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大規模ゲノム解析によるセラチアマルセスセンスの病原性および薬剤耐性獲得機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K16175
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分54030:感染症内科学関連
研究機関九州大学

研究代表者

小野 友行  九州大学, 大学病院, 医員 (80725721)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円)
2020年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円)
2019年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2018年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワードSerratia marcescens / セラチアマルセスセンス / Serratia complex / 大規模ゲノム解析 / 病原遺伝子 / 薬剤耐性 / 薬剤耐性遺伝子
研究成果の概要

Serratia marcescensは腸内細菌科に属するグラム陰性桿菌である。近年基礎疾患を有する易感染性の患者や周術期の免疫力低下患者における血流感染などの侵襲性感染症が問題となっており、高度薬剤耐性菌も出現してきている。今回大規模ゲノム系統解析を実施した。本研究からS.marcescensのゲノム多様性が明らかになり、S.marcescensとその近縁種を含めたグループはANIを用いた系統解析から14のクレードに分類されることが判明した。これらの研究結果は近縁種を含めたグループの分類の再構築の際に重要となるゲノムデータとなり、菌の進化などの解明にも有用であると思われる。

研究成果の学術的意義や社会的意義

Serratia marcescensは近年臨床現場で問題となる菌ではあるものの、大規模ゲノム解析はほとんど行われてこなかった。本研究ではデータベースを利用しワールドワイドな大規模ゲノム解析を行った。これらの結果から従来の分類とゲノム解析をもとにした分類では異なった結果になることが示され、さらに薬剤耐性遺伝子を多く持つグループが存在することが判明した。本研究の結果は今後の更なる解析の基礎となるデータとなることが期待される。

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2022 2019 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Global population structure of the Serratia marcescens complex and identification of hospital-adapted lineages in the complex2022

    • 著者名/発表者名
      Ono Tomoyuki、Taniguchi Itsuki、Nakamura Keiji、Nagano Debora Satie、Nishida Ruriko、Gotoh Yasuhiro、Ogura Yoshitoshi、Sato Mitsuhiko P.、Iguchi Atsushi、Murase Kazunori、Yoshimura Dai、Itoh Takehiko、Shima Ayaka、Dubois Damien、Oswald Eric、Shiose Akira、Gotoh Naomasa、Hayashi Tetsuya
    • 雑誌名

      Microbial Genomics

      巻: 8 号: 3

    • DOI

      10.1099/mgen.0.000793

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Serratia marcescensのゲノム解析に基づいた大規模系統解析2019

    • 著者名/発表者名
      小野友行、小椋義俊、佐藤光彦、中村佳司、後藤恭宏、西田留梨子、井口 純、後藤直正、伊藤武彦、塩瀬明、林哲也
    • 学会等名
      第13回ゲノム微生物学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Serratia marcescens の大規模比較ゲノム解析2019

    • 著者名/発表者名
      小野友行,中村佳司,後藤恭宏,佐藤光彦,西田留梨子,井口純,後藤直正,伊藤武彦,塩瀬明,小椋義俊
    • 学会等名
      第92回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 大規模ゲノム解析によるSerratia marcescenceの病原性および薬剤耐性獲得機構の解析2018

    • 著者名/発表者名
      小野友行
    • 学会等名
      第 71 回 日本細菌学会九州支部総会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

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