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パターン認識に基づく新たな炎症病態解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 18K08892
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55060:救急医学関連
研究機関長崎大学

研究代表者

田島 吾郎  長崎大学, 病院(医学系), 准教授 (00437427)

研究分担者 松本 直也  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 客員研究員 (50359808)
山野 修平  長崎大学, 病院(医学系), 助教 (60570538)
梅原 敬弘  産業医科大学, 医学部, 准教授 (60617421)
池松 和哉  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 教授 (80332857)
田崎 修  長崎大学, 病院(医学系), 教授 (90346221)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード全身性炎症反応 / 敗血症 / 熱傷 / パターン認識 / 全身性炎症 / 遺伝子 / パターン / パターン分析 / 炎症 / 感染 / 自然免疫 / パターン解析 / 判別分析
研究成果の概要

感染性炎症(敗血症)、非感染性炎症(熱傷)と病態の異なるマウス全身性炎症モデルを用いて、次世代シーケンサーで白血球のRNAシーケンスを施行した。トランスクリプトーム解析で各炎症病態で発現する遺伝子を網羅的に測定し、GO解析で病態に特徴的な遺伝子群を抽出した。遺伝子群のPCRによる測定値をスケーリングして遺伝子発現をパターン化した。遺伝子発現には病態に特徴的なパターンがあり、実測値とパターン化した値に対して正準判別分析を施行することで、重症度と無関係に各病態を100%判別可能であった。トランスクリプトーム解析で抽出した遺伝子発現パターンによる炎症病態の新たな病態判別法の可能性が示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

集中治療患者における原因不明の発熱や炎症病態では、炎症・抗炎症に関わるさまざまなバイオマーカーの上昇が報告されるが、単独のマーカーによる診断は困難で、常に‘炎症と抗炎症のバランス’が重要であることが強調されてきた。本研究により複数マーカーの活性化のバランス(=パターン)を評価することで、‘炎症と抗炎症のバランス’を評価する新たな方法の可能性が示唆された。、複数マーカーのパターンを新たな指標として‘どのような’炎症か(炎症の量ではなく質)を評価することで、これまで診断不能であった不明熱や炎症病態の判別が可能となり、適切な病態理解、治療決定につなげられる可能性がある。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018

すべて 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件)

  • [学会発表] 全身性炎症におけるトランスクリプトーム解析を用いた病態判別法2022

    • 著者名/発表者名
      田島吾郎、上村恵理、村橋志門、三浦深雪、池松和哉、田崎修
    • 学会等名
      第50回日本救急医学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 病態と重症度からみた自然免疫システム の遺伝子発現分析2021

    • 著者名/発表者名
      田島吾郎、上村恵理、村橋志門、三浦深雪、梅原敬弘、池松和哉、田崎修
    • 学会等名
      第48回日本救急医学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] PATTERN-BASED ANALYSIS OF GENE EXPRESSION PROFILES BY CANONICAL DISCRIMINANT ANALYSIS COULD IDENTIFY PATHOPHYSIOLOGY REGARDLESS OF DISEASE SEVERITY2020

    • 著者名/発表者名
      Goro Tajima, Eri Uemura, Ayako Tokunaga, Miyuki Miura, Takahiro Umehara, Kazuya Ikematsu, Osamu Tasaki
    • 学会等名
      79th Annual Meeting of AAST and Clinical Congress of Acute Care Surgery
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 自然免疫システム遺伝子発現のパターン分析による病態判別2020

    • 著者名/発表者名
      田島吾郎、上村恵理、徳永彩子、三浦深雪、梅原敬弘、池松和哉、田崎修
    • 学会等名
      第48回日本救急医学会総会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] PATTERN-BASED ANALYSIS OF GENE EXPRESSION PROFILE BY CANONICAL DISCRIMINANT ANALYSIS COULD IDENTIFY THE PATHOPHYSIOLOGY REGARDLESS OF THE SEVERITY2020

    • 著者名/発表者名
      Goro Tajima, Eri Uemura, Ayako Tokunaga, Miyuki Miura, Takahiro Umehara, Kazuya Ikematsu, Osamu Tasaki
    • 学会等名
      79th Annual Meeting of AAST and Clinical Congress of Acute Care Surgery
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 全身性炎症における自然免疫システムの遺伝子発現パターンによる病態判別2019

    • 著者名/発表者名
      田島吾郎、徳永彩子、梅原敬弘、池松和哉、田崎修
    • 学会等名
      第47回日本救急医学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] NOVEL METHOD TO DISCRIMINATE THE PATHOPHYSIOLOGY OF INFLAMMATION BY PATTERN OF INNATE IMMUNE SYSTEM2019

    • 著者名/発表者名
      田島 吾郎
    • 学会等名
      Society of Critical Care Medicine 48th Critical Care Congress
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 全身性炎症における自然免疫受容体発現パターンの経時変化2018

    • 著者名/発表者名
      田島 吾郎
    • 学会等名
      第46回日本救急医学会総会・学術総会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-01-30  

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