンを解析した結果、血液細胞分化系譜における転写制御ネットワークの構造の変化を明らかとすることができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

近年、発がんのプロセスにおいてTAMが非常に重要な役割を果たすことが明らかとなっている。本研究の成果は、TAMの分化を制御している転写制御ネットワークの構造を解明する第一歩となると考えられる。今後、TAM分化のメカニズムを明らかとし新規抗がん剤の開発に役立と考えられる。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Structural changes in transcriptional regulatory networks for cell-type-specific gene expression during hematopoiesis.2020

    • 著者名/発表者名
      Nakabayashi J
    • 雑誌名

      Proceedings of 2020 24th International Conference on Circuits, Systems, Communications and Computers (CSCC)

      巻: 1 ページ: 96-105

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structural changes in transcriptional regulatory networks for cell-type-specific gene expression during hematopoiesis.2020

    • 著者名/発表者名
      Nakabayashi jJ
    • 学会等名
      24th International Conference on Circuits, Systems, Communications and Computers (CSCC)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural changes in transcriptional regulatory networks for cell-type-specific gene exression during hematopoiesis2020

    • 著者名/発表者名
      Jun Nakabayashi
    • 学会等名
      24th International Conference on Circuits, Systems, Communications and Computers
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Transcriptional Regulatory Networks (TRNs) of cell type specific gene expression in hematopoiesis2018

    • 著者名/発表者名
      中林潤
    • 学会等名
      Society of Mathematical Biology
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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