大腸腫瘍における体細胞染色体コピー数変化の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号	18K15088
研究種目	若手研究
配分区分	基金
審査区分	小区分49020:人体病理学関連
研究機関	岩手医科大学
研究代表者	永塚真岩手医科大学, 医学部, 任期付助教 (90815937)
研究期間 (年度)	2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス	完了 (2020年度)
配分額 *注記	3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円) 2020年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円) 2019年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円) 2018年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード	大腸腫瘍 / 体細胞コピー数変化 / copy number alteration / 体細胞染色体コピー数変化 / 腺管分離法
研究成果の概要	大腸腫瘍におけるゲノム, エピゲノム変化を解析し, 体細胞コピー数変化 (somatic copynumber alteration, SCNA)との関連について検討した.大腸腺腫, 粘膜内癌, 固有筋層浸潤癌について腺管分離法により腫瘍腺管を採取しそのSCNA解析結果について階層的クラスター解析を行った.CNAの頻度から3つのsubgroupに分類された. subgroup1 (SB1)は多くのCNAに特徴付けられSB3では CNAは少なく, SB2は中間的であった. CNA異常領域ではSB1は2,3に比してSB2は3に比してgain, overallで有意に長かった.
研究成果の学術的意義や社会的意義	大腸腫瘍（腺腫、粘膜内癌、固有筋層浸潤癌）における体細胞コピー数変化 (somatic copy number alteration, SCNA)を解析し、その結果を階層的クラスター解析を行うことで恣意性なくSCNAの発現パターンを比較検討し、癌の浸潤の際には多くのSCNAの蓄積が重要な役割を担うことを明らかにした。