消化器がんリスク関連機能SNPの解析及びその臨床応用

• 研究課題/領域番号: 18K08665
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分55020:消化器外科学関連
• 研究機関: 千葉県がんセンター(研究所)
• 研究代表者: 中村 洋子 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター, 主任上席研究員 (60260254)
• 研究分担者: 下里 修 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター 腫瘍ゲノム研究室, 室長 (30344063) ; 巽 康年 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター 腫瘍ゲノム研究室, 研究員 (00450578)
• 研究期間 (年度): 2018-04-01 – 2021-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2020年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2019年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2018年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: がん / 遺伝子 / ゲノム / SNP / がん予防

研究成果の概要

がんリスクを予測する新規バイオマーカー開発を目的とし、がん関連遺伝子の次世代シーケンス解析を行い、がん関連非同義生殖細胞系列一塩基多型（SNP）を同定した。その結果、前向きコホート研究の参加者のうち、大腸がんを発症したグループは2個のSNPを18.6％と16.3％の頻度で保有し、胃がんを発症したグループは1個のSNPを12.5％の頻度で保有すること、これらSNPは非リスクグループの参加者と比較して、リスクグループで有意に濃縮されることを見出した。 そのうち2個のSNPは機能ドメイン内に存在することから、これらのSNPが遺伝子の機能を変化させ、特定の悪性腫瘍の発生に関連していることが示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

体細胞変異の頻度が高いと評価されたがん関連遺伝子409 種類の全エクソン解析をすることで、がんリスク多型と体細胞でのがんドライバー変異、さらに遺伝子変異のパターンから変異Signature及びコピーナンバーの変異を一度に統合して解析することは、がんの遺伝子異常を推測することが可能になると考えられる。我々は、個々の患者の包括的な理解が多数のゲノム情報の組み合わせでがん予防のバイオマーカーとして確立でき、がん臨床バイオマーカー、発がん機構の解析と結びつくことで特色のある独創的なものとなると考える。この成果は、Clinical Genomicsの概念を実際のがん臨床に反映されていくものと期待される。

研究成果

• [雑誌論文] A Nobel Multivariate Index for Cancer Risk Detection Based On the Serum Trace Elements: Metallo-Balance Method (2020)
  • 著者名/発表者名: Naoyuki Okamoto1, Haruo Mikami2, Yohko Nakamura2, Miho Kusakabe2, Naohito Yamamoto3, Nobuhiro Takiguchi4, Yoshihiro Nabeya5, Hiroaki Soda6, Satoshi Fukasawa7 Takeshi Kishida8, Manabu Shiozawa9, Akira Yoshida10, Takuya Shimizu1, Shunsuke Fujimoto1, Mitsuhiro Ueda1, Seiichi Inagaki1 Yohei Miyagi11, Hiroki Nagase2
  • 雑誌名: Journal of Cancer Epidemiology and Prevention 巻: 5 ページ: 1-1
  • 査読あり
• [雑誌論文] A multicentre clinical validation of AminoIndex Cancer Screening (AICS). (2019)
  • 著者名/発表者名: Mikami H, Kimura O, Yamamoto H, Kikuchi S, Nakamura Y, Ando T, Yamakado M.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 9 号: 1 ページ: 13831-13831
  • DOI: 10.1038/s41598-019-50304-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Co-Inhibition of the DNA Damage Response and CHK1 Enhances Apoptosis of Neuroblastoma Cells. (2019)
  • 著者名/発表者名: Ando K, Nakamura Y, Nagase H, Nakagawara A, Koshinaga T, Wada S, Makishima M.
  • 雑誌名: Int J Mol Sci. 巻: 20
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Programmed expression of pro-apoptotic BMCC1 during apoptosis, triggered by DNA damage in neuroblastoma cells. (2019)
  • 著者名/発表者名: Islam MS, Takano R, Yokochi T, Akter J, Nakamura Y, Nakagawara A, Tatsumi Y.
  • 雑誌名: BMC Cancer. 巻: 19 号: 1 ページ: 542-542
  • DOI: 10.1186/s12885-019-5772-4
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] A large cohort study to evaluate the cancer screening test measuring serum trace and major element: Metallo-balance (2019)
  • 著者名/発表者名: Haruo Mikami, Yohko Nakamura, Miho Kusakabe, Hiroki Nagase
  • 学会等名: 第78回日本癌学会学術総会
• [学会発表] 血清中の元素含有量を用いた新たながんスクリーニング法開発に関する研究 ～メタロバランス～ (2018)
  • 著者名/発表者名: 三上春夫、岡本直幸、宮城洋平、中村洋子、永瀬浩喜
  • 学会等名: 第27回日本癌病態治療研究会
• [学会発表] 血清中の元素含有量を用いた新たながんスクリーニング法開発に関する研究 (2018)
  • 著者名/発表者名: 中村洋子、三上春夫、宮城洋平、永瀬浩喜
  • 学会等名: 第77回日本癌学会学術総会
• [学会発表] 血清中の元素含有量を用いた新たながんスクリーニング法の開発に関する研究 (2018)
  • 著者名/発表者名: 三上春夫、宮城洋平、中村洋子、永瀬浩喜
  • 学会等名: 第56回日本癌治療学会学術集会
• [備考] 千葉県がんセンター研究所
  • URL: https://www.pref.chiba.lg.jp/gan/kenkyujo/index.html
• [備考] 千葉県がんセンター研究所Facebook
  • URL: https://www.facebook.com/CCCRI.chiba.gan.kenkyujo
• [備考] 千葉県がんセンター研究所Facebook
  • URL: https://m.facebook.com/CCCRI.chiba.gan.kenkyujo