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シトシンバリアントの網羅的解析法の開発と細胞評価への応用

研究課題

研究課題/領域番号 18K14258
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分34020:分析化学関連
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

栗之丸 隆章  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (50769693)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2018年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードイムノアッセイ / DNA / エピジェネティクス / シトシンバリアント
研究成果の概要

DNAのメチル化は、細胞の性質を決定づける後天的化学修飾(エピジェネティクス修飾)であり、遺伝子発現制御などに重要な役割を担う。近年、DNAが脱メチル化する過程で生じる新たなシトシン修飾体(シトシンバリアント)が発見され、疾患との関連性が高いことが報告されている。そのため、エピゲノム修飾の計測による医療診断や創薬開発に期待が高まり、各塩基の迅速検出法が世界規模で研究されている。本研究では、エピゲノム修飾の包括的な解析に向け、表面プラズモン共鳴(SPR)によるシトシンバリアントの一括計測法を開発した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ELISA法などの従来のイムノアッセイでは、一つのDNAに含まれる2種類以上の標的を評価できないため、4種のシトシンバリアントを一度に識別することが困難であった。本研究で開発したSPRイムノアッセイでは、同一DNAに含まれる4種のシトシンバリアントを連続して検出することに成功した。本研究で開発した手法は、シトシンバリアントの生物学的意義や産業的価値を明らかにする有用なツールになると期待できる。

報告書

(3件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (8件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Development of the Bioluminescent Immunoassay for the Detection of 5-Hydroxymethylcytosine in Dinoflagellate2019

    • 著者名/発表者名
      WU Chun、KURINOMARU Takaaki
    • 雑誌名

      Analytical Sciences

      巻: 35 号: 3 ページ: 301-305

    • DOI

      10.2116/analsci.18P401

    • NAID

      130007608033

    • ISSN
      0910-6340, 1348-2246
    • 年月日
      2019-03-10
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Immobilization of DNA on Biosensing Devices with Nitrogen Mustard Modified Linkers2019

    • 著者名/発表者名
      栗之丸隆章、小島直、栗田僚二
    • 雑誌名

      Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry

      巻: 77 号: 1

    • DOI

      10.1002/cpnc.85

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Sequential Assessment of Multiple Epigenetic Modifications of Cytosine in Whole Genomic DNA by Surface Plasmon Resonance2019

    • 著者名/発表者名
      栗之丸隆章、小島直、栗田僚二
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry

      巻: 91 号: 21 ページ: 13933-13939

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.9b03423

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Immobilization of DNA with nitrogen mustard-biotin conjugate for global epigenetic analysis2018

    • 著者名/発表者名
      小島直、須田友美、栗之丸隆章、栗田僚二
    • 雑誌名

      Analytica Chimica Acta

      巻: 1043 ページ: 107-114

    • DOI

      10.1016/j.aca.2018.09.008

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] シトシンバリアントの迅速計測にむけたSPRイムノアッセイの開発2019

    • 著者名/発表者名
      栗之丸 隆章
    • 学会等名
      関西バイオ医療研究会 第8回講演会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Microfluidic device for epigenome analysis2019

    • 著者名/発表者名
      Ryoji Kurita, Takaaki Kurinomaru, Naoshi Kojima
    • 学会等名
      The Second International Workshop by the 174th Committee JSPS on Symbiosis of Biology and Nanodevices
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Detection of Cytosine Variants of DNA Using Surface Plasmon Resonance-Based Immunoassay2018

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Kurinomaru, Naoshi Kojima, Ryoji Kurita
    • 学会等名
      The 45th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry / The 2st Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] エピゲノムのオンチップ分析向けたアルキル化リンカーの創成と応用2018

    • 著者名/発表者名
      栗田 僚二, 須田 友美, 栗之丸 隆章, 小島 直
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会 第38回研究会(CHEMINAS38)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] エピゲノムのオンチップ分析向けたアルキル化リンカーの創成2018

    • 著者名/発表者名
      栗田 僚二, 栗之丸 隆章, 小島 直
    • 学会等名
      2018年電気化学秋季大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] エピゲノム修飾の包括的評価にむけたSPRイムノアッセイの開発2018

    • 著者名/発表者名
      栗之丸 隆章, 小島 直, 栗田 僚二
    • 学会等名
      第12回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 核酸固定化試薬の開発とメチル化シトシンイムノアッセイへの応用2018

    • 著者名/発表者名
      小島 直, 栗之丸 隆章, 須田 友美, 栗田 僚二
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第4回年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] シトシンバリアントの一括計測に向けたSPRイムノアッセイの開発2018

    • 著者名/発表者名
      栗之丸 隆章, 小島 直, 栗田 僚二
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会 第37回研究会(CHEMINAS37)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 個人HP

    • URL

      https://staff.aist.go.jp/kurinomaru.t/

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-02-19  

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