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造礁サンゴの初期石灰化過程に関わる遺伝子の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K14745
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分44040:形態および構造関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

安岡 有理  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (70724954)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2018年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワード刺胞動物 / 変態 / バイオミネラリゼーション / 発生 / 進化 / 地球温暖化 / 海洋酸性化 / PKS / 比較トランスクリプトーム / カルシウム骨格 / 環境ストレス / ミドリイシ
研究成果の概要

サンゴの石灰化関連遺伝子に対するアンチセンスモルフォリノオリゴ(MO)をAcropora tenuis受精卵に顕微注入し、MO注入胚をポリプへと変態させてカルシウム骨格イメージングによって観察したが、石灰化に異常は見られなかった。一方、水温やpHを調整して、受精卵からの初期発生や幼生からの変態・石灰化に対する影響を検討したところ、サンゴ胚は低温(21℃以下)には弱い一方、高温(31℃)や低pHには耐久性があり、正常に発生して骨格を形成した。さらに幼生からポリプへの変態後の時間経過に応じたトランスクリプトーム解析を行った結果、既知の遺伝子と同様に発現変動する石灰化関連遺伝子を同定した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究の環境変動実験の結果、地球温暖化や海洋酸性化といった現代人類が直面している地球環境問題に対して、少なくともA. tenuisは正常に胚発生・着底して石灰化を始められるだけの頑健性を備えていることが示唆された。また、5-6月に産卵する通常のミドリイシと異なり、8-9月に産卵するAcropora sp.1のトランスクリプトーム解析を行ったことで、種を超えて保存された生命現象の解明や、産卵時期の変更に関わった遺伝子の同定など、今後のサンゴ研究に向けたデータ基盤が構築された。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件) 図書 (1件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Tissue-specific expression of carbohydrate sulfotransferases drives keratan sulfate biosynthesis in the notochord and otic vesicles of Xenopus embryos2023

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri
    • 雑誌名

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      巻: 11 ページ: 957805-957805

    • DOI

      10.3389/fcell.2023.957805

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Uncovering the mesendoderm gene regulatory network through multi-omic data integration2022

    • 著者名/発表者名
      Jansen Camden、Paraiso Kitt D.、Zhou Jeff J.、Blitz Ira L.、Fish Margaret B.、Charney Rebekah M.、Cho Jin Sun、Yasuoka Yuuri、Sudou Norihiro、Bright Ann Rose、Wlizla Marcin、Veenstra Gert Jan C.、Taira Masanori、Zorn Aaron M.、Mortazavi Ali、Cho Ken W.Y.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 38 号: 7 ページ: 110364-110364

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110364

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] LIM homeodomain proteins and associated partners: Then and now2021

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri、Taira Masanori
    • 雑誌名

      Current Topics in Developmental Biology

      巻: 145 ページ: 113-166

    • DOI

      10.1016/bs.ctdb.2021.04.003

    • ISBN
      9780128168332
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Morphogenetic mechanisms forming the notochord rod: The turgor pressure‐sheath strength model2020

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri
    • 雑誌名

      Development, Growth & Differentiation

      巻: 00 号: 6 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1111/dgd.12665

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolution of cis-regulatory modules for the head organizer gene goosecoid in chordates: comparisons between Branchiostoma and Xenopus2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri、Tando Yukiko、Kubokawa Kaoru、Taira Masanori
    • 雑誌名

      Zoological Letters

      巻: 5 号: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1186/s40851-019-0143-1

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evolutionary History of GLIS Genes Illuminates Their Roles in Cell Reprograming and Ciliogenesis2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri、Matsumoto Masahito、Yagi Ken、Okazaki Yasushi
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 37 号: 1 ページ: 100-109

    • DOI

      10.1093/molbev/msz205

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] De novo transcription of multiple Hox cluster genes takes place simultaneously in early Xenopus tropicalis embryos2019

    • 著者名/発表者名
      Kondo Mariko、Matsuo Megumi、Igarashi Kento、Haramoto Yoshikazu、Yamamoto Takayoshi、Yasuoka Yuuri、Taira Masanori
    • 雑誌名

      Biology Open

      巻: 8

    • DOI

      10.1242/bio.038422

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Microinjection of DNA Constructs into Xenopus Embryos for Gene Misexpression and cis-Regulatory Module Analysis2018

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri、Taira Masanori
    • 雑誌名

      Cold Spring Harbor Protocols

      巻: 2019 号: 1 ページ: pdb.prot097279-pdb.prot097279

    • DOI

      10.1101/pdb.prot097279

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Molecular Basis of the Gastrula Organizer in Amphibians and Cnidarians2018

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri、Taira Masanori
    • 雑誌名

      Reproductive and Developmental Strategies. Diversity and Commonality in Animals (Book)

      巻: - ページ: 667-708

    • DOI

      10.1007/978-4-431-56609-0_31

    • ISBN
      9784431566076, 9784431566090
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 発生ゲノミクスで探る脊椎動物の進化過程2023

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      生命誌 研究者セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオームから見たシロアゴガエルミトコンドリアゲノム進化の背景2023

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      広島大学両生類研究センターバイオリソース棟落成記念シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 動物胚初期発生における遺伝子制御ネットワークとその進化に関する研究2022

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      日本動物学会第93回早稲田大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ツメガエルを用いたミトコンドリアゲノム編集への挑戦ー第2章2022

    • 著者名/発表者名
      安岡有理、岡﨑康司
    • 学会等名
      日本動物学会第93回早稲田大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 初期胚における遺伝子発現の揺らぎと進化の関係を探る2022

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      第24回日本進化学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Fluctuation of gene expression levels in early embryos is correlated to environmental and evolutionary responses2022

    • 著者名/発表者名
      Yuuri Yasuoka, Chikara Furusawa, Yasushi Okazaki
    • 学会等名
      第55回日本発生生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Comparing fluctuation of gene expression profiles in embryos to dissect diversification of Xenopus tropicalis strains2021

    • 著者名/発表者名
      Yuuri Yasuoka
    • 学会等名
      18th International Xenopus Conference
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 遺伝子発現の多様性から制御ネットワーク進化の制約と方向性を探る2021

    • 著者名/発表者名
      安岡有理、古澤力、岡﨑康司
    • 学会等名
      JST CREST バイオDX領域キックオフシンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ツメガエルを用いたミトコンドリアゲノム編集への挑戦~序章~2021

    • 著者名/発表者名
      安岡有理、岡﨑康司
    • 学会等名
      日本動物学会第94回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 脊索の祖先的構成要素と形態形成様式の進化2021

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      第23回日本進化学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] シロアゴガエルと疑似ロングリードシークエンス2021

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      第14回日本ツメガエル研究集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Evolutionary History of GLIS1 and GLIS3 Illuminates Their Roles in Cell Reprograming and Ciliogenesis2021

    • 著者名/発表者名
      Yuuri Yasuoka, Masahito Matsumoto, Ken Yagi, and Yasushi Okazaki
    • 学会等名
      第54回日本発生生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Repeated subfunctionalization of Brachyury genes for notochord development (脊索の発生におけるBrachyury遺伝子の機能分担)2020

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      日本進化学会第22回オンライン大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 初期化因子GLIS1の進化的起源と祖先的役割2020

    • 著者名/発表者名
      安岡有理, 松本征仁, 八木研, 岡﨑康司
    • 学会等名
      日本動物学会第91回大会(招待講演)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Genome-wide Measurement for Fluctuation of Gene Regulatory Networks in Xenopus embryos2020

    • 著者名/発表者名
      Yuuri Yasuoka
    • 学会等名
      JSDB Online Trial Meeting 2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Genome-wide Measurement for Fluctuation of Gene Regulatory Networks in Xenopus embryos2020

    • 著者名/発表者名
      Yuuri Yasuoka
    • 学会等名
      第53回日本発生生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Genome-wide Measurement for Fluctuation of Gene Regulatory Networks in Xenopus embryos2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri
    • 学会等名
      Xenopus Resources and Emerging Technologies Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Why was the notail gene lost in many vertebrate lineages?2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri, Satoh Noriyuki
    • 学会等名
      52nd Annual Meeting of JSDB
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Evolutionary History of GLIS Genes Illustrates their Fundamental Roles in Cell Reprogramming and Ciliogenesis2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri, Matsumoto Masayuki, Yagi Ken, Okazaki Yasushi
    • 学会等名
      21st Annual Meeting of the Society of Evolutionary Studies, Japan
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Fluctuation of GRN in Xenopus tropicalis embryos2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuoka Yuuri
    • 学会等名
      12th Japan Xenopus Conference
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Complex evolution of brachyury paralogs during vertebrate notochord development2018

    • 著者名/発表者名
      Yuuri Yasuoka and Noriyuki Satoh
    • 学会等名
      第46回内藤コンファレンス(国際学会)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 脊椎動物の脊索発生におけるBrachyuryパラログの複雑な進化2018

    • 著者名/発表者名
      安岡有理、佐藤矩行
    • 学会等名
      第20回日本進化学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 進化学の視点がリプログラミング研究にどう貢献できるか?2018

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      第10回EvoDevo青年の会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] ネッタイツメガエル胚発生における転写因子ー標的遺伝子関係の揺らぎ測定2018

    • 著者名/発表者名
      安岡有理
    • 学会等名
      第12回XCIJ首都圏支部会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Keratan sulfate produces “water bags” in embryos2018

    • 著者名/発表者名
      Yuuri Yasuoka
    • 学会等名
      第51回日本発生生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [図書] ヒトゲノム事典2021

    • 著者名/発表者名
      井ノ上 逸朗, 今西 規, 河村 正二, 斎藤 成也, 颯田 葉子, 田嶋 敦
    • 総ページ数
      448
    • 出版者
      一色出版
    • ISBN
      9784910389127
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] Yuuri Yasuoka, Ph. D.

    • URL

      https://yuuriyasuoka.wordpress.com/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 応用ゲノム解析技術研究チーム

    • URL

      https://www.ims.riken.jp/labo/69/index_j.html

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] Research Map

    • URL

      https://researchmap.jp/yuuri/research_projects

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 初期化因子の驚きの進化を解明 -リプログラミング研究に新たな視点を与える-

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2019/20190913_3/index.html

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-01-30  

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