大腸腫瘍における体細胞染色体コピー数変化の網羅的解析

• 研究課題/領域番号: 18K15088
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分49020:人体病理学関連
• 研究機関: 岩手医科大学
• 研究代表者: 永塚 真 岩手医科大学, 医学部, 任期付助教 (90815937)
• 研究期間 (年度): 2018-04-01 – 2021-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2020年度)
• 配分額: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2020年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円); 2019年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円); 2018年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: 大腸腫瘍 / 体細胞コピー数変化 / copy number alteration / 体細胞染色体コピー数変化 / 腺管分離法

研究成果の概要

大腸腫瘍におけるゲノム, エピゲノム変化を解析し, 体細胞コピー数変化 (somatic copynumber alteration, SCNA)との関連について検討した.大腸腺腫, 粘膜内癌, 固有筋層浸潤癌について腺管分離法により腫瘍腺管を採取しそのSCNA解析結果について階層的クラスター解析を行った.CNAの頻度から3つのsubgroupに分類された. subgroup1 (SB1)は多くのCNAに特徴付けられSB3では CNAは少なく, SB2は中間的であった. CNA異常領域ではSB1は2,3に比してSB2は3に比してgain, overallで有意に長かった.

研究成果の学術的意義や社会的意義

大腸腫瘍（腺腫、粘膜内癌、固有筋層浸潤癌）における体細胞コピー数変化 (somatic copy number alteration, SCNA)を解析し、その結果を階層的クラスター解析を行うことで恣意性なくSCNAの発現パターンを比較検討し、癌の浸潤の際には多くのSCNAの蓄積が重要な役割を担うことを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Comprehensive molecular analysis based on somatic copy number alterations in intramucosal colorectal neoplasias and early invasive colorectal cancers. (2018)
  • 著者名/発表者名: Sugai T, Eizuka M, Habano W, Fujita Y, Sato A, Sugimoto R, Otsuka K, Yamamoto E, Matsumoto T, Suzuki H.
  • 雑誌名: Oncotarget. 巻: 9 号: 33 ページ: 22895-22906
  • DOI: 10.18632/oncotarget.25112
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Comprehensive molecular analysis based on somatic copy number alterations in intramucosal colorectal neoplasias and early invasive colorectal cancers. (2018)
  • 著者名/発表者名: 永塚真
  • 学会等名: 日本消化器癌発生学会