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高感度DNAメチル化解析法を用いた胆管がん早期診断法構築に向けた基礎的研究

研究課題

研究課題/領域番号 18K07326
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
研究機関鹿児島大学

研究代表者

横山 勢也  鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (20569941)

研究分担者 谷本 昭英  鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (10217151)
東 美智代  鹿児島大学, 医歯学域鹿児島大学病院, 准教授 (60315405)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード胆管癌 / エピジェネティクス / 予測モデル / 機械学習 / 次世代シークエンス / DNAメチル化 / cholangiocarcinoma / DNA methylation / NGS / BSAS / prognosis prediction / DNAメチル化 / 膵臓癌 / 予後予測 / DNA methyaltion / 次世代シークエンサー / 早期発見 / ムチン / リキッドバイオプシ
研究成果の概要

胆管癌は、数ある癌の中でも早期発見はもちろん、治癒を望める段階での診断が困難な難治性の癌である。それゆえ、胆管癌の早期診断法の確立、さらには最近注目されている粘液産生胆管腫瘍と粘液性嚢胞性胆管腫瘍の悪性度判断法の確立が望まれている。本課題においては、Bisulfite Amplicon Sequencing: BSASによる胆管腫瘍の悪性度に関連するムチン分子ファミリー遺伝子群を含む14種のがん関連遺伝子のメチル化解析パネルを構築し、胆管癌組織検体の腫瘍部・非腫瘍部(125症例: 250検体)のメチル化解析を行った。さらに、臨床情報と比較することで、臨床応用へ向けたその有用性を評価した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

がん細胞株においてエピジェネティクスによるがん遺伝子・がん抑制遺伝子の発現制御が明らかにされてきた。近年においては、様々なヒト組織において発がん過程におけるがん遺伝子・がん抑制遺伝子の発現とエピジェネティクスの関係が報告されている。そこで、胆管組織検体・胆汁液検体において、胆管腫瘍の悪性度に関連するムチン分子ファミリー遺伝子群を含むがん関連遺伝子の発現と、DNAメチル化の関係性を明らかにできれば、希少性の高い難治がんである、胆管癌の早期発見に向けた臨床応用が可能になると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Predicted Prognosis of Pancreatic Cancer Patients by Machine Learning.2020

    • 著者名/発表者名
      Seiya Yokoyama, Taiji Hamada, Michiyo Higashi, Kei Matsuo, Kousei Maemura, Hiroshi Kurahara, Michiko Horinouchi, Tsubasa Hiraki, Tomoyuki Sugimoto, Toshiaki Akahane, Suguru Yonezawa, Marko Kornmann, Surinder K Batra, Michael A Hollingsworth, Akihide Tanimoto
    • 雑誌名

      Clinical cancer research

      巻: - 号: 10 ページ: 2411-2421

    • DOI

      10.1158/1078-0432.ccr-19-1247

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Next-generation sequencing analysis of endometrial screening liquid-based cytology specimens: a comparative study to tissue specimens2020

    • 著者名/発表者名
      Akahane Toshiaki、Kitazono Ikumi、Yanazume Shintaro、Kamio Masaki、Togami Shinichi、Sakamoto Ippei、Nohara Sachio、Yokoyama Seiya、Kobayashi Hiroaki、Hiraki Tsubasa、Suzuki Shinsuke、Ueno Shinichi、Tanimoto Akihide
    • 雑誌名

      BMC Medical Genomics

      巻: 13 号: 1 ページ: 101-101

    • DOI

      10.1186/s12920-020-00753-6

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A tailored next‐generation sequencing panel identified distinct subtypes of wildtype IDH and TERT promoter glioblastomas2020

    • 著者名/発表者名
      Higa Nayuta、Akahane Toshiaki、Yokoyama Seiya、Yonezawa Hajime、Uchida Hiroyuki、Takajo Tomoko、Kirishima Mari、Hamada Taiji、Matsuo Kei、Fujio Shingo、Hanada Tomoko、Hosoyama Hiroshi、Yonenaga Masanori、Sakamoto Akihisa、Hiraki Tsubasa、Tanimoto Akihide、Yoshimoto Koji
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 111 号: 10 ページ: 3902-3911

    • DOI

      10.1111/cas.14597

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] PCP4/PEP19 downregulates neurite outgrowth via transcriptional regulation of Ascl1 and NeuroD1 expression in human neuroblastoma M17 cells2020

    • 著者名/発表者名
      Kitazono Ikumi、Hamada Taiji、Yoshimura Takuya、Kirishima Mari、Yokoyama Seiya、Akahane Toshiaki、Tanimoto Akihide
    • 雑誌名

      Laboratory Investigation

      巻: 100 号: 12 ページ: 1551-1563

    • DOI

      10.1038/s41374-020-0462-z

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 胆管癌におけるDNAメチル化解析2019

    • 著者名/発表者名
      横山勢也,東美智代,谷本昭英
    • 学会等名
      第108回日本病理学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] DNAメチル化解析結果を用いた計算機科学による膵癌予後予測2019

    • 著者名/発表者名
      横山勢也,東美智代,谷本昭英
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] DNAメチル化解析結果を用いた計算機科学による膵癌予後予測2019

    • 著者名/発表者名
      横山勢也,東美智代,谷本昭英
    • 学会等名
      第4回黒潮カンファレンス
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] MUC1およびMUC4遺伝子のメチル化解析による膵癌摘出術後の予後評価2018

    • 著者名/発表者名
      横山勢也,東美智代,谷本昭英
    • 学会等名
      日本病理学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] PDAC摘出術後におけるムチン遺伝子のメチル化解析を用いた予後予測法の構築2018

    • 著者名/発表者名
      横山勢也,東美智代,谷本昭英
    • 学会等名
      日本癌学会学
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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