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損傷微量DNAにおけるSTR解析に最適な前処理方法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 18K10136
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分58040:法医学関連
研究機関東京女子医科大学

研究代表者

町田 光世  東京女子医科大学, 医学部, 助教 (60468692)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2019年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード全ゲノム増幅法 / DNA損傷 / STR解析 / 全ゲノ増幅法 / STR / degraded DNA / WGA
研究成果の概要

法医学で扱う試料は様々な環境要因によりDNAが変性して採取量も少ないため、STR解析による個人識別が困難になることが多い。従って、変性した微量DNA試料を用いた時のSTR解析の成功率を高める方法について検討することは大変重要な課題である。全ゲノム増幅法の1つであるmIPEP法が変性DNAを用いた STR解析に対して有効かを検討した結果、DNAが5ngあれば変性度0.2未満で、また、濾紙から抽出されたDNAが0.05ng場合は変性度0.7以上で、スライドガラス上の唾液痕から抽出されたDNAの場合は変性度0.4以上で、mIPEP処理を行うことでSTR解析が改善されることが示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

事件現場等で採取された試料は様々な環境要因によりDNAが変性し、量も限られているため、通常のSTR解析による個人識別が困難になる場合が多い。法医学では量・質共に良い状態ではない試料に対し、個人識別の判定率を高める方法について検討することは重要な課題である。本研究ではSTR解析前に全ゲノム増幅法の1つであるmIPEP処理を行うことで、豊富なDNAの場合は高度な変性試料において、また微量なDNAの場合は軽度の変性試料であれば、STR解析成功率を高めることが明らかになった。つまり、今まで解析困難だった試料がmIPEP処理により解析可能となり、犯罪捜査への貢献が期待される。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] 変性試料に対するmIPEP法の有効性の検討2020

    • 著者名/発表者名
      町田光世、木林和彦
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 28(1) ページ: 51-52

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effectiveness of whole genome amplification prior to short tandem repeat analysis for degraded DNA2020

    • 著者名/発表者名
      Machida M, Kibayashi K
    • 雑誌名

      Forensic Science International: Genetics

      巻: 49 ページ: 102373-102373

    • DOI

      10.1016/j.fsigen.2020.102373

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 変性試料に対する全ゲノム増幅法の検討2019

    • 著者名/発表者名
      町田 光世、木林 和彦
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 27 ページ: 100-101

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Investigation of the efficiency of whole genome amplification prior to short tandem repeat analysis using degraded DNA2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuyo Machida, Kazuhiko Kibayashi
    • 雑誌名

      Forensic Science International: Genetics Supplement Series

      巻: 7 号: 1 ページ: 587-588

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2019.10.100

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 微量DNAを用いた全ゲノム増幅法の条件検討2018

    • 著者名/発表者名
      町田 光世、多木 崇、木林 和彦
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 26 ページ: 86-88

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 変性試料に対する全ゲノム増幅(mIPEP法)の有効性2020

    • 著者名/発表者名
      町田光世、木林和彦
    • 学会等名
      第104次日本法医学会学術全国集会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 変性DNAを用いた全ゲノム増幅法(mIPEP法)の検討2019

    • 著者名/発表者名
      町田光世、木林和彦
    • 学会等名
      第103次日本法医学会学術全国集会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Investigation of the efficiency of whole genome amplification prior to short tandem repeat analysis using degraded DNA2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuyo Machida, Kazuhiko Kibayashi
    • 学会等名
      The 28th Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 変性試料に対するmIPEP法の有効性の検討2019

    • 著者名/発表者名
      町田光世、木林和彦
    • 学会等名
      第28回日本DNA多型学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Evaluation of the Efficacy of Whole Genome Amplification for Degraded DNA2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuyo Machida, Kazuhiko Kibayashi
    • 学会等名
      71st American Academy of Forensic Science
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 変性DNAに対する全ゲノム増幅法の有効性の検討2018

    • 著者名/発表者名
      町田 光世、木林 和彦
    • 学会等名
      第87回日本法医学会学術関東地方集会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 変性試料に対する全ゲノム増幅法の検討2018

    • 著者名/発表者名
      町田 光世、木林 和彦
    • 学会等名
      第27回日本DNA多型学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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