| 研究課題/領域番号 |
18K14253
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分34020:分析化学関連
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| 研究機関 | 首都大学東京 |
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研究代表者 |
八巻 優佳 首都大学東京, 理学研究科, 客員研究員 (80781525)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2020-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2019年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2018年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
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| キーワード | 質量分析 / RNA / 転写後修飾 / シュードウリジン / LC-MS |
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| 研究成果の概要 |
ヒトリンパ芽球TK6細胞のウリジン一リン酸合成酵素 (UMPS) 遺伝子がノックアウトされた、ΔUMPS株に5,6-d2ラベルウリジンを処理培養し、細胞内で生合成されたRNAよりU2 snRNAおよびU3 snoRNAを精製した。精製したRNAをRNase消化の後にLC-MSで分析し、得られたスペクトルデータをデータベースAriadneでサーチすることで、U2 snRNAおよびU3 snoRNAにおける新規シュードウリジン化修飾サイトを明らかにした。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
シュードウリジン化酵素によりウリジンがシュードウリジン化修飾を受けても、化学的性質に変化は見られず質量に差が生じないことから、質量分析計で両者を判別することは困難であった。しかし、ΔUMPS株とラベルウリジンを用いることで、シュードウリジン化修飾により生じる質量差を利用することで、シュードウリジン化サイトを明らかにすることが可能になった。
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