• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

新規微生物イメージング技術を用いた未培養微生物の可視化とシングルセル解析への挑戦

研究課題

研究課題/領域番号 18K14514
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分40030:水圏生産科学関連
研究機関松江工業高等専門学校

研究代表者

山口 剛士  松江工業高等専門学校, 環境・建設工学科, 准教授 (30759832)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードclick chemistry / 高感度FISH法 / 機能遺伝子 / 視覚的検出技術 / HCR-FISH / Click chemistry / comammox / 視覚的検出 / 環境微生物
研究成果の概要

本研究では, 微生物の生態を明らかにするシングルセル解析に着目し, 未培養微生物が回収可能な視覚的検出技術の開発を目指し, Hybridization chain reaction-fluorescence in situ hybridization (HCR-FISH)法とclick chemistryを組み合わせて微生物の機能遺伝子の視覚的検出を行った. 本手法を大腸菌に組み込んだ機能遺伝子に適用したところ, click chemistryの反応時間や試薬濃度を変更することで視覚的検出が可能であった. さらに, 水処理装置内の微生物に適用させた結果, 一部の微生物から蛍光が得られた.

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では, 未培養微生物を視覚的に検出する手法開発を行った. この手法開発を用いて視覚的検出によって, 微生物回収が容易になり, 新たな微生物資源の発掘や微生物生態の解明につながると考えている. 社会的意義としても, 新たな微生物資源を発掘することで, 新規の水処理装置や環境改善に利用することができることから貢献度は高いと考えている.

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018

すべて 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件) 図書 (2件)

  • [学会発表] Click chemistryを用いたHCR-FISH法の適用可能性評価2022

    • 著者名/発表者名
      永妻志問, 山口剛士
    • 学会等名
      第56回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 高感度FISH法におけるclick chemistryの適用可能性評価2022

    • 著者名/発表者名
      永妻志問, 山口剛士
    • 学会等名
      第34回日本微生物生態学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] HCR-FISH法を用いた機能遺伝子の視覚的検出2021

    • 著者名/発表者名
      永妻志問, 大野裕之, 山口 剛士
    • 学会等名
      第55回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] HCR-FISH法を用いた微生物回収技術の最適化2021

    • 著者名/発表者名
      藤原澪, 山口 剛士
    • 学会等名
      第55回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] アジド-アルキンの環化付加反応を用いた微生物の視覚的検出技術の最適化2021

    • 著者名/発表者名
      山崎 綾乃, 木村 圭佑, 武邊 勝道, 山口 剛士
    • 学会等名
      第55回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] アジド・アルキンの環化付加反応を用いた大腸菌の視覚的検出2021

    • 著者名/発表者名
      山崎 綾乃, 木村 圭佑, 武邊 勝道, 山口 剛士
    • 学会等名
      第72回土木学会中国支部研究発表会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] アジド-アルキンの環化付加反応を用いた高感度FISH法の開発2020

    • 著者名/発表者名
      山崎綾乃, 木村圭佑, Bernhard Fuchs, Rudolf Amann, Jorg Wulf, 武邊勝道, 山口剛士
    • 学会等名
      第54回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Click chemistryを用いた機能遺伝子の視覚的検出技術の開発2019

    • 著者名/発表者名
      大野裕之, 山口剛士, 武邊勝道
    • 学会等名
      第53回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Microbial community structure and diversity of animal husbandry effluent in intermittent aeration reactor2018

    • 著者名/発表者名
      Yuki Mizuta, Tsuyoshi Yamaguchi and Kohdai Watari
    • 学会等名
      STI-Gigaku 2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [図書] 月刊 アグリバイオ 1月号2021

    • 著者名/発表者名
      山口剛士, 川上周司
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      北隆館
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] 月刊 細胞 11月号2020

    • 著者名/発表者名
      山口剛士, 川上周司
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      北隆館
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi