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環境DNAを利用した新たな水生昆虫種多様性解析手法の確立と季節変動の評価

研究課題

研究課題/領域番号 18K13858
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分22060:土木環境システム関連
研究機関山梨大学

研究代表者

八重樫 咲子  山梨大学, 大学院総合研究部, 助教 (30756648)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード水生昆虫 / 環境DNA / DNAバーコーディング
研究成果の概要

近年、水生生物が水中に放出した環境DNAを利用した生物調査方法が開発された。特に次世代シーケンサーを利用したアンプリコン解析とDNAバーコーディングを組み合わせた網羅的な種多様性調査手法は新たな水圏生物調査手法として注目されている。この手法は魚類では研究開発が進む一方で、水質や流量調節などの人為的環境改変の指標生物となる水生昆虫を対象とした環境DNA研究は少ない。そこで本研究では水生昆虫を対象とした環境DNAバーコーディングの手法を検討し、環境DNA分析による水生昆虫の季節変動の調査を行なった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

環境DNAを利用した水圏生物調査は採水とDNA分析をもとに行われることから、従来型の調査手法と比べて低労力かつ素早い調査手法として注目されている。この手法は魚類では多く研究開発が行われているが、人為的な水圏環境改変の指標生物として利用される水生昆虫では研究が不足している。そこで本研究では、環境DNAの濃縮方法やPCR手法など、より効果的に水生昆虫群集調査を行うことができる環境DNAのバーコーディング手法を検討した。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 3件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Spatial Genetic Structure of the Invasive Riparian Tree Robinia pseudoacacia to Determine Migration Patterns to Inform Best Practices for Riparian Restoration2020

    • 著者名/発表者名
      Yaegashi, S., T. Omura, and K. Watanabe
    • 雑誌名

      AoB PLANTS

      巻: 12(5) 号: 5

    • DOI

      10.1093/aobpla/plaa043

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Detection of Adaptive Divergence in Populations of the Stream Mayfly Ephemera strigata with Machine Learning2020

    • 著者名/発表者名
      Li, B., S. Yaegashi, T. M. Carvajal, M. Gamboa and K. Watanabe
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 10 (13) 号: 13 ページ: 6677-6687

    • DOI

      10.1002/ece3.6398

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Fine-Scale Population Genetic Structure of Dengue Mosquito Vector, Aedes aegypti in Metropolitan Manila, Philippines2020

    • 著者名/発表者名
      Carvajal, T. M., K. Ogishi, S. Yaegashi, L. F. T. Hernandez, K. M. Viacrusis, H. T. Ho, D. Amalin, and K. Watanabe
    • 雑誌名

      PLOS Neglected Tropical Diseases

      巻: 4 号: 5 ページ: e0008279-e0008279

    • DOI

      10.1371/journal.pntd.0008279

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The effect of storm event on detection the species diversity of insects using environmental DNA meta-barcoding2020

    • 著者名/発表者名
      Sakiko YAEGASHI, Mohd Saifu Farhan Bin Tahir, Hirokazu HAGA
    • 雑誌名

      Proceedings of the 22nd IAHR-APD Congress 2020

      巻: 22

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] バイオアッセイの未来~水生昆虫を対象にした環境DNA 解析の観点から2020

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子
    • 学会等名
      第24回日本水環境学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] The effect of storm event on detection the species diversity of insects using environmental DNA meta-barcoding2020

    • 著者名/発表者名
      SAKIKO YAEGASHI, MOHD SAIFUL FARHAN BIN TAHIR, HIROKAZU HAGA
    • 学会等名
      22nd IAHR-APD Congress in Sapporo
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 甲府盆地を流下する河川における侵略的外来種ハリエンジュの遺伝子流動2020

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,宮沢直季
    • 学会等名
      応用生態工学会2020年度Web研究発表会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNA のメタバーコーディングによる水生昆虫群集調査2020

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子
    • 学会等名
      第56回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 甲府盆地における台風19号による出水が底生動物に与えた影響の調査2020

    • 著者名/発表者名
      鈴木航希, 新井涼介,金子栄廣,八重樫咲子
    • 学会等名
      第56回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 河川水中の環境DNAを利用した水生昆虫類の種多様性調査甲府盆地を対象として2020

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子・有賀廣弥・伊藤正比呂・金子栄廣
    • 学会等名
      環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Investigating the effect of storm on estimating aquatic insect community in water stream using environmental DNA2020

    • 著者名/発表者名
      Tahir Mohd Saifu Farhan Bin, Sakiko Yaegashi, Hidehiro Kaneko, Hirokazu Haga
    • 学会等名
      第47回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 塩川ダムによる河川環境の変化が水生昆虫群集に与える影響2020

    • 著者名/発表者名
      金子 栄廣・有賀 廣弥・八重樫 咲子
    • 学会等名
      第47回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 環境DNAバーコーディング解析を用いた河川水生昆虫の種多様性の解明 高知県四万十川を例として2019

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子・細川大樹・渡辺幸三
    • 学会等名
      応用生態工学会第23回広島大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 四万十川と仁淀川の環境DNA及び底生動物群集のメタバーコーディング解析2019

    • 著者名/発表者名
      石谷直渡・八重樫咲子・Joeselle M. S・Somar I. F.・渡辺幸三
    • 学会等名
      応用生態工学会第23回広島大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 環境DNAを利用した水生昆虫調査2019

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子
    • 学会等名
      第43回水生昆虫研究会岐阜・恵那大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 山梨県富士川水系における水生昆虫の流域内種多様性の評価2019

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子、新井涼介、金子栄廣
    • 学会等名
      環境工学研究フォーラム講演集
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ダムによる流量改変が水生昆虫種多様性にもたらす影響の評価2019

    • 著者名/発表者名
      新井涼介、清水隆二、金子栄廣、八重樫咲子
    • 学会等名
      第53回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 山梨県内におけるヒゲナガカワトビケラの集団遺伝特性の解析2019

    • 著者名/発表者名
      清水隆二、新井涼介、金子栄廣、八重樫咲子
    • 学会等名
      第53回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] マイクロサテライトマーカーを利用した環境DNAの種特異的PCRによる水生生物の生息域検索2018

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子、清水隆二、村松和十
    • 学会等名
      応用生態工学会第22回東京大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] GENETIC STRUCTURE AND GENE FLOW BETWEEN ALTITUDINALLY ISOLATED POPULATIONS OF STENOPSYCHE MARMORATA2018

    • 著者名/発表者名
      Sakiko YAEGASHI, Kozo WATANABE, Michael T. MONAGHAN, Tatsuo OMURA
    • 学会等名
      12th International Symposium on Ecohydraulics
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The search for the Habitats of Aquatic Caddisfly Stenopsyche marmorata (Trichoptera) from Environmental DNA using Species-specific Microsatellite Markers2018

    • 著者名/発表者名
      Sakiko YAEGASHI, Kazuto MURAMATSU
    • 学会等名
      The Water and Environment Technology Conference 2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 環境DNAを利用した水生昆虫の生息域検索2018

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子、村松和十
    • 学会等名
      第5回環境水質工学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 山梨大学 教員情報検索

    • URL

      http://nerdb-re.yamanashi.ac.jp/Profiles/338/0033748/profile.html

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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