研究課題
基盤研究(C)
HPV-HNSCC全ゲノムデータを用いて新しいプライマー/プローブセットを設計した。設計されたセットは、CaSki 細胞株DNAを用いてスクリーニングし、HPV-HNSCC患者の咽頭うがい液サンプルで確認した。結果、HPV-16ゲノムのうち、 E5領域とL2領域の間で最もリード数が多く、E1領域に普遍的に存在する領域が存在した。CLIA認定の実験室環境において、2つのセットとE7セットの組み合わせにより、咽頭うがい液サンプルにおいて感度は96%(27/28)、特異度は100%(0/15)だった。結論:HPV-HNSCCにおけるHPV-16 DNA検出能を改善できた。
HPV関連中咽頭癌は現在増加傾向を有するウィルス関連癌である。本癌に対する前がん病変は明確ではないため、今後嗽液や血液からのリキッドバイオプシーによる発がんリスク分類が必要となってくる領域である。本研究ではその発がんリスク分類を明らかにするために既存のゲノム情報からより検出感度を高めるプライマー/プローベセットを開発することに成功した。本研究をもとにこれまで困難であったHPV関連中咽頭癌の早期発見を可能にする基盤を作成したと考える。
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すべて 雑誌論文 (15件) (うち国際共著 5件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 5件)
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