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祖先情報の欠損が乳用牛ゲノミック評価値のバイアスに及ぼす影響の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K14573
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分42010:動物生産科学関連
研究機関国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

山崎 武志  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 北海道農業研究センター, 上級研究員 (00414764)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2020年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード乳用牛 / ゲノミック評価 / バイアス
研究成果の概要

若い個体を早期に選抜するゲノミック評価は、乳用牛の世代間隔を大幅に短縮させたが、若い父母等、実データのない祖先をリファレンス集団(評価のベースとなる祖先集団)に含まないことによる評価精度の低下が問題となる。そこで、リファレンス集団の祖先情報が欠損した個体のゲノミック評価値に生じるバイアス(真の遺伝的能力からのズレ)を検証した。
乳用牛集団を模した仮想データにより、リファレンス集団に父牛を含む個体と含まない個体のゲノミック評価値のバイアスを比較したところ、選抜された能力では父牛情報が欠損した個体のゲノミック評価値のバイアスが大きくなり、リファレンス集団が小さいほど顕著であることが明らかとなった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

国際的なゲノミック評価開始から10年が経過した現在、世代間隔の短縮により、リファレンス集団に父牛が含まれない状態で若い個体を評価・選抜することが通常となった。本成果は、このような現状で生じている評価値のバイアスに関する原因の探求および補正の検討において重要な知見となる。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Genetic evaluation of heat tolerance in Holstein cows in Japan2020

    • 著者名/発表者名
      Hagiya Koichi、Atagi Yamato、Osawa Takefumi、Yamazaki Takeshi
    • 雑誌名

      Animal Science Journal

      巻: 91 号: 1

    • DOI

      10.1111/asj.13437

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic parameters for conception rate and milk production traits within and across Holstein herds with different housing types and feeding systems during the first 3 lactations2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki T.、Yamaguchi S.、Takeda H.、Osawa T.、Hagiya K.
    • 雑誌名

      Journal of Dairy Science

      巻: 103 号: 11 ページ: 10361-10373

    • DOI

      10.3168/jds.2020-18494

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ホルスタイン雌牛における飼養形態別の体型形質と在群性または在群期間との関係2021

    • 著者名/発表者名
      長坂 侑里、中堀 祐香、山口 諭、阿部 隼人、中川 智史、馬場 俊見、川上 純平、寺脇 良悟、山崎 武志、萩谷 功一
    • 学会等名
      日本畜産学会第128回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ホルスタイン種の暑熱ストレス耐性改良のためのメッシュ農業気象データの応用2021

    • 著者名/発表者名
      石田 惠香、泉 賢一、大澤 剛史、山口 茂樹、山崎 武志、萩谷 功一
    • 学会等名
      日本畜産学会第128回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Relationships between type traits and herd life of Holstein cows in different housing conditions in Japan2020

    • 著者名/発表者名
      長坂 侑里、中堀 祐香、山口 諭、阿部 隼人、中川 智史、山崎 武志、馬場 俊見、川上 純平、寺脇 良悟、萩谷 功一
    • 学会等名
      The 71th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparison of heat stress indicators based on weather station records in Holstein cows2020

    • 著者名/発表者名
      石田 惠香、泉 賢一、大澤 剛史、山口 茂樹、山崎 武志、萩谷 功一
    • 学会等名
      The 71th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 父の遺伝情報の欠損がゲノミック評価の精度に及ぼす影響2020

    • 著者名/発表者名
      及川康平、山崎武志、唄花子、高橋昌志、川原学
    • 学会等名
      日本畜産学会第127回大会(要旨受理、新型コロナウイルス感染拡大により中止)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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