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非コードRNAを含有する新規核内構造体による熱ストレス応答遺伝子の発現機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K14899
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分47030:薬系衛生および生物化学関連
研究機関東京大学

研究代表者

小野口 玲菜 (水谷玲菜)  東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (30780697)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2019年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード熱ストレス応答 / 核内構造体 / 長鎖非コードRNA / 非コードRNA
研究成果の概要

申請者はこれまでに「MALAT1非コードRNAが、熱ストレスに応答して新規核内構造体(HiNoCo bodyと命名)を形成する」という新しい現象を見出していた。本研究ではMALAT1/HiNoCo bodyが熱応答性遺伝子発現制御に寄与するかの検証実験を行った。その結果、熱ストレス時にMALAT1依存的に発現変動する遺伝子群及びオープンクロマチン領域を同定した。さらに、非ストレス時と熱ストレス時でMALAT1が相互作用するゲノムDNA領域が異なることも見出した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究により、MALAT1非コードRNAが熱ストレスに応答して局在変化することで、通常時と熱ストレス時では異なる遺伝子発現の制御に関与することが示唆された。本研究は「非コードRNAの局在変化を基盤とした熱応答性遺伝子の発現制御」という新しい熱ストレス応答機構の発見につながる、先駆的な事例となることが期待される。

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Long noncoding RNA and phase separation in cellular stress response2022

    • 著者名/発表者名
      Onoguchi-Mizutani Rena、Akimitsu Nobuyoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 171 号: 3 ページ: 269-276

    • DOI

      10.1093/jb/mvab156

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Identification of heat-inducible long noncoding RNA MALAT1 -containing novel nuclear (HiNoCo) body2021

    • 著者名/発表者名
      Rena Onoguchi-Mizutani, Yoshitaka Kirikae, Yoko Ogura, Tony Gutschner, Sven Diederichs, Nobuyoshi Akimitsu
    • 雑誌名

      The journal of Cell Science

      巻: -

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of novel heat shock-induced long non-coding RNA in human cells2020

    • 著者名/発表者名
      Onoguchi-Mizutani Rena、Kishi Yoshihiro、Ogura Yoko、Nishimura Yuuki、Imamachi Naoto、Suzuki Yutaka、Miyazaki Satoru、Akimitsu Nobuyoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 4 ページ: 497-505

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa126

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of Minimal p53 Promoter Region Regulated by MALAT1 in Human Lung Adenocarcinoma Cells.2018

    • 著者名/発表者名
      Tano K, Onoguchi-Mizutani R, Yeasmin F, Uchiumi F, Suzuki Y, Yada T, Akimitsu N
    • 雑誌名

      frontiers in Genetics

      巻: なし ページ: 208-208

    • DOI

      10.3389/fgene.2017.00208

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Diminished nuclear RNA decay upon Salmonella infection upregulates antibacterial noncoding RNAs2018

    • 著者名/発表者名
      Imamura Katsutoshi、Takaya Akiko、Ishida Yo‐ichi、Fukuoka Yayoi、Taya Toshiki、Nakaki Ryo、Kakeda Miho、Imamachi Naoto、Sato Aiko、Yamada Toshimichi、Onoguchi‐Mizutani Rena、Akizuki Gen、Tanu Tanzina、Tao Kazuyuki、Miyao Sotaro、Suzuki Yutaka、Nagahama Masami、Yamamoto Tomoko、Jensen Torben Heick、Akimitsu Nobuyoshi
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 37 号: 13

    • DOI

      10.15252/embj.201797723

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 非コードRNAを含有する熱ストレス応答性の新規核内構造体, HiNoCo-bodyの同定2021

    • 著者名/発表者名
      小野口玲菜、秋光信佳
    • 学会等名
      日本薬学会第141年会(広島)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Characterization of heat-responsible novel nuclear body containing MALAT1, a long noncoding RNA2019

    • 著者名/発表者名
      Rena Onoguchi-Mizutani, Takeshi Kawamura, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi, Akimitsu.
    • 学会等名
      RNA Control & Regulation -84th Cold Spring Harbor Laboratory Symposium-
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 長鎖非コードRNAを含有する新規核内構造体, HiNoCo-bodyを介した熱ショック応答機構の解析2018

    • 著者名/発表者名
      小野口(水谷) 玲菜、鈴木 穣、川村猛、秋光信佳
    • 学会等名
      第20回日本RNA学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Characterization of heat-responsible novel nuclear body containing MALAT12018

    • 著者名/発表者名
      Rena Onoguchi-Mizutani
    • 学会等名
      第25回Tokyo RNA Club
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2024-12-25  

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