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唾液メタボローム解析による膵癌早期診断システムの構築に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 18K07262
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
研究機関山梨大学

研究代表者

板倉 淳  山梨大学, 大学院総合研究部, 特任教授 (10252032)

研究分担者 市川 大輔  山梨大学, 大学院総合研究部, 教授 (20347446)
杉本 昌弘  慶應義塾大学, 政策・メディア研究科(藤沢), 教授 (30458963)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2019年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2018年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
キーワードメタボローム / 唾液 / 癌 / スクリーニング / 膵癌 / 定量的決定木 / new onset diabetis / 早期診断
研究実績の概要

今年度は、データの精度を向上のため、サポート・ベクター・マシーンと定量的決定木Adtree (Alternative decision tree)の組み合わせにより、相関に関係なく幅広い変数を同時に考慮して、高精度に識別する数理モデルを開発した。データは複数に分割して多施設データを模擬した評価試験を行い、またデータ解析上での評価試験も多数行った。具体的には最初に同一検体を何度も測定し、測定装置におけるデータのバラつきを確認し、これらを仮想的にノイズとしてデータ付加し、それでも精度が劣化しにくいモデルを開発した。クロスバリデーション試験やブートストラップ検定も実施し、ノイズに強いロバストなモデルを構築した。
大規模検診センターにおける実臨床応用に向けて、本研究用検体採取キット(Salivachecker)の導入を行い、倫理上の問題、運用上(採取・保管・輸送・解析・精度・結果のフィードバック・患者のフォローアップ)に問題ない事を確認した。COVID-19の影響で、大規模スクリーニングの開始には至らなかったため、次年度には膵癌・乳癌のハイリスクグループを中心に大規模スクリーニングを開始すべく準備を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

4: 遅れている

理由

COVID-19の影響で、連携検診センターでの検診業務の大幅な縮小、本スクリーニングシステム運用の制限があったため。

今後の研究の推進方策

本年度は最終年であるため可能な範囲で検体膵癌、乳癌を中心としたのハイリスクグループを対象にスクリーニング検査を実施し次期科学研究に繋げる臨床データの集積と解析を行い大規模スクリーニングに向けたエビデンスとする。

報告書

(6件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2019

すべて 学会発表 (4件) (うち国際学会 4件)

  • [学会発表] Analysis of saliva metabolites to develop early detection system for pancreatic cancer2020

    • 著者名/発表者名
      Itakura J., Sugimoto M., Sunamura M., Saito R., Hosomura N., Amemiya H., Kawaida H., Okamoto H., Kouno H., Ichikawa D., Ootaka M., Yoda Y., Shindo H., Takano S. , Fukazawa M., Satou T.
    • 学会等名
      52nd Meeting of the European Pancreatic Club
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of saliva metabolites to develop early detection system for pancreatic cancer2019

    • 著者名/発表者名
      Jun Itakura, Masahiro Sugimoto, Makoto Sunamura, Kazunori Takahashi, Ryou Saito, Naohiro Hosomura, Hidetake Amemiya, Hiromichi Kawaida, Hirotaka Okamoto, Hiroshi Kohno, Daisuke Ichikawa Hiroko Shindo, Shinichi Takano, Mitsuharu Fukazawa, Tadashi Sato
    • 学会等名
      51th meeting of Europian pancreatic clib
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Early diagnosis of PDAC by metabolomics with alternative decision tree-based machine learning methods2019

    • 著者名/発表者名
      Makot Sunamura, Akihiko Tsuchida, Tako Itoi, Masahiro Sugimoto, Shigeyuki Kawachi, Kyouko Shimizu, Masao Toki, Jun Itakura, Minoru Kitago
    • 学会等名
      50th Anniversary meeting of American pancreatic association Japan pancreas society
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of saliva metabolites to develop early detection system for pancreatic cancer2019

    • 著者名/発表者名
      Jun Itakura, Masahiro Sugimoto, Makoto Sunamura, Kazunori Takahashi, Ryou Saito, Naohiro Hosomura, Hidetake Amemiya, Hiromichi Kawaida, Hirotaka Okamoto, Hiroshi Kohno, Daisuke Ichikawa Hiroko Shindo, Shinichi Takano, Mitsuharu Fukazawa, Tadashi Sato
    • 学会等名
      50th Anniversary meeting of American pancreatic association Japan pancreas society
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-12-25  

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