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陸域環境の窒素固定を担う微生物基盤の刷新

研究課題

研究課題/領域番号 18K14366
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分38010:植物栄養学および土壌学関連
研究機関東京大学

研究代表者

増田 曜子  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任研究員 (80813237)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2018年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード鉄還元菌 / 窒素固定 / 水田土壌 / メタゲノム / Geomonas / Oryzomonas / Anaeromyxobacter / Geobacter / メタゲノム解析 / 安定同位体 / 土壌
研究成果の概要

研究成果1:鉄還元菌窒素固定は地球規模で普遍的かつ重要な事象であることの提唱。国内および海外127地点の土壌メタゲノム解析を行ったところ、うち79地点で鉄還元菌の窒素固定遺伝子が検出された。検出頻度は水田土壌だけでなく森林土壌、砂漠、極地土壌においても高かった。このことから、鉄還元菌による窒素固定は土壌環境において普遍的な事象である可能性が示された。
研究成果2:鉄還元菌が窒素固定活性を発揮することの証明。水田土壌から単離したAnaeromyxobacter属細菌が実際の土壌においても窒素固定活性を示すことを初めて実証した。また、その他新属の鉄還元菌も多数分離に成功し窒素固定活性を実証した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

窒素固定は大気中の窒素ガスを生物が利用できる形態の窒素に変換して土壌に供給する重要な反応である。19世紀末にはじめて窒素固定が発見されて以降、「土壌の窒素固定は植物共生細菌や光合成細菌が担う」というのが一般常識であった。しかし本研究により、窒素固定できる鉄還元菌が地球規模で普遍的に分布していること、そして既知の窒素固定細菌群よりも存在量が多い傾向も見出された。このことは窒素固定に関する定説を刷新して自然生態系の支持基盤の本質に迫るものであり、土壌学分野だけでなく、微生物学、地球科学、生態学といった自然科学分野全般において意義を持つ。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 5件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Geomonas silvestris sp. nov., Geomonas paludis sp. nov. and Geomonas limicola sp. nov., isolated from terrestrial environments, and emended description of the genus Geomonas2021

    • 著者名/発表者名
      Itoh Hideomi、Xu Zhenxing、Masuda Yoko、Ushijima Natsumi、Hayakawa Chie、Shiratori Yutaka、Senoo Keishi
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology

      巻: 71 号: 1

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.004607

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhancement of the nitrogen-fixing activity of paddy soils owing to iron application2021

    • 著者名/発表者名
      Masuda Yoko、Shiratori Yutaka、Ohba Hirotomo、Ishida Takanori、Takano Ryo、Satoh Sakura、Shen Weishou、Gao Nan、Itoh Hideomi、Senoo Keishi
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition

      巻: 1 号: 3 ページ: 1-5

    • DOI

      10.1080/00380768.2021.1888629

    • NAID

      210000158861

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Description of Three Novel Members in the Family Geobacteraceae, Oryzomonas japonicum gen. nov., sp. nov., Oryzomonas sagensis sp. nov., and Oryzomonas ruber sp. nov.2020

    • 著者名/発表者名
      Xu Zhenxing、Masuda Yoko、Hayakawa Chie、Ushijima Natsumi、Kawano Keisuke、Shiratori Yutaka、Senoo Keishi、Itoh Hideomi
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 8 号: 5 ページ: 634-634

    • DOI

      10.3390/microorganisms8050634

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DiazotrophicAnaeromyxobacterIsolates from Soils2020

    • 著者名/発表者名
      Masuda Yoko、Yamanaka Haruka、Xu Zhen-Xing、Shiratori Yutaka、Aono Toshihiro、Amachi Seigo、Senoo Keishi、Itoh Hideomi
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 86 号: 16

    • DOI

      10.1128/aem.00956-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用 オミクス解析から低窒素農業へ2020

    • 著者名/発表者名
      増田曜子
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 58 ページ: 143-150

    • NAID

      130007993004

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Geomonas oryzae gen. nov., sp. nov., Geomonas edaphica sp. nov., Geomonas ferrireducens sp. nov., Geomonas terrae sp. nov., four ferric-reducing bacteria isolated from paddy soil, and reclassification of three species of the genus Geobacter as members of the genus Geomonas gen. nov.2019

    • 著者名/発表者名
      Zhenxing Xu, Yoko Masuda, Hideomi Itoh, Natsumi Ushijima, Yutaka Shiratori, Keishi Senoo
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 10 ページ: 2201-2201

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.02201

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 見落とされてきた微生物の生態-メタトランスクリプトーム解析の応用-2021

    • 著者名/発表者名
      増田曜子
    • 学会等名
      土壌微生物×物質循環ワークショップ
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用 -マイクロバイオーム解析から低窒素農業へ-2019

    • 著者名/発表者名
      増田曜子
    • 学会等名
      土壌微生物学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nitrogen fixation by iron reducing bacteria - previously overlooked diazotrophs essential for sustainable soil-plant ecosystems -2019

    • 著者名/発表者名
      Masuda Yoko
    • 学会等名
      ASME
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in rice paddy soils: potent agents for sustainable crop production with low nitrogen input2019

    • 著者名/発表者名
      Masuda Yoko
    • 学会等名
      BAGECO
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Semi-ubiquitous presence of iron reducing bacterial nif genes in terrestrial soils2018

    • 著者名/発表者名
      Yoko Masuda
    • 学会等名
      ASME
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 鉄還元細菌の窒素固定能の検証2018

    • 著者名/発表者名
      山中遥加
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2018年度大会(神奈川大会)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 水田土壌の優占種、鉄還元菌の新機能-窒素肥沃度を支えるキープレーヤー-2018

    • 著者名/発表者名
      増田曜子
    • 学会等名
      第11回北陸合同バイオシンポジウム2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nitrogen fixing activity of iron reducing bacteria in paddy soils: potent agents for low nitrogen rice production in East Asia2018

    • 著者名/発表者名
      Yoko Masuda
    • 学会等名
      NARO-MARCO
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Iron-reducing bacteria is a ubiquitous but previously-overlooked driver of reductive nitrogen transformation in terrestrial ecosystems2018

    • 著者名/発表者名
      Yoko Masuda
    • 学会等名
      ASME
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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