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Shedding light on genome evolution of a 220-million-year old's cockroach friend: Blattabacterium cuenoti

研究課題

研究課題/領域番号 18K14767
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分45020:進化生物学関連
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

ブギーニョン トマ  沖縄科学技術大学院大学, 進化ゲノミクスユニット, 准教授 (40817558)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2019年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2018年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワードcockroach / Blattabacterium / symbiosis / endosymbiont / blattabacterium / genome evolution / Endosymbionts / genome reduction / genome
研究成果の概要

私は内部共生細菌におけるゲノム縮退の起因となる要因を識別するために50以上のブラタバクテリウムゲノムについて配列決定ならびにアノテーションを行った。ブラタバクテリウムにおけるゲノム縮小の主要因が突然変異率(の増加)であったことを見出した。遺伝子欠損を駆動するその他の要因としては、選択圧の緩和および代謝機能的に関連した遺伝子群が欠損するドミノ効果が含まれる。集団ボトルネックによる遺伝的浮動については遺伝子欠損と相関がなく、ブラタバクテリウムのゲノム縮小におけるマラーのラチェット役割は有意ではないことが示唆された。ゆえに本研究は昆虫内部共生細菌の縮小ゲノム進化に対する我々の理解を深めるものである。

研究成果の学術的意義や社会的意義

We already published one paper in Genome Biology and Evolution (IF: 3.73). For another paper, we resubmitted a revised version that addressed the comments of the reviewers and is now under reevaluation for publication in Current Biology (IF: 9.19). I expect one last paper to be submitted this year.

報告書

(3件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Evolutionary rates are correlated between cockroach symbiont and mitochondrial genomes2019

    • 著者名/発表者名
      Arab Daej A.、Bourguignon Thomas、Wang Zongqing、Ho Simon Y. W.、Lo Nathan
    • 雑誌名

      biorxiv

      巻: NA

    • DOI

      10.1101/542241

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Parallel and Gradual Genome Erosion in the Blattabacterium Endosymbionts of Mastotermes darwiniensis and Cryptocercus Wood Roaches2018

    • 著者名/発表者名
      Kinjo Yukihiro、Bourguignon Thomas、Tong Kwei Jun、Kuwahara Hirokazu、Lim Sang Jin、Yoon Kwang Bae、Shigenobu Shuji、Park Yung Chul、Nalepa Christine A、Hongoh Yuichi、Ohkuma Moriya、Lo Nathan、Tokuda Gaku
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 10 号: 6 ページ: 1622-1630

    • DOI

      10.1093/gbe/evy110

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 過去2億3千万年のゴキブリ-ブラタバクテリウムのゲノム浸食2018

    • 著者名/発表者名
      Thomas Bourguignon
    • 学会等名
      Entomological Society of Japan
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2021-02-19  

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