• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

シングルセル遺伝子発現解析による多段階白血病発症機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K15121
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分49030:実験病理学関連
研究機関京都大学

研究代表者

坂本 智子  京都大学, 医学研究科, 研究員 (70648427)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2018年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード遺伝子発現解析 / メチル化解析 / シングルセル解析 / ダウン症候群 / 白血病 / メチル化アレイ / ダウン症 / 前白血病芽球 / 急性巨核芽球性白血病 / シングルセルRNA-seq / エピゲノム
研究成果の概要

急性巨核芽球性白血病 (AMKL, acute megakaryoblastic leukemia)の発症に関わる分子機序を明らかにすることを目的に、転写制御機構であるDNAメチル化プロファイルの解析を行った。正常血液前駆細胞とAMKLの比較では、AMKLに特異的なDNAメチル化状態は、赤芽球や巨核球の前駆細胞が持つ特徴的なプロファイルであった。ヒトiPS細胞から分化誘導された血液系譜細胞のシングルセルRNAシークエンシング(scRNA-seq)では分化過程の軌跡を描くことに成功した一方、白血病細胞のscRNA-seqは十分なクオリティが得られなかった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

遺伝子変異の蓄積が白血病をはじめとするがんの多段階発症に関与することが知られている。本研究では、遺伝子発現解析およびメチル化解析の両方から、正常の血球前駆細胞(HSC, MPP, CLP, CMP, GMP, MEP)、TAM、DS-AMKL由来細胞の特徴や違いを捉え、TAM, AMKL細胞の起源細胞の推定を行った。本研究により、TAM、AMKLにおける多段階白血病発症機構のさらなる理解が進むものと考えられる。

報告書

(3件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (6件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] 日常化するシングルセル遺伝子発現解析が展開する医学研究2019

    • 著者名/発表者名
      坂本智子, 渡辺亮
    • 雑誌名

      遺伝子医学

      巻: 30号 ページ: 116-121

    • NAID

      40022087132

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] 細胞運命決定機構を明らかにするシングルセル遺伝子発現解析2019

    • 著者名/発表者名
      坂本 智子, 前 伸一, 長船 健二, 岡田 千尋, 樺井 良太朗, 渡辺 亮
    • 雑誌名

      日本薬理学雑誌

      巻: 153 号: 2 ページ: 61-66

    • DOI

      10.1254/fpj.153.61

    • NAID

      130007595895

    • ISSN
      0015-5691, 1347-8397
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] シングルセルゲノミクスによる細胞個性の解析が展開する免疫学研究2019

    • 著者名/発表者名
      坂本智子, 渡辺亮
    • 雑誌名

      臨床免疫・アレルギー科

      巻: 第71巻第4号 ページ: 448-454

    • NAID

      40021866266

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] 単細胞レベルでの膵内分泌細胞の不均一性と機能解明2019

    • 著者名/発表者名
      龍岡久登,坂本智子,渡辺 亮,稲垣暢也
    • 雑誌名

      実験医学増刊「シングルセルゲノミクス」

      巻: Vol.37 No.20 ページ: 3392-3396

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] シングルセルゲノミクスによる細胞個性の解析が展開する免疫学研究.2019

    • 著者名/発表者名
      坂本智子、渡辺亮
    • 雑誌名

      臨床免疫・アレルギー科

      巻: 71 ページ: 448-454

    • NAID

      40021866266

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 細胞運命決定機構を明らかにするシングルセル遺伝子発現解析.2018

    • 著者名/発表者名
      坂本智子、前伸一、長船健二、岡田千尋、樺井良太朗、渡辺亮.
    • 雑誌名

      日本薬理学雑誌

      巻: 153 ページ: 61-66

    • NAID

      130007595895

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] シングルセルゲノミクスが展開する発生学研究2020

    • 著者名/発表者名
      坂本智子
    • 学会等名
      岡山大学次世代研究拠点 シンポジウム2020
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] シングルセル遺伝子発現解析による膵臓の再生メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      坂本 智子
    • 学会等名
      第4回AMEDがん若手研究者ワークショップ
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Difference in genetic and epigenetic regulations between young and old mice explored the mechanism of beta cell proliferation.2019

    • 著者名/発表者名
      Hisato Tatsuoka ,Daisuke Yabe, Satoko Sakamoto, Akira Watanabe, Nobuya Inagaki
    • 学会等名
      International Symposium on Epigenome 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Challenge to Regeneration of Hair Cells in the Cochlea Sensory Epithelia by Single Cell Transcriptomics.2018

    • 著者名/発表者名
      喜多 知子、坂本 智子、松永 麻美、長谷川 晶子、岡田 千尋、中川 隆之、渡辺 亮.
    • 学会等名
      第41回 分子生物学会 年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 膵臓の再生を明らかにするシングルセル遺伝子発現解析.2018

    • 著者名/発表者名
      坂本 智子、龍岡 久登、矢部 大介、稲垣 暢也、渡辺 亮.
    • 学会等名
      第41回 分子生物学会 年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi